Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2W7

KCNIP3, Calsenilin, humanhuman

Predictions only

Length 256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNIP3Q9Y2W7 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
KCNIP3Q9Y2W7 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
KCNIP3Q9Y2W7 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
KCNIP3Q9Y2W7 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
KCNIP3Q9Y2W7 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
KCNIP3Q9Y2W7 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
KCNIP3Q9Y2W7 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
KCNIP3Q9Y2W7 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
KCNIP3Q9Y2W7 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
KCNIP3Q9Y2W7 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
KCNIP3Q9Y2W7 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
KCNIP3Q9Y2W7 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
KCNIP3Q9Y2W7 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
KCNIP3Q9Y2W7 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
KCNIP3Q9Y2W7 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
KCNIP3Q9Y2W7 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
KCNIP3Q9Y2W7 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
KCNIP3Q9Y2W7 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
KCNIP3Q9Y2W7 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
KCNIP3Q9Y2W7 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
KCNIP3Q9Y2W7 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
KCNIP3Q9Y2W7 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
KCNIP3Q9Y2W7 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
KCNIP3Q9Y2W7 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
KCNIP3Q9Y2W7 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
KCNIP3Q9Y2W7 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
KCNIP3Q9Y2W7 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
KCNIP3Q9Y2W7 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
KCNIP3Q9Y2W7 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
KCNIP3Q9Y2W7 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
KCNIP3Q9Y2W7 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
KCNIP3Q9Y2W7 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
KCNIP3Q9Y2W7 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
KCNIP3Q9Y2W7 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
KCNIP3Q9Y2W7 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
KCNIP3Q9Y2W7 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
KCNIP3Q9Y2W7 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
KCNIP3Q9Y2W7 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
KCNIP3Q9Y2W7 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
KCNIP3Q9Y2W7 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
KCNIP3Q9Y2W7 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
KCNIP3Q9Y2W7 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
KCNIP3Q9Y2W7 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
KCNIP3Q9Y2W7 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
KCNIP3Q9Y2W7 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
KCNIP3Q9Y2W7 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
KCNIP3Q9Y2W7 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
KCNIP3Q9Y2W7 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
KCNIP3Q9Y2W7 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
KCNIP3Q9Y2W7 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
KCNIP3Q9Y2W7 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
KCNIP3Q9Y2W7 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC19■□□□□ 0.63
KCNIP3Q9Y2W7 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
KCNIP3Q9Y2W7 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
KCNIP3Q9Y2W7 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
KCNIP3Q9Y2W7 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
KCNIP3Q9Y2W7 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
KCNIP3Q9Y2W7 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
KCNIP3Q9Y2W7 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
KCNIP3Q9Y2W7 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
KCNIP3Q9Y2W7 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
KCNIP3Q9Y2W7 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
KCNIP3Q9Y2W7 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
KCNIP3Q9Y2W7 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
KCNIP3Q9Y2W7 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
KCNIP3Q9Y2W7 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
KCNIP3Q9Y2W7 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
KCNIP3Q9Y2W7 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
KCNIP3Q9Y2W7 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
KCNIP3Q9Y2W7 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
KCNIP3Q9Y2W7 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
KCNIP3Q9Y2W7 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
KCNIP3Q9Y2W7 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
KCNIP3Q9Y2W7 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
KCNIP3Q9Y2W7 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
KCNIP3Q9Y2W7 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
KCNIP3Q9Y2W7 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
KCNIP3Q9Y2W7 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
KCNIP3Q9Y2W7 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
KCNIP3Q9Y2W7 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
KCNIP3Q9Y2W7 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
KCNIP3Q9Y2W7 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
KCNIP3Q9Y2W7 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
KCNIP3Q9Y2W7 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
KCNIP3Q9Y2W7 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
KCNIP3Q9Y2W7 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
KCNIP3Q9Y2W7 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
KCNIP3Q9Y2W7 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
KCNIP3Q9Y2W7 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
KCNIP3Q9Y2W7 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
KCNIP3Q9Y2W7 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
KCNIP3Q9Y2W7 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
KCNIP3Q9Y2W7 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
KCNIP3Q9Y2W7 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
KCNIP3Q9Y2W7 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
KCNIP3Q9Y2W7 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
KCNIP3Q9Y2W7 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
KCNIP3Q9Y2W7 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
KCNIP3Q9Y2W7 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
KCNIP3Q9Y2W7 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.6 ms