Protein–RNA interactions for Protein: V9GY48

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
V9GY48 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
V9GY48 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
V9GY48 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
V9GY48 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
V9GY48 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC26.54■■□□□ 1.84
V9GY48 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
V9GY48 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
V9GY48 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
V9GY48 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
V9GY48 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
V9GY48 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
V9GY48 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
V9GY48 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
V9GY48 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
V9GY48 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
V9GY48 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
V9GY48 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
V9GY48 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
V9GY48 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
V9GY48 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
V9GY48 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
V9GY48 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
V9GY48 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
V9GY48 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
V9GY48 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
V9GY48 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
V9GY48 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
V9GY48 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
V9GY48 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
V9GY48 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
V9GY48 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
V9GY48 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
V9GY48 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
V9GY48 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
V9GY48 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
V9GY48 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
V9GY48 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
V9GY48 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
V9GY48 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
V9GY48 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
V9GY48 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
V9GY48 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
V9GY48 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
V9GY48 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
V9GY48 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
V9GY48 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
V9GY48 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
V9GY48 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
V9GY48 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
V9GY48 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
V9GY48 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
V9GY48 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
V9GY48 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
V9GY48 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
V9GY48 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
V9GY48 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
V9GY48 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
V9GY48 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
V9GY48 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
V9GY48 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
V9GY48 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
V9GY48 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
V9GY48 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
V9GY48 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
V9GY48 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
V9GY48 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
V9GY48 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
V9GY48 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
V9GY48 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
V9GY48 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
V9GY48 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
V9GY48 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
V9GY48 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
V9GY48 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
V9GY48 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
V9GY48 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
V9GY48 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
V9GY48 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
V9GY48 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
V9GY48 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
V9GY48 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
V9GY48 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
V9GY48 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.82
V9GY48 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC26.45■■□□□ 1.82
V9GY48 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
V9GY48 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
V9GY48 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
V9GY48 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
V9GY48 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
V9GY48 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
V9GY48 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
V9GY48 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
V9GY48 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
V9GY48 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
V9GY48 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
V9GY48 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
V9GY48 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
V9GY48 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
V9GY48 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
V9GY48 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.5 ms