Protein–RNA interactions for Protein: A6NMD2

GOLGA8J, Golgin subfamily A member 8J, humanhuman

Predictions only

Length 632 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOLGA8JA6NMD2 AMPD2-218ENST00000528454 2728 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
GOLGA8JA6NMD2 COMP-203ENST00000542601 2707 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
GOLGA8JA6NMD2 POU5F1B-201ENST00000465342 5360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
GOLGA8JA6NMD2 GOLGA8R-201ENST00000327271 1896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
GOLGA8JA6NMD2 INTS11-204ENST00000421495 1868 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
GOLGA8JA6NMD2 NID1-201ENST00000264187 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
GOLGA8JA6NMD2 FGFR1OP2-201ENST00000229395 2924 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
GOLGA8JA6NMD2 C21orf58-204ENST00000397682 2941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
GOLGA8JA6NMD2 RABL2B-202ENST00000395590 2380 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
GOLGA8JA6NMD2 AC097359.2-201ENST00000604992 2389 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
GOLGA8JA6NMD2 AC007292.2-201ENST00000593524 1812 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
GOLGA8JA6NMD2 LDLR-202ENST00000455727 2333 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
GOLGA8JA6NMD2 MAPK7-203ENST00000395602 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
GOLGA8JA6NMD2 ANGPTL8-201ENST00000252453 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
GOLGA8JA6NMD2 LCN9-201ENST00000277526 531 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
GOLGA8JA6NMD2 WDR54-201ENST00000348227 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
GOLGA8JA6NMD2 SNX21-203ENST00000372541 771 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
GOLGA8JA6NMD2 PRAF2-201ENST00000376386 801 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
GOLGA8JA6NMD2 LRRC30-201ENST00000383467 923 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
GOLGA8JA6NMD2 SELENOM-201ENST00000400299 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
GOLGA8JA6NMD2 MASP2-202ENST00000400898 726 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
GOLGA8JA6NMD2 RN7SKP175-201ENST00000408472 289 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
GOLGA8JA6NMD2 AL354761.2-202ENST00000430816 546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
GOLGA8JA6NMD2 CSF2RBP1-201ENST00000447905 391 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
GOLGA8JA6NMD2 KRT223P-202ENST00000449164 1292 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
GOLGA8JA6NMD2 RNF216P1-213ENST00000494947 946 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
GOLGA8JA6NMD2 FLJ27354-203ENST00000526694 851 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
GOLGA8JA6NMD2 CMTM3-212ENST00000566121 572 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
GOLGA8JA6NMD2 ANGPTL8-203ENST00000591200 504 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
GOLGA8JA6NMD2 PAX4-207ENST00000611453 1235 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
GOLGA8JA6NMD2 ANGPTL8-204ENST00000616433 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
GOLGA8JA6NMD2 LCN9-204ENST00000619315 528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
GOLGA8JA6NMD2 COX11-210ENST00000639671 696 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
GOLGA8JA6NMD2 ZNF664-204ENST00000538932 4321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
GOLGA8JA6NMD2 CYB561D2-202ENST00000418577 1533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
GOLGA8JA6NMD2 TPM3-205ENST00000328159 1771 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
GOLGA8JA6NMD2 B4GALNT1-201ENST00000341156 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
GOLGA8JA6NMD2 PHLDB1-223ENST00000600882 5479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
GOLGA8JA6NMD2 ZCCHC17-202ENST00000373714 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
GOLGA8JA6NMD2 RALGAPA1-203ENST00000389698 7864 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
GOLGA8JA6NMD2 TMEM230-201ENST00000202834 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
GOLGA8JA6NMD2 KRT8P4-201ENST00000509735 1454 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
GOLGA8JA6NMD2 PPP3CB-201ENST00000342558 2418 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
GOLGA8JA6NMD2 TBRG4-215ENST00000494076 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
GOLGA8JA6NMD2 TMEM51-204ENST00000428417 1942 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.19
GOLGA8JA6NMD2 RUBCNL-212ENST00000631139 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
GOLGA8JA6NMD2 PML-208ENST00000436891 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
GOLGA8JA6NMD2 MSH5-203ENST00000375750 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GOLGA8JA6NMD2 TNFAIP8L3-201ENST00000327536 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GOLGA8JA6NMD2 FAF1-202ENST00000396153 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GOLGA8JA6NMD2 ELFN2-207ENST00000613079 8360 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GOLGA8JA6NMD2 MAPK7-202ENST00000308406 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GOLGA8JA6NMD2 GAS2L2-203ENST00000618498 2655 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GOLGA8JA6NMD2 AC099850.1-201ENST00000451775 1338 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GOLGA8JA6NMD2 COL17A1-201ENST00000353479 5734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GOLGA8JA6NMD2 ZNF587-203ENST00000423137 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GOLGA8JA6NMD2 C16orf52-202ENST00000542527 4360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GOLGA8JA6NMD2 NFIX-208ENST00000587260 1537 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GOLGA8JA6NMD2 LINC00476-204ENST00000429781 2825 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GOLGA8JA6NMD2 USP10-201ENST00000219473 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GOLGA8JA6NMD2 PRR23C-201ENST00000413199 2791 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GOLGA8JA6NMD2 C11orf52-201ENST00000278601 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GOLGA8JA6NMD2 NOL4L-202ENST00000326071 701 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GOLGA8JA6NMD2 NAA10-201ENST00000370009 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GOLGA8JA6NMD2 NAA10-203ENST00000370015 1002 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GOLGA8JA6NMD2 SHBG-202ENST00000380450 1271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GOLGA8JA6NMD2 STX1A-203ENST00000395155 783 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GOLGA8JA6NMD2 GATD1-203ENST00000397472 790 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GOLGA8JA6NMD2 BUD31-202ENST00000403633 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GOLGA8JA6NMD2 MCFD2-204ENST00000409207 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GOLGA8JA6NMD2 SERF2-209ENST00000409646 559 ntTSL 4 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GOLGA8JA6NMD2 AC017104.1-201ENST00000415129 720 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GOLGA8JA6NMD2 CD8B2-202ENST00000417670 633 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
GOLGA8JA6NMD2 TLE1P1-201ENST00000422965 589 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
GOLGA8JA6NMD2 BNIP3P42-201ENST00000454982 569 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
GOLGA8JA6NMD2 LLPH-AS1-201ENST00000510317 623 ntTSL 4 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GOLGA8JA6NMD2 AP001790.1-201ENST00000511947 570 ntTSL 4 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GOLGA8JA6NMD2 ANAPC15-208ENST00000538393 867 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GOLGA8JA6NMD2 ALPL-207ENST00000540617 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GOLGA8JA6NMD2 MAX-211ENST00000555667 574 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GOLGA8JA6NMD2 MAP1LC3B2-202ENST00000556529 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GOLGA8JA6NMD2 BNIP3P29-201ENST00000598302 571 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
GOLGA8JA6NMD2 MIR6805-201ENST00000615055 62 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
GOLGA8JA6NMD2 AC011447.5-201ENST00000616168 564 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
GOLGA8JA6NMD2 AL160412.1-202ENST00000616819 663 ntTSL 4 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GOLGA8JA6NMD2 LARGE1-201ENST00000354992 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GOLGA8JA6NMD2 NOS2P2-202ENST00000639528 1659 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GOLGA8JA6NMD2 GSTCD-206ENST00000507281 2091 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GOLGA8JA6NMD2 NLRX1-204ENST00000409991 3716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GOLGA8JA6NMD2 SDHAF2-201ENST00000301761 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GOLGA8JA6NMD2 ZNF180-202ENST00000391956 3049 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GOLGA8JA6NMD2 TRAPPC8-210ENST00000582513 3205 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GOLGA8JA6NMD2 TARS2-203ENST00000369054 1998 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GOLGA8JA6NMD2 P2RX5-TAX1BP3-201ENST00000550383 5905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GOLGA8JA6NMD2 CYP1A1-203ENST00000395049 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GOLGA8JA6NMD2 CEP170B-204ENST00000556508 6683 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GOLGA8JA6NMD2 DCUN1D3-201ENST00000324344 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GOLGA8JA6NMD2 SLC35E2B-203ENST00000611123 5948 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
GOLGA8JA6NMD2 FKBP6-201ENST00000252037 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GOLGA8JA6NMD2 KIF17-201ENST00000247986 3969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.4 ms