Protein–RNA interactions for Protein: O75145

PPFIA3, Liprin-alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPFIA3O75145 SEPT7P9-202ENST00000489259 743 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PPFIA3O75145 KRT18P25-201ENST00000508931 1278 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
PPFIA3O75145 TMEM161B-AS1-212ENST00000513011 833 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PPFIA3O75145 ACRV1-202ENST00000527795 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PPFIA3O75145 SLC25A47P1-201ENST00000531577 414 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
PPFIA3O75145 TMEM117-207ENST00000551577 2643 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PPFIA3O75145 ESRRB-207ENST00000556177 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PPFIA3O75145 C14orf178-204ENST00000557011 474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PPFIA3O75145 AC009486.1-201ENST00000569860 813 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
PPFIA3O75145 AP001005.4-201ENST00000572530 387 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PPFIA3O75145 COX6B1-204ENST00000592141 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PPFIA3O75145 AC017083.2-201ENST00000608069 979 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
PPFIA3O75145 GRIK5-201ENST00000262895 3493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PPFIA3O75145 FAM189A2-201ENST00000257515 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PPFIA3O75145 DNAJC21-202ENST00000382021 6208 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PPFIA3O75145 FAM120A-202ENST00000375389 3585 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PPFIA3O75145 AL138709.1-201ENST00000614840 1693 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
PPFIA3O75145 MAX-205ENST00000358664 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PPFIA3O75145 PPP2R1B-203ENST00000393055 1525 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PPFIA3O75145 WSCD1-202ENST00000539421 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PPFIA3O75145 CUL3-202ENST00000344951 6592 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PPFIA3O75145 SLC41A1-201ENST00000367137 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PPFIA3O75145 CCNDBP1-201ENST00000300213 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PPFIA3O75145 FRMD8-202ENST00000355991 3514 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PPFIA3O75145 USP47-207ENST00000527733 4525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PPFIA3O75145 GSTCD-206ENST00000507281 2091 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PPFIA3O75145 LHX6-207ENST00000541397 2942 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PPFIA3O75145 NOC2L-201ENST00000327044 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PPFIA3O75145 NLGN4X-203ENST00000381093 5865 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PPFIA3O75145 C5orf66-206ENST00000624272 2479 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PPFIA3O75145 NR1H3-211ENST00000441012 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PPFIA3O75145 ZNF79-202ENST00000543471 2194 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PPFIA3O75145 ZNF79-203ENST00000612342 2192 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PPFIA3O75145 PSIP1-204ENST00000380738 3364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PPFIA3O75145 STAG3L2-201ENST00000426587 2130 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PPFIA3O75145 ITPKB-201ENST00000272117 5822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PPFIA3O75145 RIC1-201ENST00000251879 4127 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PPFIA3O75145 VWA5B2-202ENST00000426955 4120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PPFIA3O75145 SRPX-206ENST00000544439 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PPFIA3O75145 ERC1-219ENST00000546231 4390 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PPFIA3O75145 SLCO5A1-201ENST00000260126 9076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PPFIA3O75145 AL645941.1-201ENST00000415875 338 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PPFIA3O75145 AL357497.1-201ENST00000436249 666 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PPFIA3O75145 HCST-202ENST00000437550 445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PPFIA3O75145 FDPS-203ENST00000447866 1256 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PPFIA3O75145 AC011495.1-201ENST00000498085 584 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
PPFIA3O75145 GNLY-210ENST00000524600 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PPFIA3O75145 AAMDC-206ENST00000526415 579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PPFIA3O75145 FUZ-207ENST00000526575 482 ntTSL 4 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PPFIA3O75145 ZSCAN30-208ENST00000592278 731 ntTSL 4 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PPFIA3O75145 AC233723.1-201ENST00000635921 386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PPFIA3O75145 KIAA1191-201ENST00000298569 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PPFIA3O75145 GRK6-211ENST00000528793 2571 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PPFIA3O75145 MICB-201ENST00000252229 2446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PPFIA3O75145 DHPS-201ENST00000210060 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PPFIA3O75145 AC018665.1-201ENST00000622927 1362 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
PPFIA3O75145 DACH1-204ENST00000620444 4627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PPFIA3O75145 HCRTR1-202ENST00000373706 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PPFIA3O75145 PAK1-201ENST00000278568 2543 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PPFIA3O75145 PLAGL1-201ENST00000354765 3663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PPFIA3O75145 FYCO1-205ENST00000535325 8578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PPFIA3O75145 DAB2IP-201ENST00000259371 5469 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PPFIA3O75145 BCAR3-210ENST00000539242 2114 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PPFIA3O75145 ABCG1-201ENST00000343687 3037 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PPFIA3O75145 TAF5-201ENST00000369839 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PPFIA3O75145 PLEKHB2-207ENST00000438882 1460 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PPFIA3O75145 CRELD1-203ENST00000397170 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PPFIA3O75145 CHFR-204ENST00000443047 2990 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PPFIA3O75145 PAK2-201ENST00000327134 6139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PPFIA3O75145 CLEC16A-203ENST00000409790 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PPFIA3O75145 PSMD13-203ENST00000431206 1591 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PPFIA3O75145 REEP3-201ENST00000373758 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PPFIA3O75145 C9orf47-201ENST00000334490 4829 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PPFIA3O75145 SHTN1-204ENST00000392903 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PPFIA3O75145 CDKL3-206ENST00000521118 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PPFIA3O75145 LARP4-219ENST00000614335 1949 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PPFIA3O75145 CCT4-201ENST00000394440 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PPFIA3O75145 RIMS1-214ENST00000518273 4116 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PPFIA3O75145 AC025171.1-202ENST00000499871 2271 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PPFIA3O75145 RUFY1-204ENST00000437570 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PPFIA3O75145 TMEM40-204ENST00000435218 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PPFIA3O75145 CLASP2-203ENST00000359576 7141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PPFIA3O75145 SEMA3F-202ENST00000413852 3212 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PPFIA3O75145 NPY-201ENST00000242152 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PPFIA3O75145 UBE2G2-201ENST00000330942 721 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PPFIA3O75145 PTPA-213ENST00000419582 952 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PPFIA3O75145 AC007389.4-201ENST00000454674 793 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
PPFIA3O75145 AC007611.1-201ENST00000568150 826 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PPFIA3O75145 RAMP2-202ENST00000587142 549 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PPFIA3O75145 RAMP2-203ENST00000588576 573 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PPFIA3O75145 ELOF1-206ENST00000590700 585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PPFIA3O75145 ECM1P1-201ENST00000604092 1279 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
PPFIA3O75145 SPATA21-206ENST00000612240 603 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PPFIA3O75145 MALAT1-211ENST00000617791 394 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PPFIA3O75145 TP73-213ENST00000604479 1623 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PPFIA3O75145 NPHP4-201ENST00000378156 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PPFIA3O75145 FAM172A-204ENST00000505869 1387 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PPFIA3O75145 KDM5C-205ENST00000404049 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PPFIA3O75145 KRT20-201ENST00000167588 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PPFIA3O75145 CCDC127-201ENST00000296824 9342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.6 ms