Protein–RNA interactions for Protein: O43586

PSTPIP1, Proline-serine-threonine phosphatase-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 416 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSTPIP1O43586 KCNC1-201ENST00000265969 4295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PSTPIP1O43586 NBEA-203ENST00000379939 10738 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PSTPIP1O43586 KIAA0368-201ENST00000259335 7391 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PSTPIP1O43586 ACER2-201ENST00000340967 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PSTPIP1O43586 TRIM50-202ENST00000453152 1599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PSTPIP1O43586 HYOU1-218ENST00000614668 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PSTPIP1O43586 PNPLA3-201ENST00000216180 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PSTPIP1O43586 CNN2-201ENST00000263097 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PSTPIP1O43586 CYP4B1-201ENST00000271153 2171 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PSTPIP1O43586 CNN2-205ENST00000562958 2194 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PSTPIP1O43586 CTCFL-210ENST00000481655 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PSTPIP1O43586 PEX26-205ENST00000610387 3924 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PSTPIP1O43586 NAXD-201ENST00000309957 2659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PSTPIP1O43586 CLCN1-201ENST00000343257 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PSTPIP1O43586 PRKD1-202ENST00000415220 3189 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PSTPIP1O43586 PGPEP1-201ENST00000252813 1409 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PSTPIP1O43586 GAL3ST4-202ENST00000411994 1404 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PSTPIP1O43586 ATP6AP2-211ENST00000636196 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PSTPIP1O43586 SIGLEC6-202ENST00000346477 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PSTPIP1O43586 LINC00665-203ENST00000438368 1863 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PSTPIP1O43586 LINC02076-201ENST00000577684 1871 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PSTPIP1O43586 AC090099.1-203ENST00000527059 2945 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PSTPIP1O43586 PUDP-203ENST00000424830 1334 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PSTPIP1O43586 TXNDC5-204ENST00000473453 1301 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PSTPIP1O43586 ZDHHC11-209ENST00000511539 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PSTPIP1O43586 MPZL1-203ENST00000392121 3421 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PSTPIP1O43586 MTA3-203ENST00000406652 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PSTPIP1O43586 JPH1-201ENST00000342232 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PSTPIP1O43586 NID1-201ENST00000264187 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PSTPIP1O43586 APOA1-201ENST00000236850 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PSTPIP1O43586 BANF1-201ENST00000312175 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PSTPIP1O43586 SCGN-201ENST00000334979 704 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PSTPIP1O43586 VAPA-201ENST00000340541 1227 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PSTPIP1O43586 C6orf99-202ENST00000367073 769 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PSTPIP1O43586 APOA1-205ENST00000375329 927 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PSTPIP1O43586 LINC02158-201ENST00000432377 897 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PSTPIP1O43586 AC245100.3-201ENST00000441281 285 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
PSTPIP1O43586 CCDC159-201ENST00000458408 1062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PSTPIP1O43586 LINC01585-201ENST00000500496 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PSTPIP1O43586 CDK4-206ENST00000549606 558 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PSTPIP1O43586 AC129507.3-201ENST00000571512 913 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PSTPIP1O43586 MICAL3-206ENST00000441493 9445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PSTPIP1O43586 NACC2-201ENST00000277554 6899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PSTPIP1O43586 KCNMA1-262ENST00000639489 4302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PSTPIP1O43586 CASC2-203ENST00000435944 3270 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PSTPIP1O43586 MSTO1-202ENST00000368341 2245 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PSTPIP1O43586 C1R-201ENST00000535233 2211 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PSTPIP1O43586 RFTN1-203ENST00000432519 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PSTPIP1O43586 FOXD4L5-201ENST00000377420 3109 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PSTPIP1O43586 CASP2-207ENST00000619992 4006 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PSTPIP1O43586 MAGEB2-201ENST00000378988 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PSTPIP1O43586 C20orf202-201ENST00000400633 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PSTPIP1O43586 AC008894.2-201ENST00000597983 2987 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PSTPIP1O43586 NKIRAS2-201ENST00000307641 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PSTPIP1O43586 AC005840.4-201ENST00000541242 2494 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
PSTPIP1O43586 RIMS3-202ENST00000372684 7235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PSTPIP1O43586 SIGLECL1-208ENST00000614422 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PSTPIP1O43586 ELFN2-207ENST00000613079 8360 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PSTPIP1O43586 BAIAP2-201ENST00000321280 1939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PSTPIP1O43586 OS9-207ENST00000439210 1946 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PSTPIP1O43586 CUX1-215ENST00000556210 4044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PSTPIP1O43586 AC020910.6-201ENST00000623084 1459 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
PSTPIP1O43586 ZNF133-203ENST00000377671 2701 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PSTPIP1O43586 NAA60-202ENST00000407558 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PSTPIP1O43586 NUP50-201ENST00000347635 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PSTPIP1O43586 SPATS2L-209ENST00000409988 2698 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PSTPIP1O43586 TSPAN18-207ENST00000520358 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PSTPIP1O43586 OGDH-204ENST00000443864 1744 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PSTPIP1O43586 TSPAN11-201ENST00000261177 5505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PSTPIP1O43586 PDGFA-201ENST00000354513 1308 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PSTPIP1O43586 ABCC9-203ENST00000326684 1693 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PSTPIP1O43586 SDHAF2-201ENST00000301761 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PSTPIP1O43586 IGSF1-204ENST00000370903 4594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PSTPIP1O43586 NDUFA2-201ENST00000252102 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PSTPIP1O43586 RAB41-201ENST00000276066 1071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PSTPIP1O43586 SCAND1-201ENST00000305978 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PSTPIP1O43586 PHLDA2-201ENST00000314222 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PSTPIP1O43586 RAB41-202ENST00000374473 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PSTPIP1O43586 XAGE1A-203ENST00000375602 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PSTPIP1O43586 XAGE1B-203ENST00000375616 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PSTPIP1O43586 ADAMTSL1-208ENST00000380570 931 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PSTPIP1O43586 RAC2-203ENST00000405484 842 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PSTPIP1O43586 MESTP3-201ENST00000503460 968 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
PSTPIP1O43586 SBSN-202ENST00000518157 957 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PSTPIP1O43586 HCFC1R1-203ENST00000572355 610 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PSTPIP1O43586 AC140912.1-201ENST00000577171 1054 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
PSTPIP1O43586 ZNF180-204ENST00000586637 1023 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PSTPIP1O43586 LINC02560-201ENST00000596379 459 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
PSTPIP1O43586 AC233723.1-201ENST00000635921 386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PSTPIP1O43586 ILDR1-205ENST00000462014 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PSTPIP1O43586 AC015688.4-201ENST00000580780 1647 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
PSTPIP1O43586 SLC40A1-201ENST00000261024 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PSTPIP1O43586 CSAD-203ENST00000379846 1962 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
PSTPIP1O43586 CMBL-201ENST00000296658 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PSTPIP1O43586 SLC4A8-204ENST00000514353 3041 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PSTPIP1O43586 TNN-203ENST00000622870 3719 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
PSTPIP1O43586 MST1P2-201ENST00000457982 2291 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
PSTPIP1O43586 FAM186B-201ENST00000257894 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PSTPIP1O43586 NFATC4-206ENST00000539237 5686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PSTPIP1O43586 ZNF664-202ENST00000392404 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.7 ms