Protein–RNA interactions for Protein: G5E9R7

KRTAP4-16, HCG2042993, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 235 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP4-16G5E9R7 CD81-207ENST00000481687 890 ntTSL 2 BASIC9.19□□□□□ -0.94
KRTAP4-16G5E9R7 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC9.19□□□□□ -0.94
KRTAP4-16G5E9R7 AC104596.2-201ENST00000512793 793 ntBASIC9.19□□□□□ -0.94
KRTAP4-16G5E9R7 ERGIC1-212ENST00000523291 586 ntTSL 2 BASIC9.19□□□□□ -0.94
KRTAP4-16G5E9R7 ZNF7-206ENST00000528130 1134 ntTSL 5 BASIC9.19□□□□□ -0.94
KRTAP4-16G5E9R7 DHRS7C-202ENST00000571134 984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
KRTAP4-16G5E9R7 AJ003147.2-201ENST00000576468 629 ntTSL 3 BASIC9.19□□□□□ -0.94
KRTAP4-16G5E9R7 AC020558.1-201ENST00000583662 425 ntTSL 3 BASIC9.19□□□□□ -0.94
KRTAP4-16G5E9R7 AC093726.1-201ENST00000608064 963 ntBASIC9.19□□□□□ -0.94
KRTAP4-16G5E9R7 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC9.19□□□□□ -0.94
KRTAP4-16G5E9R7 HIST1H2BO-201ENST00000616182 381 ntAPPRIS P1 BASIC9.19□□□□□ -0.94
KRTAP4-16G5E9R7 AC244153.1-202ENST00000617855 482 ntTSL 3 BASIC9.19□□□□□ -0.94
KRTAP4-16G5E9R7 AC005252.2-201ENST00000624630 1141 ntBASIC9.19□□□□□ -0.94
KRTAP4-16G5E9R7 AC008761.3-201ENST00000624803 892 ntBASIC9.19□□□□□ -0.94
KRTAP4-16G5E9R7 CNTNAP3P2-201ENST00000617175 3861 ntBASIC9.19□□□□□ -0.94
KRTAP4-16G5E9R7 ACY3-201ENST00000255082 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
KRTAP4-16G5E9R7 SNRPN-201ENST00000346403 1304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.19□□□□□ -0.94
KRTAP4-16G5E9R7 SNRNP27-202ENST00000409116 1339 ntTSL 5 BASIC9.19□□□□□ -0.94
KRTAP4-16G5E9R7 TUBB8P4-201ENST00000511806 1324 ntBASIC9.19□□□□□ -0.94
KRTAP4-16G5E9R7 SLC25A3-217ENST00000552981 1351 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
KRTAP4-16G5E9R7 PGLYRP2-201ENST00000292609 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
KRTAP4-16G5E9R7 ATP6V0E1-203ENST00000519374 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
KRTAP4-16G5E9R7 FOS-202ENST00000535987 1402 ntTSL 2 BASIC9.19□□□□□ -0.94
KRTAP4-16G5E9R7 MFSD4B-201ENST00000368847 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
KRTAP4-16G5E9R7 FADS1-201ENST00000350997 4525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
KRTAP4-16G5E9R7 FBXO46-201ENST00000317683 3001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.19□□□□□ -0.94
KRTAP4-16G5E9R7 TANGO2-205ENST00000401886 1559 ntTSL 5 BASIC9.19□□□□□ -0.94
KRTAP4-16G5E9R7 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.19□□□□□ -0.94
KRTAP4-16G5E9R7 MLXIPL-201ENST00000313375 3278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
KRTAP4-16G5E9R7 RAF1-201ENST00000251849 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
KRTAP4-16G5E9R7 UBA6-202ENST00000420827 1664 ntTSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
KRTAP4-16G5E9R7 SLC39A6-202ENST00000440549 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
KRTAP4-16G5E9R7 SLC13A5-202ENST00000381074 1738 ntTSL 2 BASIC9.19□□□□□ -0.94
KRTAP4-16G5E9R7 ARMCX6-207ENST00000538627 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.19□□□□□ -0.94
KRTAP4-16G5E9R7 CCP110-201ENST00000381396 5446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
KRTAP4-16G5E9R7 AC073548.1-201ENST00000624088 1882 ntBASIC9.19□□□□□ -0.94
KRTAP4-16G5E9R7 KLHL25-201ENST00000337975 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
KRTAP4-16G5E9R7 SYT5-201ENST00000354308 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
KRTAP4-16G5E9R7 ZNF609-202ENST00000416172 3863 ntTSL 2 BASIC9.19□□□□□ -0.94
KRTAP4-16G5E9R7 HIST2H2BF-201ENST00000369167 1954 ntAPPRIS P1 BASIC9.19□□□□□ -0.94
KRTAP4-16G5E9R7 MEAF6-203ENST00000373074 2005 ntTSL 2 BASIC9.19□□□□□ -0.94
KRTAP4-16G5E9R7 LMNA-213ENST00000473598 2015 ntTSL 2 BASIC9.19□□□□□ -0.94
KRTAP4-16G5E9R7 CBX3-201ENST00000337620 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
KRTAP4-16G5E9R7 C19orf66-202ENST00000397881 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.19□□□□□ -0.94
KRTAP4-16G5E9R7 INTS11-248ENST00000545578 2263 ntTSL 2 BASIC9.19□□□□□ -0.94
KRTAP4-16G5E9R7 POLL-205ENST00000370169 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
KRTAP4-16G5E9R7 GDAP1L1-207ENST00000612599 2585 ntTSL 3 BASIC9.18□□□□□ -0.94
KRTAP4-16G5E9R7 DTD2-201ENST00000310850 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
KRTAP4-16G5E9R7 LINC00882-204ENST00000484698 2718 ntTSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
KRTAP4-16G5E9R7 MLXIPL-206ENST00000434326 3252 ntTSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
KRTAP4-16G5E9R7 MTRF1L-202ENST00000367231 3539 ntTSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
KRTAP4-16G5E9R7 PDPK1-201ENST00000268673 4728 ntTSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
KRTAP4-16G5E9R7 TC2N-201ENST00000340892 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
KRTAP4-16G5E9R7 PHRF1-203ENST00000416188 5227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
KRTAP4-16G5E9R7 OR2I1P-209ENST00000641730 5365 ntBASIC9.18□□□□□ -0.94
KRTAP4-16G5E9R7 LZTS1-202ENST00000381569 5706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.18□□□□□ -0.94
KRTAP4-16G5E9R7 ABCC1-201ENST00000399408 6594 ntTSL 5 BASIC9.18□□□□□ -0.94
KRTAP4-16G5E9R7 ABCC1-202ENST00000399410 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
KRTAP4-16G5E9R7 FIS1-201ENST00000223136 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
KRTAP4-16G5E9R7 APOA1-201ENST00000236850 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
KRTAP4-16G5E9R7 TRAFD1-201ENST00000257604 3178 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC9.18□□□□□ -0.94
KRTAP4-16G5E9R7 GRIK5-201ENST00000262895 3493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
KRTAP4-16G5E9R7 CASP8-202ENST00000264275 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
KRTAP4-16G5E9R7 NPM2-201ENST00000289820 1100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
KRTAP4-16G5E9R7 RPL39L-201ENST00000296277 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
KRTAP4-16G5E9R7 TMEM87A-201ENST00000307216 1598 ntTSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
KRTAP4-16G5E9R7 INTS14-201ENST00000313182 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
KRTAP4-16G5E9R7 EEF1A1-202ENST00000316292 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
KRTAP4-16G5E9R7 RTEL1-201ENST00000318100 4676 ntTSL 2 BASIC9.18□□□□□ -0.94
KRTAP4-16G5E9R7 UNC5A-201ENST00000329542 3812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
KRTAP4-16G5E9R7 GP6-202ENST00000333884 2210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
KRTAP4-16G5E9R7 FCRLB-201ENST00000336830 1193 ntTSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
KRTAP4-16G5E9R7 FAM53B-202ENST00000337318 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
KRTAP4-16G5E9R7 KCNK7-201ENST00000340313 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
KRTAP4-16G5E9R7 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
KRTAP4-16G5E9R7 ANO10-202ENST00000350459 2039 ntTSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
KRTAP4-16G5E9R7 MAGEA4-202ENST00000360243 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
KRTAP4-16G5E9R7 CTRB1-201ENST00000361017 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
KRTAP4-16G5E9R7 ACTA1-202ENST00000366684 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
KRTAP4-16G5E9R7 SEC63-201ENST00000369002 6411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
KRTAP4-16G5E9R7 MAGEA4-203ENST00000370335 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
KRTAP4-16G5E9R7 MAGEA4-204ENST00000370340 1773 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.18□□□□□ -0.94
KRTAP4-16G5E9R7 SPOCK2-202ENST00000373109 5445 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
KRTAP4-16G5E9R7 PFDN6-202ENST00000374607 598 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.18□□□□□ -0.94
KRTAP4-16G5E9R7 PFDN6-203ENST00000374610 521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.18□□□□□ -0.94
KRTAP4-16G5E9R7 APOA1-205ENST00000375329 927 ntTSL 2 BASIC9.18□□□□□ -0.94
KRTAP4-16G5E9R7 SLC4A11-202ENST00000380059 3229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.18□□□□□ -0.94
KRTAP4-16G5E9R7 SYAP1-201ENST00000380155 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
KRTAP4-16G5E9R7 IDH3B-202ENST00000380851 1230 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
KRTAP4-16G5E9R7 NPM2-202ENST00000381530 925 ntTSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
KRTAP4-16G5E9R7 NUTM2A-202ENST00000381707 3290 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
KRTAP4-16G5E9R7 LINC02346-201ENST00000383019 1967 ntTSL 2 BASIC9.18□□□□□ -0.94
KRTAP4-16G5E9R7 LRRFIP1-204ENST00000392000 3365 ntTSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
KRTAP4-16G5E9R7 MIOX-203ENST00000395733 1021 ntTSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
KRTAP4-16G5E9R7 ARPC4-TTLL3-201ENST00000397256 2466 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.18□□□□□ -0.94
KRTAP4-16G5E9R7 TSEN2-202ENST00000402228 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
KRTAP4-16G5E9R7 LRP5L-201ENST00000402785 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
KRTAP4-16G5E9R7 RNASE10-202ENST00000430083 1172 ntTSL 2 BASIC9.18□□□□□ -0.94
KRTAP4-16G5E9R7 CDC25B-205ENST00000439880 3096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
KRTAP4-16G5E9R7 URGCP-206ENST00000446958 365 ntTSL 2 BASIC9.18□□□□□ -0.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.3 ms