Protein–RNA interactions for Protein: O43852

CALU, Calumenin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 315 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALUO43852 AC233724.13-201ENST00000598383 410 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
CALUO43852 AL022328.1-201ENST00000610050 478 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
CALUO43852 HIST1H2AB-201ENST00000615868 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CALUO43852 C9orf50-202ENST00000619117 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CALUO43852 SRP9-204ENST00000619790 377 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CALUO43852 AC044839.1-204ENST00000634777 1058 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CALUO43852 AL160035.1-201ENST00000637583 576 ntTSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CALUO43852 DLX6-202ENST00000518156 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CALUO43852 KCNT1-208ENST00000488444 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CALUO43852 UBE3A-207ENST00000614096 8741 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CALUO43852 HACD3-202ENST00000442729 1332 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CALUO43852 HTR3A-205ENST00000504030 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CALUO43852 HNRNPUL1-201ENST00000263367 2952 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CALUO43852 PPP6R1-203ENST00000587283 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CALUO43852 GPD1L-201ENST00000282541 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CALUO43852 ALDH4A1-205ENST00000538309 1940 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CALUO43852 LDHAL6B-201ENST00000307144 1693 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CALUO43852 AMOTL2-201ENST00000249883 4488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CALUO43852 PCK2-203ENST00000545054 2505 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CALUO43852 LINC00839-202ENST00000429940 2253 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CALUO43852 AIFM2-202ENST00000373248 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CALUO43852 TCAF1-205ENST00000479870 5733 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CALUO43852 POLR2E-211ENST00000612655 1749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CALUO43852 SLC2A13-201ENST00000280871 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CALUO43852 ZFYVE28-201ENST00000290974 4131 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CALUO43852 CLIC5-208ENST00000544153 2051 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CALUO43852 AC007603.1-201ENST00000563124 2085 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CALUO43852 SPRY4-202ENST00000434127 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CALUO43852 PPP1CB-203ENST00000395366 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CALUO43852 SYBU-208ENST00000440310 3072 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CALUO43852 TGM6-202ENST00000381423 2158 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CALUO43852 ZBED1-201ENST00000381218 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CALUO43852 SETD1B-203ENST00000604567 5969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CALUO43852 LINC02273-201ENST00000499452 1592 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CALUO43852 NDUFB7-201ENST00000215565 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CALUO43852 C12orf10-201ENST00000267103 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CALUO43852 ADIRF-201ENST00000372013 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CALUO43852 AC092933.1-201ENST00000393644 945 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
CALUO43852 TPM1-207ENST00000403994 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CALUO43852 LINC01759-201ENST00000412639 985 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CALUO43852 RPSAP31-202ENST00000445165 716 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CALUO43852 AP000552.1-208ENST00000452952 576 ntTSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CALUO43852 AAMDC-206ENST00000526415 579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CALUO43852 TSPAN11-204ENST00000546076 1058 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CALUO43852 SPATA8-AS1-201ENST00000558722 465 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CALUO43852 AC132938.2-201ENST00000579188 680 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
CALUO43852 C17orf62-239ENST00000585080 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CALUO43852 AC244517.11-204ENST00000624424 760 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CALUO43852 LINC01759-203ENST00000635271 888 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CALUO43852 AL591163.1-201ENST00000641757 987 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
CALUO43852 CYTH3-201ENST00000350796 4505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CALUO43852 CYTH3-202ENST00000396741 4508 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CALUO43852 TNFAIP8L3-201ENST00000327536 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CALUO43852 ZNF219-203ENST00000451119 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CALUO43852 NMUR1-201ENST00000305141 3298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CALUO43852 SLC5A10-202ENST00000395643 1982 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CALUO43852 GTF2H2C-210ENST00000510979 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CALUO43852 LINC01864-201ENST00000587218 1661 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CALUO43852 MAGEA2-204ENST00000611674 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CALUO43852 VIPAS39-202ENST00000343765 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CALUO43852 FECH-201ENST00000262093 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CALUO43852 PLEKHN1-202ENST00000379409 2455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CALUO43852 ECHDC1-220ENST00000528402 1449 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CALUO43852 PFKFB4-201ENST00000232375 3586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CALUO43852 NFE2L2-201ENST00000397062 2853 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CALUO43852 AL121757.1-201ENST00000430097 1836 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CALUO43852 LINC00665-203ENST00000438368 1863 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CALUO43852 AL590132.1-202ENST00000638983 4184 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CALUO43852 RPS23-201ENST00000296674 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CALUO43852 NFIX-208ENST00000587260 1537 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CALUO43852 RUBCNL-212ENST00000631139 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CALUO43852 AC139749.1-202ENST00000617529 3139 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
CALUO43852 HSDL1-201ENST00000219439 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CALUO43852 VARS2-211ENST00000541562 3566 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CALUO43852 SLC16A1-207ENST00000538576 4374 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CALUO43852 SUGP2-202ENST00000337018 3640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CALUO43852 GCNT7-201ENST00000243913 2064 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CALUO43852 PDE6D-201ENST00000287600 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CALUO43852 ZBTB12BP-201ENST00000314232 1122 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
CALUO43852 TOMM5-201ENST00000321301 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CALUO43852 AL157832.1-201ENST00000428273 495 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CALUO43852 LIMS3-201ENST00000437679 1220 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CALUO43852 TAF8-206ENST00000472818 719 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CALUO43852 GCOM2-201ENST00000509133 1104 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
CALUO43852 LINC02387-201ENST00000541749 868 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CALUO43852 AC138123.2-203ENST00000552451 653 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CALUO43852 TAF1C-216ENST00000566732 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CALUO43852 BTNL10-201ENST00000595971 695 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
CALUO43852 PDLIM3-213ENST00000629667 1016 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CALUO43852 IQCE-201ENST00000325979 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CALUO43852 LIN9-201ENST00000328205 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CALUO43852 PRICKLE1-201ENST00000345127 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CALUO43852 KMT2E-202ENST00000311117 6874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CALUO43852 CDCA2-201ENST00000330560 3731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CALUO43852 RNF122-201ENST00000256257 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CALUO43852 SELENOS-201ENST00000398226 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CALUO43852 ATL3-203ENST00000538786 1920 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CALUO43852 FAM189A2-201ENST00000257515 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CALUO43852 DMAC2-204ENST00000438807 1454 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CALUO43852 GPBAR1-203ENST00000521462 1465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.1 ms