Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6Y8

SEC23IP, SEC23-interacting protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,000 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC23IPQ9Y6Y8 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SEC23IPQ9Y6Y8 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SEC23IPQ9Y6Y8 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SEC23IPQ9Y6Y8 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SEC23IPQ9Y6Y8 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
SEC23IPQ9Y6Y8 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
SEC23IPQ9Y6Y8 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SEC23IPQ9Y6Y8 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SEC23IPQ9Y6Y8 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SEC23IPQ9Y6Y8 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SEC23IPQ9Y6Y8 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SEC23IPQ9Y6Y8 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
SEC23IPQ9Y6Y8 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SEC23IPQ9Y6Y8 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SEC23IPQ9Y6Y8 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SEC23IPQ9Y6Y8 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SEC23IPQ9Y6Y8 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SEC23IPQ9Y6Y8 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SEC23IPQ9Y6Y8 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SEC23IPQ9Y6Y8 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SEC23IPQ9Y6Y8 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
SEC23IPQ9Y6Y8 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SEC23IPQ9Y6Y8 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SEC23IPQ9Y6Y8 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SEC23IPQ9Y6Y8 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SEC23IPQ9Y6Y8 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SEC23IPQ9Y6Y8 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SEC23IPQ9Y6Y8 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SEC23IPQ9Y6Y8 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SEC23IPQ9Y6Y8 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SEC23IPQ9Y6Y8 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SEC23IPQ9Y6Y8 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SEC23IPQ9Y6Y8 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SEC23IPQ9Y6Y8 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SEC23IPQ9Y6Y8 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SEC23IPQ9Y6Y8 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SEC23IPQ9Y6Y8 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SEC23IPQ9Y6Y8 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SEC23IPQ9Y6Y8 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SEC23IPQ9Y6Y8 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SEC23IPQ9Y6Y8 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SEC23IPQ9Y6Y8 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SEC23IPQ9Y6Y8 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SEC23IPQ9Y6Y8 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SEC23IPQ9Y6Y8 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SEC23IPQ9Y6Y8 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
SEC23IPQ9Y6Y8 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
SEC23IPQ9Y6Y8 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SEC23IPQ9Y6Y8 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SEC23IPQ9Y6Y8 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SEC23IPQ9Y6Y8 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
SEC23IPQ9Y6Y8 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SEC23IPQ9Y6Y8 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SEC23IPQ9Y6Y8 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SEC23IPQ9Y6Y8 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SEC23IPQ9Y6Y8 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SEC23IPQ9Y6Y8 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SEC23IPQ9Y6Y8 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SEC23IPQ9Y6Y8 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SEC23IPQ9Y6Y8 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SEC23IPQ9Y6Y8 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SEC23IPQ9Y6Y8 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SEC23IPQ9Y6Y8 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
SEC23IPQ9Y6Y8 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SEC23IPQ9Y6Y8 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SEC23IPQ9Y6Y8 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SEC23IPQ9Y6Y8 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SEC23IPQ9Y6Y8 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SEC23IPQ9Y6Y8 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SEC23IPQ9Y6Y8 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SEC23IPQ9Y6Y8 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SEC23IPQ9Y6Y8 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SEC23IPQ9Y6Y8 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SEC23IPQ9Y6Y8 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SEC23IPQ9Y6Y8 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SEC23IPQ9Y6Y8 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SEC23IPQ9Y6Y8 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SEC23IPQ9Y6Y8 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SEC23IPQ9Y6Y8 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SEC23IPQ9Y6Y8 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SEC23IPQ9Y6Y8 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SEC23IPQ9Y6Y8 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SEC23IPQ9Y6Y8 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SEC23IPQ9Y6Y8 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SEC23IPQ9Y6Y8 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SEC23IPQ9Y6Y8 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SEC23IPQ9Y6Y8 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SEC23IPQ9Y6Y8 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SEC23IPQ9Y6Y8 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SEC23IPQ9Y6Y8 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SEC23IPQ9Y6Y8 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SEC23IPQ9Y6Y8 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SEC23IPQ9Y6Y8 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SEC23IPQ9Y6Y8 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SEC23IPQ9Y6Y8 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SEC23IPQ9Y6Y8 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SEC23IPQ9Y6Y8 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SEC23IPQ9Y6Y8 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SEC23IPQ9Y6Y8 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
SEC23IPQ9Y6Y8 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36 ms