Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2U9

KLHDC2, Kelch domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHDC2Q9Y2U9 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
KLHDC2Q9Y2U9 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
KLHDC2Q9Y2U9 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
KLHDC2Q9Y2U9 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
KLHDC2Q9Y2U9 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
KLHDC2Q9Y2U9 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
KLHDC2Q9Y2U9 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
KLHDC2Q9Y2U9 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
KLHDC2Q9Y2U9 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
KLHDC2Q9Y2U9 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
KLHDC2Q9Y2U9 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
KLHDC2Q9Y2U9 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
KLHDC2Q9Y2U9 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
KLHDC2Q9Y2U9 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
KLHDC2Q9Y2U9 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
KLHDC2Q9Y2U9 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
KLHDC2Q9Y2U9 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
KLHDC2Q9Y2U9 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
KLHDC2Q9Y2U9 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
KLHDC2Q9Y2U9 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
KLHDC2Q9Y2U9 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
KLHDC2Q9Y2U9 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
KLHDC2Q9Y2U9 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
KLHDC2Q9Y2U9 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
KLHDC2Q9Y2U9 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
KLHDC2Q9Y2U9 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
KLHDC2Q9Y2U9 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
KLHDC2Q9Y2U9 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
KLHDC2Q9Y2U9 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
KLHDC2Q9Y2U9 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
KLHDC2Q9Y2U9 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
KLHDC2Q9Y2U9 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
KLHDC2Q9Y2U9 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
KLHDC2Q9Y2U9 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
KLHDC2Q9Y2U9 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
KLHDC2Q9Y2U9 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
KLHDC2Q9Y2U9 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
KLHDC2Q9Y2U9 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
KLHDC2Q9Y2U9 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
KLHDC2Q9Y2U9 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
KLHDC2Q9Y2U9 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
KLHDC2Q9Y2U9 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
KLHDC2Q9Y2U9 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
KLHDC2Q9Y2U9 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
KLHDC2Q9Y2U9 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
KLHDC2Q9Y2U9 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
KLHDC2Q9Y2U9 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
KLHDC2Q9Y2U9 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
KLHDC2Q9Y2U9 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
KLHDC2Q9Y2U9 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
KLHDC2Q9Y2U9 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
KLHDC2Q9Y2U9 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
KLHDC2Q9Y2U9 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
KLHDC2Q9Y2U9 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
KLHDC2Q9Y2U9 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
KLHDC2Q9Y2U9 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
KLHDC2Q9Y2U9 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
KLHDC2Q9Y2U9 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
KLHDC2Q9Y2U9 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
KLHDC2Q9Y2U9 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
KLHDC2Q9Y2U9 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
KLHDC2Q9Y2U9 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
KLHDC2Q9Y2U9 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
KLHDC2Q9Y2U9 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
KLHDC2Q9Y2U9 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
KLHDC2Q9Y2U9 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
KLHDC2Q9Y2U9 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
KLHDC2Q9Y2U9 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
KLHDC2Q9Y2U9 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
KLHDC2Q9Y2U9 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
KLHDC2Q9Y2U9 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
KLHDC2Q9Y2U9 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
KLHDC2Q9Y2U9 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
KLHDC2Q9Y2U9 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
KLHDC2Q9Y2U9 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
KLHDC2Q9Y2U9 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
KLHDC2Q9Y2U9 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
KLHDC2Q9Y2U9 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
KLHDC2Q9Y2U9 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
KLHDC2Q9Y2U9 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
KLHDC2Q9Y2U9 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
KLHDC2Q9Y2U9 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
KLHDC2Q9Y2U9 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
KLHDC2Q9Y2U9 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
KLHDC2Q9Y2U9 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
KLHDC2Q9Y2U9 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
KLHDC2Q9Y2U9 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
KLHDC2Q9Y2U9 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
KLHDC2Q9Y2U9 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
KLHDC2Q9Y2U9 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
KLHDC2Q9Y2U9 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
KLHDC2Q9Y2U9 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
KLHDC2Q9Y2U9 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
KLHDC2Q9Y2U9 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
KLHDC2Q9Y2U9 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
KLHDC2Q9Y2U9 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
KLHDC2Q9Y2U9 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
KLHDC2Q9Y2U9 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
KLHDC2Q9Y2U9 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
KLHDC2Q9Y2U9 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.8 ms