Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4B4

RAD54L2, Helicase ARIP4, humanhuman

Predictions only

Length 1,467 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD54L2Q9Y4B4 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.73■■■■□ 3.79
RAD54L2Q9Y4B4 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.72■■■■□ 3.79
RAD54L2Q9Y4B4 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC38.72■■■■□ 3.79
RAD54L2Q9Y4B4 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC38.72■■■■□ 3.79
RAD54L2Q9Y4B4 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC38.72■■■■□ 3.79
RAD54L2Q9Y4B4 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC38.72■■■■□ 3.79
RAD54L2Q9Y4B4 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC38.71■■■■□ 3.79
RAD54L2Q9Y4B4 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC38.71■■■■□ 3.79
RAD54L2Q9Y4B4 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.71■■■■□ 3.79
RAD54L2Q9Y4B4 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.71■■■■□ 3.79
RAD54L2Q9Y4B4 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.7■■■■□ 3.79
RAD54L2Q9Y4B4 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.7■■■■□ 3.79
RAD54L2Q9Y4B4 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.7■■■■□ 3.79
RAD54L2Q9Y4B4 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.7■■■■□ 3.79
RAD54L2Q9Y4B4 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC38.69■■■■□ 3.78
RAD54L2Q9Y4B4 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.69■■■■□ 3.78
RAD54L2Q9Y4B4 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC38.69■■■■□ 3.78
RAD54L2Q9Y4B4 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC38.69■■■■□ 3.78
RAD54L2Q9Y4B4 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.69■■■■□ 3.78
RAD54L2Q9Y4B4 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC38.68■■■■□ 3.78
RAD54L2Q9Y4B4 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC38.68■■■■□ 3.78
RAD54L2Q9Y4B4 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC38.68■■■■□ 3.78
RAD54L2Q9Y4B4 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC38.68■■■■□ 3.78
RAD54L2Q9Y4B4 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.67■■■■□ 3.78
RAD54L2Q9Y4B4 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC38.67■■■■□ 3.78
RAD54L2Q9Y4B4 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC38.66■■■■□ 3.78
RAD54L2Q9Y4B4 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC38.66■■■■□ 3.78
RAD54L2Q9Y4B4 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC38.66■■■■□ 3.78
RAD54L2Q9Y4B4 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.66■■■■□ 3.78
RAD54L2Q9Y4B4 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC38.66■■■■□ 3.78
RAD54L2Q9Y4B4 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC38.66■■■■□ 3.78
RAD54L2Q9Y4B4 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.66■■■■□ 3.78
RAD54L2Q9Y4B4 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.66■■■■□ 3.78
RAD54L2Q9Y4B4 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC38.66■■■■□ 3.78
RAD54L2Q9Y4B4 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC38.66■■■■□ 3.78
RAD54L2Q9Y4B4 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC38.66■■■■□ 3.78
RAD54L2Q9Y4B4 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC38.66■■■■□ 3.78
RAD54L2Q9Y4B4 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.65■■■■□ 3.78
RAD54L2Q9Y4B4 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC38.65■■■■□ 3.78
RAD54L2Q9Y4B4 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC38.65■■■■□ 3.78
RAD54L2Q9Y4B4 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC38.65■■■■□ 3.78
RAD54L2Q9Y4B4 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC38.65■■■■□ 3.78
RAD54L2Q9Y4B4 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC38.65■■■■□ 3.78
RAD54L2Q9Y4B4 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.65■■■■□ 3.78
RAD54L2Q9Y4B4 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC38.65■■■■□ 3.78
RAD54L2Q9Y4B4 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.64■■■■□ 3.78
RAD54L2Q9Y4B4 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.64■■■■□ 3.78
RAD54L2Q9Y4B4 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.63■■■■□ 3.77
RAD54L2Q9Y4B4 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.63■■■■□ 3.77
RAD54L2Q9Y4B4 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC38.63■■■■□ 3.77
RAD54L2Q9Y4B4 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.63■■■■□ 3.77
RAD54L2Q9Y4B4 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC38.63■■■■□ 3.77
RAD54L2Q9Y4B4 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC38.63■■■■□ 3.77
RAD54L2Q9Y4B4 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC38.63■■■■□ 3.77
RAD54L2Q9Y4B4 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC38.63■■■■□ 3.77
RAD54L2Q9Y4B4 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC38.63■■■■□ 3.77
RAD54L2Q9Y4B4 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC38.63■■■■□ 3.77
RAD54L2Q9Y4B4 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC38.63■■■■□ 3.77
RAD54L2Q9Y4B4 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.62■■■■□ 3.77
RAD54L2Q9Y4B4 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC38.62■■■■□ 3.77
RAD54L2Q9Y4B4 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.62■■■■□ 3.77
RAD54L2Q9Y4B4 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC38.62■■■■□ 3.77
RAD54L2Q9Y4B4 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.62■■■■□ 3.77
RAD54L2Q9Y4B4 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC38.61■■■■□ 3.77
RAD54L2Q9Y4B4 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC38.61■■■■□ 3.77
RAD54L2Q9Y4B4 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC38.6■■■■□ 3.77
RAD54L2Q9Y4B4 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC38.6■■■■□ 3.77
RAD54L2Q9Y4B4 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC38.6■■■■□ 3.77
RAD54L2Q9Y4B4 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.6■■■■□ 3.77
RAD54L2Q9Y4B4 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC38.6■■■■□ 3.77
RAD54L2Q9Y4B4 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC38.6■■■■□ 3.77
RAD54L2Q9Y4B4 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.6■■■■□ 3.77
RAD54L2Q9Y4B4 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.59■■■■□ 3.77
RAD54L2Q9Y4B4 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC38.59■■■■□ 3.77
RAD54L2Q9Y4B4 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.59■■■■□ 3.77
RAD54L2Q9Y4B4 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.59■■■■□ 3.77
RAD54L2Q9Y4B4 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.59■■■■□ 3.77
RAD54L2Q9Y4B4 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.59■■■■□ 3.77
RAD54L2Q9Y4B4 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC38.59■■■■□ 3.77
RAD54L2Q9Y4B4 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC38.59■■■■□ 3.77
RAD54L2Q9Y4B4 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.59■■■■□ 3.77
RAD54L2Q9Y4B4 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.59■■■■□ 3.77
RAD54L2Q9Y4B4 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC38.58■■■■□ 3.77
RAD54L2Q9Y4B4 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.58■■■■□ 3.77
RAD54L2Q9Y4B4 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC38.58■■■■□ 3.77
RAD54L2Q9Y4B4 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC38.58■■■■□ 3.77
RAD54L2Q9Y4B4 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.58■■■■□ 3.77
RAD54L2Q9Y4B4 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.58■■■■□ 3.77
RAD54L2Q9Y4B4 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC38.57■■■■□ 3.77
RAD54L2Q9Y4B4 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC38.57■■■■□ 3.77
RAD54L2Q9Y4B4 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC38.57■■■■□ 3.77
RAD54L2Q9Y4B4 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC38.57■■■■□ 3.77
RAD54L2Q9Y4B4 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.57■■■■□ 3.77
RAD54L2Q9Y4B4 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.57■■■■□ 3.76
RAD54L2Q9Y4B4 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC38.57■■■■□ 3.76
RAD54L2Q9Y4B4 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC38.57■■■■□ 3.76
RAD54L2Q9Y4B4 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.56■■■■□ 3.76
RAD54L2Q9Y4B4 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.56■■■■□ 3.76
RAD54L2Q9Y4B4 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC38.55■■■■□ 3.76
RAD54L2Q9Y4B4 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC38.55■■■■□ 3.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.7 ms