Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5X2

SNX8, Sorting nexin-8, humanhuman

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX8Q9Y5X2 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SNX8Q9Y5X2 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
SNX8Q9Y5X2 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
SNX8Q9Y5X2 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
SNX8Q9Y5X2 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
SNX8Q9Y5X2 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
SNX8Q9Y5X2 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SNX8Q9Y5X2 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SNX8Q9Y5X2 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SNX8Q9Y5X2 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SNX8Q9Y5X2 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SNX8Q9Y5X2 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SNX8Q9Y5X2 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SNX8Q9Y5X2 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SNX8Q9Y5X2 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SNX8Q9Y5X2 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SNX8Q9Y5X2 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SNX8Q9Y5X2 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SNX8Q9Y5X2 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SNX8Q9Y5X2 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SNX8Q9Y5X2 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SNX8Q9Y5X2 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SNX8Q9Y5X2 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SNX8Q9Y5X2 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SNX8Q9Y5X2 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
SNX8Q9Y5X2 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SNX8Q9Y5X2 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SNX8Q9Y5X2 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SNX8Q9Y5X2 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SNX8Q9Y5X2 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SNX8Q9Y5X2 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SNX8Q9Y5X2 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SNX8Q9Y5X2 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SNX8Q9Y5X2 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SNX8Q9Y5X2 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SNX8Q9Y5X2 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SNX8Q9Y5X2 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SNX8Q9Y5X2 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SNX8Q9Y5X2 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SNX8Q9Y5X2 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SNX8Q9Y5X2 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
SNX8Q9Y5X2 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SNX8Q9Y5X2 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SNX8Q9Y5X2 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SNX8Q9Y5X2 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SNX8Q9Y5X2 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SNX8Q9Y5X2 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SNX8Q9Y5X2 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SNX8Q9Y5X2 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SNX8Q9Y5X2 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SNX8Q9Y5X2 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SNX8Q9Y5X2 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SNX8Q9Y5X2 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SNX8Q9Y5X2 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SNX8Q9Y5X2 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SNX8Q9Y5X2 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SNX8Q9Y5X2 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SNX8Q9Y5X2 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SNX8Q9Y5X2 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SNX8Q9Y5X2 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SNX8Q9Y5X2 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SNX8Q9Y5X2 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SNX8Q9Y5X2 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SNX8Q9Y5X2 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SNX8Q9Y5X2 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SNX8Q9Y5X2 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
SNX8Q9Y5X2 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SNX8Q9Y5X2 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
SNX8Q9Y5X2 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SNX8Q9Y5X2 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SNX8Q9Y5X2 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SNX8Q9Y5X2 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SNX8Q9Y5X2 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SNX8Q9Y5X2 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SNX8Q9Y5X2 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SNX8Q9Y5X2 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SNX8Q9Y5X2 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SNX8Q9Y5X2 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
SNX8Q9Y5X2 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SNX8Q9Y5X2 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SNX8Q9Y5X2 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SNX8Q9Y5X2 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SNX8Q9Y5X2 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SNX8Q9Y5X2 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SNX8Q9Y5X2 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SNX8Q9Y5X2 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SNX8Q9Y5X2 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SNX8Q9Y5X2 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SNX8Q9Y5X2 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SNX8Q9Y5X2 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SNX8Q9Y5X2 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SNX8Q9Y5X2 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
SNX8Q9Y5X2 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SNX8Q9Y5X2 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SNX8Q9Y5X2 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
SNX8Q9Y5X2 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
SNX8Q9Y5X2 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SNX8Q9Y5X2 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
SNX8Q9Y5X2 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SNX8Q9Y5X2 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms