Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3Q3

TMED3, Transmembrane emp24 domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMED3Q9Y3Q3 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
TMED3Q9Y3Q3 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TMED3Q9Y3Q3 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
TMED3Q9Y3Q3 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TMED3Q9Y3Q3 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TMED3Q9Y3Q3 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TMED3Q9Y3Q3 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
TMED3Q9Y3Q3 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TMED3Q9Y3Q3 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC18.75■□□□□ 0.59
TMED3Q9Y3Q3 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TMED3Q9Y3Q3 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TMED3Q9Y3Q3 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TMED3Q9Y3Q3 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
TMED3Q9Y3Q3 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
TMED3Q9Y3Q3 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TMED3Q9Y3Q3 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TMED3Q9Y3Q3 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TMED3Q9Y3Q3 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TMED3Q9Y3Q3 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TMED3Q9Y3Q3 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TMED3Q9Y3Q3 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TMED3Q9Y3Q3 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TMED3Q9Y3Q3 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TMED3Q9Y3Q3 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TMED3Q9Y3Q3 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TMED3Q9Y3Q3 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
TMED3Q9Y3Q3 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TMED3Q9Y3Q3 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
TMED3Q9Y3Q3 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TMED3Q9Y3Q3 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TMED3Q9Y3Q3 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TMED3Q9Y3Q3 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TMED3Q9Y3Q3 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TMED3Q9Y3Q3 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TMED3Q9Y3Q3 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TMED3Q9Y3Q3 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TMED3Q9Y3Q3 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TMED3Q9Y3Q3 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TMED3Q9Y3Q3 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
TMED3Q9Y3Q3 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
TMED3Q9Y3Q3 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
TMED3Q9Y3Q3 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
TMED3Q9Y3Q3 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TMED3Q9Y3Q3 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
TMED3Q9Y3Q3 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TMED3Q9Y3Q3 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TMED3Q9Y3Q3 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
TMED3Q9Y3Q3 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TMED3Q9Y3Q3 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TMED3Q9Y3Q3 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
TMED3Q9Y3Q3 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TMED3Q9Y3Q3 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TMED3Q9Y3Q3 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TMED3Q9Y3Q3 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TMED3Q9Y3Q3 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TMED3Q9Y3Q3 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
TMED3Q9Y3Q3 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
TMED3Q9Y3Q3 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
TMED3Q9Y3Q3 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TMED3Q9Y3Q3 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
TMED3Q9Y3Q3 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TMED3Q9Y3Q3 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
TMED3Q9Y3Q3 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TMED3Q9Y3Q3 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TMED3Q9Y3Q3 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TMED3Q9Y3Q3 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TMED3Q9Y3Q3 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TMED3Q9Y3Q3 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TMED3Q9Y3Q3 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TMED3Q9Y3Q3 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TMED3Q9Y3Q3 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
TMED3Q9Y3Q3 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
TMED3Q9Y3Q3 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
TMED3Q9Y3Q3 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
TMED3Q9Y3Q3 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TMED3Q9Y3Q3 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
TMED3Q9Y3Q3 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TMED3Q9Y3Q3 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
TMED3Q9Y3Q3 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TMED3Q9Y3Q3 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TMED3Q9Y3Q3 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TMED3Q9Y3Q3 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
TMED3Q9Y3Q3 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TMED3Q9Y3Q3 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
TMED3Q9Y3Q3 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
TMED3Q9Y3Q3 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
TMED3Q9Y3Q3 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TMED3Q9Y3Q3 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TMED3Q9Y3Q3 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TMED3Q9Y3Q3 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TMED3Q9Y3Q3 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
TMED3Q9Y3Q3 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TMED3Q9Y3Q3 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
TMED3Q9Y3Q3 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TMED3Q9Y3Q3 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TMED3Q9Y3Q3 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TMED3Q9Y3Q3 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
TMED3Q9Y3Q3 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TMED3Q9Y3Q3 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TMED3Q9Y3Q3 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.8 ms