Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6N5

SQOR, Sulfide:quinone oxidoreductase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 450 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SQORQ9Y6N5 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SQORQ9Y6N5 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SQORQ9Y6N5 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SQORQ9Y6N5 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SQORQ9Y6N5 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SQORQ9Y6N5 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SQORQ9Y6N5 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SQORQ9Y6N5 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SQORQ9Y6N5 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SQORQ9Y6N5 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SQORQ9Y6N5 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
SQORQ9Y6N5 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
SQORQ9Y6N5 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SQORQ9Y6N5 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SQORQ9Y6N5 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SQORQ9Y6N5 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SQORQ9Y6N5 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SQORQ9Y6N5 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SQORQ9Y6N5 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SQORQ9Y6N5 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SQORQ9Y6N5 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SQORQ9Y6N5 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
SQORQ9Y6N5 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SQORQ9Y6N5 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SQORQ9Y6N5 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
SQORQ9Y6N5 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SQORQ9Y6N5 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SQORQ9Y6N5 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SQORQ9Y6N5 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SQORQ9Y6N5 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SQORQ9Y6N5 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SQORQ9Y6N5 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SQORQ9Y6N5 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
SQORQ9Y6N5 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SQORQ9Y6N5 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SQORQ9Y6N5 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SQORQ9Y6N5 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SQORQ9Y6N5 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SQORQ9Y6N5 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SQORQ9Y6N5 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SQORQ9Y6N5 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SQORQ9Y6N5 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SQORQ9Y6N5 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SQORQ9Y6N5 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SQORQ9Y6N5 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SQORQ9Y6N5 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
SQORQ9Y6N5 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SQORQ9Y6N5 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SQORQ9Y6N5 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SQORQ9Y6N5 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SQORQ9Y6N5 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SQORQ9Y6N5 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SQORQ9Y6N5 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SQORQ9Y6N5 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
SQORQ9Y6N5 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC25■■□□□ 1.59
SQORQ9Y6N5 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SQORQ9Y6N5 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
SQORQ9Y6N5 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SQORQ9Y6N5 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SQORQ9Y6N5 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SQORQ9Y6N5 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SQORQ9Y6N5 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SQORQ9Y6N5 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SQORQ9Y6N5 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SQORQ9Y6N5 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SQORQ9Y6N5 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SQORQ9Y6N5 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SQORQ9Y6N5 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SQORQ9Y6N5 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SQORQ9Y6N5 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SQORQ9Y6N5 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SQORQ9Y6N5 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
SQORQ9Y6N5 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SQORQ9Y6N5 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SQORQ9Y6N5 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SQORQ9Y6N5 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SQORQ9Y6N5 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SQORQ9Y6N5 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SQORQ9Y6N5 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SQORQ9Y6N5 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SQORQ9Y6N5 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SQORQ9Y6N5 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SQORQ9Y6N5 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SQORQ9Y6N5 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SQORQ9Y6N5 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SQORQ9Y6N5 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SQORQ9Y6N5 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SQORQ9Y6N5 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
SQORQ9Y6N5 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SQORQ9Y6N5 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SQORQ9Y6N5 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SQORQ9Y6N5 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SQORQ9Y6N5 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SQORQ9Y6N5 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SQORQ9Y6N5 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
SQORQ9Y6N5 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SQORQ9Y6N5 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
SQORQ9Y6N5 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SQORQ9Y6N5 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SQORQ9Y6N5 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.4 ms