Protein–RNA interactions for Protein: O43924

PDE6D, Retinal rod rhodopsin-sensitive cGMP 3',5'-cyclic phosphodiesterase subunit delta, humanhuman

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Length 150 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE6DO43924 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
PDE6DO43924 AC007406.4-201ENST00000539568 765 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
PDE6DO43924 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
PDE6DO43924 BCAT2-203ENST00000545387 1272 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
PDE6DO43924 AC125603.3-201ENST00000550742 486 ntTSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
PDE6DO43924 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
PDE6DO43924 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
PDE6DO43924 SAMD11P1-201ENST00000571429 661 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
PDE6DO43924 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
PDE6DO43924 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC11.6□□□□□ -0.55
PDE6DO43924 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
PDE6DO43924 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
PDE6DO43924 MIR6074-201ENST00000612054 107 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
PDE6DO43924 MALAT1-213ENST00000618227 593 ntTSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
PDE6DO43924 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
PDE6DO43924 GNAS-213ENST00000371099 3709 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
PDE6DO43924 GJB4-201ENST00000339480 2840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
PDE6DO43924 CTR9-201ENST00000361367 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
PDE6DO43924 AC012349.1-201ENST00000518662 2643 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
PDE6DO43924 SPATA7-217ENST00000556553 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
PDE6DO43924 ABCB9-203ENST00000346530 3399 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
PDE6DO43924 SDC1-202ENST00000381150 3291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
PDE6DO43924 COL6A1-207ENST00000612273 3251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
PDE6DO43924 PRKAR1A-203ENST00000392711 4327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
PDE6DO43924 YWHAE-208ENST00000571732 1818 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
PDE6DO43924 PTPRVP-205ENST00000641549 5067 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
PDE6DO43924 ALDH7A1-201ENST00000409134 4964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
PDE6DO43924 POLRMT-202ENST00000588649 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
PDE6DO43924 OIT3-202ENST00000622652 1602 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
PDE6DO43924 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
PDE6DO43924 TMEM25-204ENST00000359862 2395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
PDE6DO43924 APBB2-211ENST00000506352 3316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
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PDE6DO43924 OSBPL1A-201ENST00000319481 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
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PDE6DO43924 GRIN1-204ENST00000371553 3751 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
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PDE6DO43924 FOXM1-203ENST00000361953 3370 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
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PDE6DO43924 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
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