Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4F1

FARP1, FERM, RhoGEF and pleckstrin domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,045 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FARP1Q9Y4F1 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
FARP1Q9Y4F1 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
FARP1Q9Y4F1 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
FARP1Q9Y4F1 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
FARP1Q9Y4F1 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
FARP1Q9Y4F1 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
FARP1Q9Y4F1 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
FARP1Q9Y4F1 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
FARP1Q9Y4F1 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
FARP1Q9Y4F1 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
FARP1Q9Y4F1 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
FARP1Q9Y4F1 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
FARP1Q9Y4F1 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
FARP1Q9Y4F1 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
FARP1Q9Y4F1 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
FARP1Q9Y4F1 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
FARP1Q9Y4F1 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
FARP1Q9Y4F1 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
FARP1Q9Y4F1 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC23.79■■□□□ 1.4
FARP1Q9Y4F1 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
FARP1Q9Y4F1 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
FARP1Q9Y4F1 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
FARP1Q9Y4F1 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
FARP1Q9Y4F1 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
FARP1Q9Y4F1 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
FARP1Q9Y4F1 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
FARP1Q9Y4F1 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
FARP1Q9Y4F1 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
FARP1Q9Y4F1 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
FARP1Q9Y4F1 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
FARP1Q9Y4F1 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
FARP1Q9Y4F1 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
FARP1Q9Y4F1 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
FARP1Q9Y4F1 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
FARP1Q9Y4F1 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
FARP1Q9Y4F1 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
FARP1Q9Y4F1 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
FARP1Q9Y4F1 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
FARP1Q9Y4F1 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC23.77■■□□□ 1.4
FARP1Q9Y4F1 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC23.77■■□□□ 1.4
FARP1Q9Y4F1 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
FARP1Q9Y4F1 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
FARP1Q9Y4F1 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
FARP1Q9Y4F1 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
FARP1Q9Y4F1 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
FARP1Q9Y4F1 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
FARP1Q9Y4F1 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
FARP1Q9Y4F1 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
FARP1Q9Y4F1 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
FARP1Q9Y4F1 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
FARP1Q9Y4F1 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
FARP1Q9Y4F1 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
FARP1Q9Y4F1 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
FARP1Q9Y4F1 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
FARP1Q9Y4F1 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
FARP1Q9Y4F1 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
FARP1Q9Y4F1 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
FARP1Q9Y4F1 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
FARP1Q9Y4F1 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
FARP1Q9Y4F1 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
FARP1Q9Y4F1 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
FARP1Q9Y4F1 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
FARP1Q9Y4F1 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
FARP1Q9Y4F1 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
FARP1Q9Y4F1 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
FARP1Q9Y4F1 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
FARP1Q9Y4F1 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
FARP1Q9Y4F1 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
FARP1Q9Y4F1 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
FARP1Q9Y4F1 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
FARP1Q9Y4F1 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC23.74■■□□□ 1.39
FARP1Q9Y4F1 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
FARP1Q9Y4F1 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
FARP1Q9Y4F1 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
FARP1Q9Y4F1 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
FARP1Q9Y4F1 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
FARP1Q9Y4F1 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
FARP1Q9Y4F1 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
FARP1Q9Y4F1 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
FARP1Q9Y4F1 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
FARP1Q9Y4F1 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
FARP1Q9Y4F1 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
FARP1Q9Y4F1 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
FARP1Q9Y4F1 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
FARP1Q9Y4F1 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
FARP1Q9Y4F1 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC23.72■■□□□ 1.39
FARP1Q9Y4F1 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
FARP1Q9Y4F1 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
FARP1Q9Y4F1 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
FARP1Q9Y4F1 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
FARP1Q9Y4F1 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
FARP1Q9Y4F1 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
FARP1Q9Y4F1 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
FARP1Q9Y4F1 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
FARP1Q9Y4F1 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
FARP1Q9Y4F1 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
FARP1Q9Y4F1 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
FARP1Q9Y4F1 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
FARP1Q9Y4F1 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
FARP1Q9Y4F1 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.9 ms