Protein–RNA interactions for Protein: B2RUZ4

SMIM1, Small integral membrane protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 78 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM1B2RUZ4 PDLIM2-201ENST00000265810 4592 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
SMIM1B2RUZ4 AC011840.2-201ENST00000563063 1520 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
SMIM1B2RUZ4 GPR68-204ENST00000535815 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
SMIM1B2RUZ4 ZNF77-201ENST00000314531 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
SMIM1B2RUZ4 KIF22-208ENST00000569382 2020 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
SMIM1B2RUZ4 TNK1-207ENST00000576812 3023 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
SMIM1B2RUZ4 PLD2-201ENST00000263088 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
SMIM1B2RUZ4 CES1-203ENST00000422046 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
SMIM1B2RUZ4 SLC4A7-207ENST00000437179 3667 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
SMIM1B2RUZ4 EP400NL-206ENST00000446190 3697 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
SMIM1B2RUZ4 TNFRSF11A-205ENST00000616710 3809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
SMIM1B2RUZ4 NDUFS7-202ENST00000313408 2818 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
SMIM1B2RUZ4 ACSM2A-209ENST00000573854 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
SMIM1B2RUZ4 AGBL3-202ENST00000435976 2495 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
SMIM1B2RUZ4 SHROOM1-208ENST00000617339 3638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
SMIM1B2RUZ4 EHD4-201ENST00000220325 6416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
SMIM1B2RUZ4 THSD4-202ENST00000355327 9200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
SMIM1B2RUZ4 C8orf49-201ENST00000525043 1968 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
SMIM1B2RUZ4 PHF8-202ENST00000338154 6062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
SMIM1B2RUZ4 LINC00221-202ENST00000619530 1499 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
SMIM1B2RUZ4 MAGI1-218ENST00000621418 6225 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
SMIM1B2RUZ4 TSEN2-202ENST00000402228 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
SMIM1B2RUZ4 VTI1B-204ENST00000554659 5351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
SMIM1B2RUZ4 SNPH-201ENST00000381867 5533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
SMIM1B2RUZ4 NOX5-209ENST00000530406 2289 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
SMIM1B2RUZ4 PCDHGA6-202ENST00000610583 5650 ntAPPRIS P1 BASIC10.12□□□□□ -0.79
SMIM1B2RUZ4 ACTR10-201ENST00000254286 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
SMIM1B2RUZ4 LINC00910-206ENST00000592135 2438 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
SMIM1B2RUZ4 KRT32-201ENST00000225899 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
SMIM1B2RUZ4 PSME3-203ENST00000541124 3366 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
SMIM1B2RUZ4 ATP2B3-201ENST00000263519 6420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
SMIM1B2RUZ4 BICDL2-204ENST00000573514 3519 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
SMIM1B2RUZ4 SEZ6-201ENST00000317338 4471 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
SMIM1B2RUZ4 AC068987.4-201ENST00000562343 2094 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
SMIM1B2RUZ4 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
SMIM1B2RUZ4 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
SMIM1B2RUZ4 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC10.12□□□□□ -0.79
SMIM1B2RUZ4 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
SMIM1B2RUZ4 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
SMIM1B2RUZ4 NUDT1-205ENST00000397048 783 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
SMIM1B2RUZ4 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
SMIM1B2RUZ4 GPS2P2-201ENST00000430745 888 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
SMIM1B2RUZ4 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
SMIM1B2RUZ4 VCX3B-204ENST00000453306 868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
SMIM1B2RUZ4 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
SMIM1B2RUZ4 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC10.12□□□□□ -0.79
SMIM1B2RUZ4 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
SMIM1B2RUZ4 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
SMIM1B2RUZ4 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC10.12□□□□□ -0.79
SMIM1B2RUZ4 AC100818.1-201ENST00000524167 563 ntTSL 4 BASIC10.12□□□□□ -0.79
SMIM1B2RUZ4 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
SMIM1B2RUZ4 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
SMIM1B2RUZ4 WASHC3-213ENST00000545679 865 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
SMIM1B2RUZ4 AC087612.1-201ENST00000560238 658 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
SMIM1B2RUZ4 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
SMIM1B2RUZ4 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
SMIM1B2RUZ4 RPS15-202ENST00000585665 467 ntTSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
SMIM1B2RUZ4 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
SMIM1B2RUZ4 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC10.12□□□□□ -0.79
SMIM1B2RUZ4 MIR6080-201ENST00000617359 66 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
SMIM1B2RUZ4 HOTAIRM1_1.1-201ENST00000622675 125 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
SMIM1B2RUZ4 AC247036.4-201ENST00000632099 353 ntAPPRIS P1 BASIC10.12□□□□□ -0.79
SMIM1B2RUZ4 AL512306.2-201ENST00000444037 2219 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
SMIM1B2RUZ4 AP1B1-208ENST00000432560 4146 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
SMIM1B2RUZ4 KRT8P14-201ENST00000414254 1442 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
SMIM1B2RUZ4 TIA1-206ENST00000445587 1440 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
SMIM1B2RUZ4 AL356585.2-201ENST00000625078 2396 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
SMIM1B2RUZ4 HEPACAM-201ENST00000298251 3602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
SMIM1B2RUZ4 NEFH-201ENST00000310624 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
SMIM1B2RUZ4 INSC-208ENST00000530161 1702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
SMIM1B2RUZ4 CETP-203ENST00000566128 1733 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
SMIM1B2RUZ4 FAM13B-201ENST00000033079 5465 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
SMIM1B2RUZ4 GET4-202ENST00000407192 4356 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
SMIM1B2RUZ4 ADAM17-204ENST00000618923 1881 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
SMIM1B2RUZ4 CEP295NL-205ENST00000619342 1866 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
SMIM1B2RUZ4 CHFR-205ENST00000450056 3250 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
SMIM1B2RUZ4 SERPINA4-203ENST00000557004 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
SMIM1B2RUZ4 BEAN1-201ENST00000299694 2160 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
SMIM1B2RUZ4 RPS6KC1-208ENST00000614059 4188 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
SMIM1B2RUZ4 PNPLA6-201ENST00000221249 4617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
SMIM1B2RUZ4 LIPA-202ENST00000336233 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
SMIM1B2RUZ4 RAPGEF3-218ENST00000548919 2776 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
SMIM1B2RUZ4 ZNF362-201ENST00000373428 2936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
SMIM1B2RUZ4 KCNN2-206ENST00000512097 3076 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
SMIM1B2RUZ4 ALDH3A2-226ENST00000631291 3822 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
SMIM1B2RUZ4 FBLIM1-206ENST00000441801 1543 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
SMIM1B2RUZ4 CYP2E1-201ENST00000252945 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
SMIM1B2RUZ4 ACOT9-201ENST00000336430 1675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
SMIM1B2RUZ4 LINC01864-201ENST00000587218 1661 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
SMIM1B2RUZ4 PATL2-201ENST00000434130 1950 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
SMIM1B2RUZ4 MYADML-201ENST00000474610 2147 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
SMIM1B2RUZ4 AC015909.5-201ENST00000624336 2266 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
SMIM1B2RUZ4 DEPTOR-201ENST00000286234 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
SMIM1B2RUZ4 TOLLIP-202ENST00000317204 3617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
SMIM1B2RUZ4 FAM213A-205ENST00000606162 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
SMIM1B2RUZ4 KIFC3-202ENST00000421376 3128 ntTSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
SMIM1B2RUZ4 AC138894.1-201ENST00000635887 2824 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
SMIM1B2RUZ4 RABL2B-202ENST00000395590 2380 ntTSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
SMIM1B2RUZ4 MLF1-201ENST00000355893 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
SMIM1B2RUZ4 CR382287.2-201ENST00000623370 1942 ntTSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.8 ms