Protein–RNA interactions for Protein: R4GMQ9

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 66 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
R4GMQ9 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
R4GMQ9 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
R4GMQ9 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
R4GMQ9 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
R4GMQ9 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
R4GMQ9 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
R4GMQ9 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
R4GMQ9 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
R4GMQ9 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
R4GMQ9 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
R4GMQ9 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
R4GMQ9 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
R4GMQ9 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
R4GMQ9 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
R4GMQ9 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
R4GMQ9 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
R4GMQ9 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
R4GMQ9 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
R4GMQ9 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
R4GMQ9 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
R4GMQ9 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
R4GMQ9 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
R4GMQ9 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
R4GMQ9 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
R4GMQ9 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
R4GMQ9 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
R4GMQ9 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
R4GMQ9 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
R4GMQ9 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
R4GMQ9 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
R4GMQ9 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
R4GMQ9 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
R4GMQ9 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
R4GMQ9 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
R4GMQ9 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
R4GMQ9 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
R4GMQ9 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
R4GMQ9 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
R4GMQ9 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
R4GMQ9 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
R4GMQ9 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
R4GMQ9 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
R4GMQ9 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
R4GMQ9 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
R4GMQ9 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
R4GMQ9 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
R4GMQ9 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
R4GMQ9 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
R4GMQ9 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
R4GMQ9 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
R4GMQ9 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
R4GMQ9 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC19.98■□□□□ 0.79
R4GMQ9 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
R4GMQ9 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
R4GMQ9 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
R4GMQ9 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
R4GMQ9 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
R4GMQ9 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
R4GMQ9 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
R4GMQ9 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
R4GMQ9 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
R4GMQ9 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
R4GMQ9 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
R4GMQ9 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
R4GMQ9 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
R4GMQ9 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
R4GMQ9 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
R4GMQ9 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
R4GMQ9 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
R4GMQ9 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
R4GMQ9 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
R4GMQ9 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
R4GMQ9 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
R4GMQ9 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
R4GMQ9 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
R4GMQ9 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
R4GMQ9 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
R4GMQ9 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC19.96■□□□□ 0.79
R4GMQ9 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
R4GMQ9 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
R4GMQ9 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
R4GMQ9 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
R4GMQ9 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
R4GMQ9 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
R4GMQ9 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
R4GMQ9 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
R4GMQ9 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
R4GMQ9 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
R4GMQ9 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
R4GMQ9 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
R4GMQ9 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
R4GMQ9 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
R4GMQ9 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
R4GMQ9 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
R4GMQ9 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
R4GMQ9 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
R4GMQ9 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
R4GMQ9 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
R4GMQ9 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
R4GMQ9 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.4 ms