Protein–RNA interactions for Protein: A6NGG3

C9orf92, Putative uncharacterized protein C9orf92, humanhuman

Predictions only

Length 77 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf92A6NGG3 ATP1A1-AS1-202ENST00000369492 1011 ntTSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
C9orf92A6NGG3 PFDN6-202ENST00000374607 598 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.47□□□□□ -1.05
C9orf92A6NGG3 PFDN6-203ENST00000374610 521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.47□□□□□ -1.05
C9orf92A6NGG3 IGHV3-16-201ENST00000390604 425 ntAPPRIS P1 BASIC8.47□□□□□ -1.05
C9orf92A6NGG3 SUN1-204ENST00000403868 978 ntTSL 2 BASIC8.47□□□□□ -1.05
C9orf92A6NGG3 TNFRSF14-202ENST00000409119 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC8.47□□□□□ -1.05
C9orf92A6NGG3 Z98749.2-207ENST00000443658 679 ntTSL 2 BASIC8.47□□□□□ -1.05
C9orf92A6NGG3 KRBOX4-207ENST00000487081 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
C9orf92A6NGG3 AC026410.3-201ENST00000514280 936 ntBASIC8.47□□□□□ -1.05
C9orf92A6NGG3 MRNIP-220ENST00000523084 1096 ntTSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
C9orf92A6NGG3 NEU3-203ENST00000529024 581 ntTSL 3 BASIC8.47□□□□□ -1.05
C9orf92A6NGG3 ARL2-204ENST00000529384 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.47□□□□□ -1.05
C9orf92A6NGG3 AL132639.3-201ENST00000556537 530 ntTSL 4 BASIC8.47□□□□□ -1.05
C9orf92A6NGG3 LINC01220-201ENST00000558575 715 ntTSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
C9orf92A6NGG3 GCHFR-206ENST00000561160 572 ntTSL 3 BASIC8.47□□□□□ -1.05
C9orf92A6NGG3 AC124283.3-201ENST00000570869 594 ntBASIC8.47□□□□□ -1.05
C9orf92A6NGG3 IFT20-206ENST00000578122 834 ntTSL 2 BASIC8.47□□□□□ -1.05
C9orf92A6NGG3 AC079336.2-201ENST00000578408 927 ntTSL 3 BASIC8.47□□□□□ -1.05
C9orf92A6NGG3 IFT20-208ENST00000578985 831 ntTSL 3 BASIC8.47□□□□□ -1.05
C9orf92A6NGG3 AC132938.2-201ENST00000579188 680 ntBASIC8.47□□□□□ -1.05
C9orf92A6NGG3 AC010319.3-201ENST00000597028 470 ntBASIC8.47□□□□□ -1.05
C9orf92A6NGG3 FAM66A-202ENST00000602658 546 ntTSL 5 BASIC8.47□□□□□ -1.05
C9orf92A6NGG3 AL591163.1-201ENST00000641757 987 ntBASIC8.47□□□□□ -1.05
C9orf92A6NGG3 AC105233.6-201ENST00000642093 218 ntBASIC8.47□□□□□ -1.05
C9orf92A6NGG3 PSMD14-201ENST00000409682 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
C9orf92A6NGG3 DIAPH2-204ENST00000373054 3376 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.47□□□□□ -1.05
C9orf92A6NGG3 PRRC2A-202ENST00000376033 6893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
C9orf92A6NGG3 VWCE-202ENST00000335613 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
C9orf92A6NGG3 ELAC1-201ENST00000269466 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
C9orf92A6NGG3 TBX10-201ENST00000335385 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
C9orf92A6NGG3 HOGA1-202ENST00000370646 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
C9orf92A6NGG3 C16orf52-202ENST00000542527 4360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.47□□□□□ -1.05
C9orf92A6NGG3 SP140L-204ENST00000444636 1781 ntTSL 5 BASIC8.47□□□□□ -1.05
C9orf92A6NGG3 TNFRSF10A-201ENST00000221132 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
C9orf92A6NGG3 PPP1R12A-201ENST00000261207 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.47□□□□□ -1.05
C9orf92A6NGG3 HNRNPU-204ENST00000440865 3207 ntTSL 2 BASIC8.47□□□□□ -1.05
C9orf92A6NGG3 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
C9orf92A6NGG3 TNRC6C-211ENST00000636222 7093 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.47□□□□□ -1.05
C9orf92A6NGG3 COPS7B-224ENST00000620578 2500 ntTSL 2 BASIC8.47□□□□□ -1.05
C9orf92A6NGG3 RNASE1-202ENST00000397967 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
C9orf92A6NGG3 NMNAT3-201ENST00000296202 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.47□□□□□ -1.05
C9orf92A6NGG3 AL358334.2-201ENST00000553648 4714 ntTSL 2 BASIC8.47□□□□□ -1.05
C9orf92A6NGG3 ATP2A3-202ENST00000352011 3274 ntTSL 5 BASIC8.47□□□□□ -1.05
C9orf92A6NGG3 KIAA0895L-202ENST00000561621 3500 ntTSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
C9orf92A6NGG3 TBCD-201ENST00000355528 7168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
C9orf92A6NGG3 AGAP7P-201ENST00000582299 2062 ntBASIC8.47□□□□□ -1.05
C9orf92A6NGG3 AGAP14-201ENST00000624701 2060 ntBASIC8.47□□□□□ -1.05
C9orf92A6NGG3 CDSN-202ENST00000376288 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
C9orf92A6NGG3 BCORL1-201ENST00000218147 6860 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.47□□□□□ -1.05
C9orf92A6NGG3 MRPL11-201ENST00000310999 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
C9orf92A6NGG3 KYAT1-202ENST00000320665 1623 ntTSL 2 BASIC8.47□□□□□ -1.05
C9orf92A6NGG3 TBKBP1-201ENST00000361722 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
C9orf92A6NGG3 RPS9-205ENST00000402367 1617 ntTSL 3 BASIC8.47□□□□□ -1.05
C9orf92A6NGG3 PLD3-204ENST00000409281 2115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.47□□□□□ -1.05
C9orf92A6NGG3 NKIRAS1-203ENST00000415901 1644 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC8.47□□□□□ -1.05
C9orf92A6NGG3 DBH-AS1-201ENST00000425189 2139 ntTSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
C9orf92A6NGG3 PUS7-202ENST00000469408 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
C9orf92A6NGG3 CTD-2194D22.4-201ENST00000514569 1635 ntTSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
C9orf92A6NGG3 UBL7-AS1-203ENST00000564621 1612 ntTSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
C9orf92A6NGG3 NAA15-201ENST00000296543 6222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
C9orf92A6NGG3 SLC44A3-AS1-215ENST00000634870 5956 ntTSL 5 BASIC8.47□□□□□ -1.05
C9orf92A6NGG3 GGACT-202ENST00000455100 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
C9orf92A6NGG3 PPOX-201ENST00000352210 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.05
C9orf92A6NGG3 UGT3A1-204ENST00000507113 1650 ntTSL 2 BASIC8.46□□□□□ -1.05
C9orf92A6NGG3 CYB561-219ENST00000584031 3200 ntTSL 2 BASIC8.46□□□□□ -1.05
C9orf92A6NGG3 RAPGEF1-201ENST00000372189 6085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.05
C9orf92A6NGG3 C5orf38-207ENST00000515640 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC8.46□□□□□ -1.05
C9orf92A6NGG3 GTF2H1-203ENST00000453096 2707 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.46□□□□□ -1.05
C9orf92A6NGG3 PTPRVP-205ENST00000641549 5067 ntBASIC8.46□□□□□ -1.05
C9orf92A6NGG3 EDC3-201ENST00000315127 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.05
C9orf92A6NGG3 FGD2-201ENST00000274963 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.05
C9orf92A6NGG3 RAB2A-201ENST00000262646 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.05
C9orf92A6NGG3 FGFR1-201ENST00000326324 3816 ntTSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.05
C9orf92A6NGG3 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.05
C9orf92A6NGG3 ZNF717-204ENST00000478296 3875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.46□□□□□ -1.05
C9orf92A6NGG3 GABARAPL1-218ENST00000546017 2294 ntTSL 2 BASIC8.46□□□□□ -1.05
C9orf92A6NGG3 AC012508.2-201ENST00000567613 1472 ntBASIC8.46□□□□□ -1.05
C9orf92A6NGG3 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.05
C9orf92A6NGG3 CPLX2-201ENST00000359546 5023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.05
C9orf92A6NGG3 PPP1R21-201ENST00000281394 3137 ntTSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.05
C9orf92A6NGG3 TRAF7-201ENST00000326181 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.05
C9orf92A6NGG3 ALDH3B2-201ENST00000349015 2649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.46□□□□□ -1.05
C9orf92A6NGG3 GARS-201ENST00000389266 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.05
C9orf92A6NGG3 REXO1L2P-201ENST00000425429 2069 ntBASIC8.46□□□□□ -1.05
C9orf92A6NGG3 PI16-203ENST00000611814 2083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.46□□□□□ -1.05
C9orf92A6NGG3 CD38-201ENST00000226279 5668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.05
C9orf92A6NGG3 RGPD5-202ENST00000272454 2907 ntTSL 2 BASIC8.46□□□□□ -1.06
C9orf92A6NGG3 LINC00869-206ENST00000610578 5734 ntTSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.06
C9orf92A6NGG3 TSEN2-201ENST00000284995 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.06
C9orf92A6NGG3 JAKMIP1-205ENST00000410077 1835 ntTSL 2 BASIC8.46□□□□□ -1.06
C9orf92A6NGG3 AP4M1-205ENST00000422582 1814 ntTSL 2 BASIC8.46□□□□□ -1.06
C9orf92A6NGG3 CAMK2D-207ENST00000505990 1802 ntTSL 5 BASIC8.46□□□□□ -1.06
C9orf92A6NGG3 AFDN-206ENST00000392112 7459 ntTSL 5 BASIC8.46□□□□□ -1.06
C9orf92A6NGG3 BUD31-201ENST00000222969 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.06
C9orf92A6NGG3 NCR1-201ENST00000291890 1155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC8.46□□□□□ -1.06
C9orf92A6NGG3 ZNF324B-201ENST00000336614 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.06
C9orf92A6NGG3 NCR1-202ENST00000338835 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.06
C9orf92A6NGG3 NCR1-203ENST00000350790 739 ntTSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.06
C9orf92A6NGG3 HIST3H2A-201ENST00000366695 895 ntAPPRIS P1 BASIC8.46□□□□□ -1.06
C9orf92A6NGG3 FANK1-204ENST00000368695 1296 ntTSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.4 ms