Protein–RNA interactions for Protein: O43189

PHF1, PHD finger protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 567 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHF1O43189 WSB2-202ENST00000441406 1353 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
PHF1O43189 PSMC3-212ENST00000602866 1373 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
PHF1O43189 AC007326.5-201ENST00000640084 1382 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
PHF1O43189 BOLA3-201ENST00000295326 444 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
PHF1O43189 KCNK7-201ENST00000340313 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
PHF1O43189 SPAG11B-203ENST00000359758 612 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
PHF1O43189 UROS-203ENST00000368786 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
PHF1O43189 KRTAP10-2-201ENST00000391621 1149 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
PHF1O43189 AL162742.1-201ENST00000434792 954 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
PHF1O43189 FO681548.1-201ENST00000455617 1132 ntBASIC13□□□□□ -0.33
PHF1O43189 AC007551.1-201ENST00000457394 519 ntBASIC13□□□□□ -0.33
PHF1O43189 LINC01248-201ENST00000458264 468 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
PHF1O43189 DUSP13-205ENST00000464872 684 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
PHF1O43189 AJ271736.1-201ENST00000483543 773 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
PHF1O43189 AC018653.3-202ENST00000538062 735 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
PHF1O43189 LINC02279-201ENST00000553435 737 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
PHF1O43189 BX927359.1-201ENST00000556073 543 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
PHF1O43189 DERL2-202ENST00000570848 657 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
PHF1O43189 AC024619.2-201ENST00000581964 517 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
PHF1O43189 TMEM101-204ENST00000587529 965 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
PHF1O43189 AL022328.1-201ENST00000610050 478 ntBASIC13□□□□□ -0.33
PHF1O43189 NDUFS7-219ENST00000620479 754 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
PHF1O43189 AC247036.4-201ENST00000632099 353 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
PHF1O43189 CDCA2-201ENST00000330560 3731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
PHF1O43189 PAPOLA-223ENST00000557320 3264 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
PHF1O43189 OPCML-IT1-201ENST00000533859 2936 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
PHF1O43189 FSIP1-201ENST00000350221 2805 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
PHF1O43189 TMCC2-202ENST00000330675 2780 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
PHF1O43189 DESI2-202ENST00000302550 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
PHF1O43189 CNOT9-201ENST00000273064 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
PHF1O43189 PPP4R4-201ENST00000304338 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
PHF1O43189 ZBTB7B-207ENST00000535420 3777 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
PHF1O43189 PLEKHO2-201ENST00000323544 3720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
PHF1O43189 PTGES3L-AARSD1-204ENST00000421990 2150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
PHF1O43189 TGIF2-202ENST00000373874 3432 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
PHF1O43189 MLKL-201ENST00000306247 1781 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
PHF1O43189 TBP-207ENST00000616883 1750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
PHF1O43189 TRMT2B-201ENST00000372935 2921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
PHF1O43189 EIF3J-AS1-201ENST00000313807 2863 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
PHF1O43189 TMCO3-207ENST00000474393 2843 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
PHF1O43189 MAGEA2-202ENST00000598543 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
PHF1O43189 ATP6V1C2-201ENST00000272238 1565 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
PHF1O43189 AL121723.1-201ENST00000445194 1519 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
PHF1O43189 PRF1-201ENST00000373209 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
PHF1O43189 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
PHF1O43189 B4GALT3-213ENST00000622395 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
PHF1O43189 MBD6-201ENST00000355673 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
PHF1O43189 C1orf159-202ENST00000379320 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
PHF1O43189 REC8-209ENST00000611366 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
PHF1O43189 ZC3HAV1-204ENST00000471652 3182 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
PHF1O43189 LRIG3-201ENST00000320743 4070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
PHF1O43189 IRF8-201ENST00000268638 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
PHF1O43189 UPK3A-201ENST00000216211 1051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
PHF1O43189 CARTPT-201ENST00000296777 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
PHF1O43189 GOLIM4-201ENST00000309027 2100 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
PHF1O43189 FAM104B-202ENST00000358460 1179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
PHF1O43189 MRPL55-215ENST00000366742 630 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
PHF1O43189 ZNF165-201ENST00000377325 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
PHF1O43189 EVA1A-203ENST00000410010 696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
PHF1O43189 SLC25A24P2-201ENST00000415059 510 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
PHF1O43189 HTR3E-202ENST00000415389 2139 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
PHF1O43189 KCNQ1-AS1-201ENST00000440887 1084 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
PHF1O43189 AC096536.1-201ENST00000443284 440 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
PHF1O43189 CGB8-201ENST00000448456 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
PHF1O43189 POLR2F-208ENST00000470701 584 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
PHF1O43189 BTNL8-205ENST00000505126 1294 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
PHF1O43189 ZNF7-206ENST00000528130 1134 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
PHF1O43189 GCHFR-206ENST00000561160 572 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
PHF1O43189 CMC2-214ENST00000565925 640 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
PHF1O43189 AC011466.1-201ENST00000595201 566 ntTSL 4 BASIC12.99□□□□□ -0.33
PHF1O43189 RPP40-207ENST00000618533 1056 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
PHF1O43189 SLC38A5-212ENST00000619100 2100 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
PHF1O43189 SLC38A5-214ENST00000622196 2100 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
PHF1O43189 TBC1D3G-201ENST00000569055 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
PHF1O43189 TBC1D3H-201ENST00000610350 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
PHF1O43189 TBC1D3L-202ENST00000617678 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
PHF1O43189 FOXL1-201ENST00000320241 3655 ntAPPRIS P1 BASIC12.99□□□□□ -0.33
PHF1O43189 HSDL1-201ENST00000219439 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
PHF1O43189 APCDD1L-201ENST00000371149 3426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
PHF1O43189 MLLT11-201ENST00000368921 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
PHF1O43189 OR2C3-201ENST00000366487 8467 ntAPPRIS P1 BASIC12.99□□□□□ -0.33
PHF1O43189 AC092384.2-204ENST00000565053 2566 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
PHF1O43189 ARHGEF7-214ENST00000478679 1833 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
PHF1O43189 DENND1B-211ENST00000620048 8378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
PHF1O43189 SCLY-202ENST00000409736 1774 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
PHF1O43189 COMP-201ENST00000222271 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
PHF1O43189 TMCC3-201ENST00000261226 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
PHF1O43189 HTR7-203ENST00000371719 3033 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
PHF1O43189 MUTYH-211ENST00000456914 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
PHF1O43189 AP004608.1-203ENST00000528482 3679 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
PHF1O43189 PRDM4-201ENST00000228437 4210 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
PHF1O43189 CAAP1-206ENST00000625311 1532 ntTSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
PHF1O43189 CACNA2D1-201ENST00000356253 3858 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
PHF1O43189 C20orf166-AS1-203ENST00000475015 2585 ntTSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
PHF1O43189 GRIN2C-201ENST00000293190 4261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
PHF1O43189 TMCO3-202ENST00000434316 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
PHF1O43189 AL355493.2-201ENST00000568270 1395 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
PHF1O43189 SLC35C2-213ENST00000543605 5740 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
PHF1O43189 PSD-209ENST00000611678 3382 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
PHF1O43189 TIE1-201ENST00000372476 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
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