Protein–RNA interactions for Protein: A4UGR9

XIRP2, Xin actin-binding repeat-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 3,374 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XIRP2A4UGR9 SNHG14-209ENST00000456576 544 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
XIRP2A4UGR9 RN7SL147P-201ENST00000487345 298 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
XIRP2A4UGR9 RN7SL288P-201ENST00000490496 291 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
XIRP2A4UGR9 INO80E-209ENST00000567254 625 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
XIRP2A4UGR9 APOBEC3H-207ENST00000613996 465 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
XIRP2A4UGR9 TK2-203ENST00000451102 3738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
XIRP2A4UGR9 CEP250-201ENST00000397524 1419 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
XIRP2A4UGR9 KYAT1-202ENST00000320665 1623 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
XIRP2A4UGR9 DLK1-201ENST00000331224 1324 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
XIRP2A4UGR9 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
XIRP2A4UGR9 LIMK2-204ENST00000406516 2657 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
XIRP2A4UGR9 ANKRD42-208ENST00000531895 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
XIRP2A4UGR9 CLCC1-202ENST00000348264 1124 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
XIRP2A4UGR9 AQP7-202ENST00000377425 1068 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
XIRP2A4UGR9 HNRNPA1P27-201ENST00000412087 955 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
XIRP2A4UGR9 AL121987.1-201ENST00000435580 645 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
XIRP2A4UGR9 AC093484.1-201ENST00000441875 477 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
XIRP2A4UGR9 PRR34-AS1-203ENST00000451166 877 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
XIRP2A4UGR9 AC097103.2-201ENST00000504670 602 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
XIRP2A4UGR9 ANO1-AS2-202ENST00000533327 498 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
XIRP2A4UGR9 COX5A-205ENST00000568517 582 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
XIRP2A4UGR9 LINC01002-234ENST00000633808 848 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
XIRP2A4UGR9 BX322534.1-201ENST00000635574 241 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
XIRP2A4UGR9 AC215524.1-201ENST00000635696 241 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
XIRP2A4UGR9 ZCCHC17-201ENST00000344147 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
XIRP2A4UGR9 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
XIRP2A4UGR9 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
XIRP2A4UGR9 GRIK5-204ENST00000593562 3308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
XIRP2A4UGR9 KLK4-201ENST00000324041 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
XIRP2A4UGR9 NOX3-201ENST00000159060 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
XIRP2A4UGR9 VEGFA-201ENST00000230480 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
XIRP2A4UGR9 CDCA4P4-201ENST00000435216 680 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
XIRP2A4UGR9 PRKCZ-AS1-202ENST00000444529 622 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
XIRP2A4UGR9 FXYD6-208ENST00000529335 708 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
XIRP2A4UGR9 LINC02285-201ENST00000557121 943 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
XIRP2A4UGR9 AC012593.1-214ENST00000586952 767 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
XIRP2A4UGR9 PHF23-213ENST00000613632 850 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
XIRP2A4UGR9 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
XIRP2A4UGR9 KAT5-202ENST00000352980 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
XIRP2A4UGR9 AGGF1P1-201ENST00000509500 2073 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
XIRP2A4UGR9 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
XIRP2A4UGR9 SPAG1-202ENST00000388798 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
XIRP2A4UGR9 RNPS1-220ENST00000566458 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
XIRP2A4UGR9 STIP1-201ENST00000305218 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
XIRP2A4UGR9 FAM160B1-203ENST00000369250 2870 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
XIRP2A4UGR9 IL1RN-203ENST00000361779 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
XIRP2A4UGR9 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
XIRP2A4UGR9 DAD1-201ENST00000250498 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
XIRP2A4UGR9 FAM151A-201ENST00000302250 2005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
XIRP2A4UGR9 OR8T1P-201ENST00000421347 918 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
XIRP2A4UGR9 MIATNB-206ENST00000444388 918 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
XIRP2A4UGR9 DUX4L50-201ENST00000455245 715 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
XIRP2A4UGR9 PFN2-212ENST00000490975 858 ntTSL 4 BASIC15.09■□□□□ 0.01
XIRP2A4UGR9 AC008443.1-202ENST00000506340 687 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
XIRP2A4UGR9 SPAG5-AS1-204ENST00000556050 871 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
XIRP2A4UGR9 NFATC4-226ENST00000556279 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
XIRP2A4UGR9 PDCD6-213ENST00000618970 931 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
XIRP2A4UGR9 ARMCX1-201ENST00000372829 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
XIRP2A4UGR9 YWHAE-208ENST00000571732 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
XIRP2A4UGR9 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
XIRP2A4UGR9 PHF2-203ENST00000610682 2921 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
XIRP2A4UGR9 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
XIRP2A4UGR9 GOLGA8R-201ENST00000327271 1896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
XIRP2A4UGR9 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
XIRP2A4UGR9 AC011462.1-202ENST00000540732 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
XIRP2A4UGR9 FAU-201ENST00000279259 461 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
XIRP2A4UGR9 KRTAP2-2-201ENST00000398477 733 ntAPPRIS P2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
XIRP2A4UGR9 AC104961.1-201ENST00000427605 771 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
XIRP2A4UGR9 SNHG25-202ENST00000582965 278 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
XIRP2A4UGR9 RARS-210ENST00000626454 177 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
XIRP2A4UGR9 AL137793.2-201ENST00000632635 659 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
XIRP2A4UGR9 AC026992.2-202ENST00000565312 1934 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
XIRP2A4UGR9 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
XIRP2A4UGR9 SIDT1-202ENST00000393830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
XIRP2A4UGR9 MSANTD2P1-201ENST00000445341 1368 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
XIRP2A4UGR9 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
XIRP2A4UGR9 ELOVL1-201ENST00000372458 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
XIRP2A4UGR9 AL390038.1-201ENST00000419814 2481 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
XIRP2A4UGR9 AL359258.1-201ENST00000438965 2481 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
XIRP2A4UGR9 MKRN3-201ENST00000314520 2337 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
XIRP2A4UGR9 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
XIRP2A4UGR9 ZEB1-AS1-208ENST00000607166 2503 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
XIRP2A4UGR9 C18orf15-201ENST00000623680 2534 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
XIRP2A4UGR9 DHX40-202ENST00000425628 2255 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
XIRP2A4UGR9 RNFT2-203ENST00000392549 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
XIRP2A4UGR9 MYEF2-201ENST00000267836 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
XIRP2A4UGR9 EEF1DP5-201ENST00000431410 772 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
XIRP2A4UGR9 AC090820.1-201ENST00000519722 591 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
XIRP2A4UGR9 C10orf113-201ENST00000529198 614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
XIRP2A4UGR9 USP32P3-202ENST00000583574 611 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0.01
XIRP2A4UGR9 NEK4P3-201ENST00000604859 544 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
XIRP2A4UGR9 CPEB1-211ENST00000615198 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
XIRP2A4UGR9 Metazoa_SRP.157-201ENST00000622819 262 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
XIRP2A4UGR9 GNG14-201ENST00000640117 210 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
XIRP2A4UGR9 RHOH-218ENST00000613272 1865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0.01
XIRP2A4UGR9 PDE3B-202ENST00000455098 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
XIRP2A4UGR9 CDH1-202ENST00000422392 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
XIRP2A4UGR9 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
XIRP2A4UGR9 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
XIRP2A4UGR9 DGKZ-205ENST00000456247 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.3 ms