Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2D1

ATF5, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-5, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATF5Q9Y2D1 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
ATF5Q9Y2D1 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
ATF5Q9Y2D1 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
ATF5Q9Y2D1 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
ATF5Q9Y2D1 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
ATF5Q9Y2D1 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
ATF5Q9Y2D1 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
ATF5Q9Y2D1 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
ATF5Q9Y2D1 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC29.22■■■□□ 2.27
ATF5Q9Y2D1 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC29.22■■■□□ 2.27
ATF5Q9Y2D1 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
ATF5Q9Y2D1 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
ATF5Q9Y2D1 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC29.21■■■□□ 2.27
ATF5Q9Y2D1 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC29.21■■■□□ 2.27
ATF5Q9Y2D1 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC29.21■■■□□ 2.27
ATF5Q9Y2D1 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC29.21■■■□□ 2.27
ATF5Q9Y2D1 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
ATF5Q9Y2D1 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.27
ATF5Q9Y2D1 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
ATF5Q9Y2D1 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
ATF5Q9Y2D1 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC29.2■■■□□ 2.26
ATF5Q9Y2D1 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
ATF5Q9Y2D1 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
ATF5Q9Y2D1 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
ATF5Q9Y2D1 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
ATF5Q9Y2D1 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
ATF5Q9Y2D1 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
ATF5Q9Y2D1 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
ATF5Q9Y2D1 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.19■■■□□ 2.26
ATF5Q9Y2D1 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
ATF5Q9Y2D1 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
ATF5Q9Y2D1 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC29.19■■■□□ 2.26
ATF5Q9Y2D1 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC29.19■■■□□ 2.26
ATF5Q9Y2D1 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC29.19■■■□□ 2.26
ATF5Q9Y2D1 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
ATF5Q9Y2D1 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
ATF5Q9Y2D1 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
ATF5Q9Y2D1 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC29.18■■■□□ 2.26
ATF5Q9Y2D1 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
ATF5Q9Y2D1 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC29.18■■■□□ 2.26
ATF5Q9Y2D1 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
ATF5Q9Y2D1 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
ATF5Q9Y2D1 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC29.17■■■□□ 2.26
ATF5Q9Y2D1 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
ATF5Q9Y2D1 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
ATF5Q9Y2D1 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
ATF5Q9Y2D1 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC29.16■■■□□ 2.26
ATF5Q9Y2D1 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
ATF5Q9Y2D1 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
ATF5Q9Y2D1 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC29.16■■■□□ 2.26
ATF5Q9Y2D1 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
ATF5Q9Y2D1 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
ATF5Q9Y2D1 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
ATF5Q9Y2D1 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
ATF5Q9Y2D1 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
ATF5Q9Y2D1 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
ATF5Q9Y2D1 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC29.15■■■□□ 2.26
ATF5Q9Y2D1 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
ATF5Q9Y2D1 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
ATF5Q9Y2D1 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
ATF5Q9Y2D1 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC29.15■■■□□ 2.26
ATF5Q9Y2D1 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
ATF5Q9Y2D1 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
ATF5Q9Y2D1 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
ATF5Q9Y2D1 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
ATF5Q9Y2D1 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
ATF5Q9Y2D1 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
ATF5Q9Y2D1 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC29.13■■■□□ 2.25
ATF5Q9Y2D1 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
ATF5Q9Y2D1 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
ATF5Q9Y2D1 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
ATF5Q9Y2D1 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
ATF5Q9Y2D1 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
ATF5Q9Y2D1 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
ATF5Q9Y2D1 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
ATF5Q9Y2D1 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
ATF5Q9Y2D1 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
ATF5Q9Y2D1 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
ATF5Q9Y2D1 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
ATF5Q9Y2D1 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
ATF5Q9Y2D1 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC29.11■■■□□ 2.25
ATF5Q9Y2D1 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
ATF5Q9Y2D1 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC29.11■■■□□ 2.25
ATF5Q9Y2D1 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC29.11■■■□□ 2.25
ATF5Q9Y2D1 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
ATF5Q9Y2D1 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
ATF5Q9Y2D1 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
ATF5Q9Y2D1 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC29.1■■■□□ 2.25
ATF5Q9Y2D1 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC29.1■■■□□ 2.25
ATF5Q9Y2D1 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
ATF5Q9Y2D1 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC29.09■■■□□ 2.25
ATF5Q9Y2D1 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
ATF5Q9Y2D1 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
ATF5Q9Y2D1 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
ATF5Q9Y2D1 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
ATF5Q9Y2D1 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
ATF5Q9Y2D1 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
ATF5Q9Y2D1 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
ATF5Q9Y2D1 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
ATF5Q9Y2D1 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.7 ms