Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5T5

USP16, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 16, humanhuman

Predictions only

Length 823 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP16Q9Y5T5 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
USP16Q9Y5T5 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC29.44■■■□□ 2.3
USP16Q9Y5T5 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC29.44■■■□□ 2.3
USP16Q9Y5T5 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.44■■■□□ 2.3
USP16Q9Y5T5 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
USP16Q9Y5T5 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
USP16Q9Y5T5 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
USP16Q9Y5T5 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
USP16Q9Y5T5 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC29.43■■■□□ 2.3
USP16Q9Y5T5 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC29.43■■■□□ 2.3
USP16Q9Y5T5 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
USP16Q9Y5T5 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
USP16Q9Y5T5 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
USP16Q9Y5T5 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
USP16Q9Y5T5 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.42■■■□□ 2.3
USP16Q9Y5T5 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC29.42■■■□□ 2.3
USP16Q9Y5T5 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
USP16Q9Y5T5 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
USP16Q9Y5T5 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
USP16Q9Y5T5 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC29.41■■■□□ 2.3
USP16Q9Y5T5 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
USP16Q9Y5T5 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
USP16Q9Y5T5 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC29.41■■■□□ 2.3
USP16Q9Y5T5 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
USP16Q9Y5T5 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
USP16Q9Y5T5 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
USP16Q9Y5T5 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
USP16Q9Y5T5 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
USP16Q9Y5T5 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
USP16Q9Y5T5 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
USP16Q9Y5T5 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC29.4■■■□□ 2.3
USP16Q9Y5T5 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
USP16Q9Y5T5 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
USP16Q9Y5T5 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
USP16Q9Y5T5 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
USP16Q9Y5T5 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
USP16Q9Y5T5 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
USP16Q9Y5T5 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
USP16Q9Y5T5 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
USP16Q9Y5T5 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC29.39■■■□□ 2.3
USP16Q9Y5T5 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
USP16Q9Y5T5 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC29.39■■■□□ 2.3
USP16Q9Y5T5 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC29.39■■■□□ 2.3
USP16Q9Y5T5 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
USP16Q9Y5T5 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
USP16Q9Y5T5 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
USP16Q9Y5T5 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
USP16Q9Y5T5 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
USP16Q9Y5T5 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
USP16Q9Y5T5 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC29.38■■■□□ 2.29
USP16Q9Y5T5 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
USP16Q9Y5T5 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
USP16Q9Y5T5 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
USP16Q9Y5T5 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC29.37■■■□□ 2.29
USP16Q9Y5T5 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC29.37■■■□□ 2.29
USP16Q9Y5T5 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
USP16Q9Y5T5 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
USP16Q9Y5T5 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
USP16Q9Y5T5 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
USP16Q9Y5T5 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
USP16Q9Y5T5 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
USP16Q9Y5T5 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
USP16Q9Y5T5 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
USP16Q9Y5T5 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
USP16Q9Y5T5 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
USP16Q9Y5T5 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
USP16Q9Y5T5 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
USP16Q9Y5T5 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC29.35■■■□□ 2.29
USP16Q9Y5T5 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
USP16Q9Y5T5 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
USP16Q9Y5T5 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
USP16Q9Y5T5 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
USP16Q9Y5T5 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
USP16Q9Y5T5 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
USP16Q9Y5T5 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
USP16Q9Y5T5 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC29.34■■■□□ 2.29
USP16Q9Y5T5 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC29.34■■■□□ 2.29
USP16Q9Y5T5 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC29.34■■■□□ 2.29
USP16Q9Y5T5 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC29.34■■■□□ 2.29
USP16Q9Y5T5 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
USP16Q9Y5T5 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
USP16Q9Y5T5 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
USP16Q9Y5T5 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC29.34■■■□□ 2.29
USP16Q9Y5T5 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
USP16Q9Y5T5 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
USP16Q9Y5T5 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
USP16Q9Y5T5 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
USP16Q9Y5T5 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
USP16Q9Y5T5 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
USP16Q9Y5T5 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
USP16Q9Y5T5 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
USP16Q9Y5T5 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
USP16Q9Y5T5 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
USP16Q9Y5T5 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
USP16Q9Y5T5 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
USP16Q9Y5T5 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
USP16Q9Y5T5 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
USP16Q9Y5T5 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC29.32■■■□□ 2.28
USP16Q9Y5T5 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
USP16Q9Y5T5 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.9 ms