Protein–RNA interactions for Protein: U3KQV3

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 271 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
U3KQV3 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
U3KQV3 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
U3KQV3 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
U3KQV3 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
U3KQV3 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
U3KQV3 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
U3KQV3 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
U3KQV3 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
U3KQV3 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
U3KQV3 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
U3KQV3 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
U3KQV3 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
U3KQV3 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
U3KQV3 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
U3KQV3 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
U3KQV3 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
U3KQV3 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
U3KQV3 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
U3KQV3 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
U3KQV3 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
U3KQV3 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
U3KQV3 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
U3KQV3 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
U3KQV3 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
U3KQV3 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
U3KQV3 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
U3KQV3 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
U3KQV3 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
U3KQV3 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
U3KQV3 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
U3KQV3 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
U3KQV3 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
U3KQV3 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
U3KQV3 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
U3KQV3 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
U3KQV3 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
U3KQV3 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
U3KQV3 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
U3KQV3 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
U3KQV3 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
U3KQV3 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
U3KQV3 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
U3KQV3 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
U3KQV3 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
U3KQV3 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
U3KQV3 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
U3KQV3 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
U3KQV3 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
U3KQV3 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
U3KQV3 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
U3KQV3 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
U3KQV3 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
U3KQV3 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
U3KQV3 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
U3KQV3 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
U3KQV3 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
U3KQV3 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
U3KQV3 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
U3KQV3 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
U3KQV3 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
U3KQV3 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
U3KQV3 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
U3KQV3 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
U3KQV3 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
U3KQV3 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
U3KQV3 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC21.2■□□□□ 0.99
U3KQV3 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
U3KQV3 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
U3KQV3 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
U3KQV3 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
U3KQV3 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
U3KQV3 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
U3KQV3 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
U3KQV3 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
U3KQV3 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
U3KQV3 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
U3KQV3 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
U3KQV3 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
U3KQV3 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
U3KQV3 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
U3KQV3 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
U3KQV3 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
U3KQV3 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
U3KQV3 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
U3KQV3 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
U3KQV3 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
U3KQV3 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
U3KQV3 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
U3KQV3 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
U3KQV3 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
U3KQV3 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
U3KQV3 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
U3KQV3 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
U3KQV3 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
U3KQV3 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
U3KQV3 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
U3KQV3 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
U3KQV3 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
U3KQV3 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
U3KQV3 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms