Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y294

ASF1A, Histone chaperone ASF1A, humanhuman

Predictions only

Length 204 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ASF1AQ9Y294 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ASF1AQ9Y294 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
ASF1AQ9Y294 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
ASF1AQ9Y294 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ASF1AQ9Y294 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ASF1AQ9Y294 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ASF1AQ9Y294 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ASF1AQ9Y294 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ASF1AQ9Y294 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ASF1AQ9Y294 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ASF1AQ9Y294 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ASF1AQ9Y294 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ASF1AQ9Y294 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ASF1AQ9Y294 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ASF1AQ9Y294 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ASF1AQ9Y294 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ASF1AQ9Y294 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ASF1AQ9Y294 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ASF1AQ9Y294 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ASF1AQ9Y294 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ASF1AQ9Y294 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ASF1AQ9Y294 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ASF1AQ9Y294 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
ASF1AQ9Y294 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ASF1AQ9Y294 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ASF1AQ9Y294 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ASF1AQ9Y294 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ASF1AQ9Y294 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ASF1AQ9Y294 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ASF1AQ9Y294 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ASF1AQ9Y294 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ASF1AQ9Y294 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ASF1AQ9Y294 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ASF1AQ9Y294 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ASF1AQ9Y294 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ASF1AQ9Y294 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ASF1AQ9Y294 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ASF1AQ9Y294 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ASF1AQ9Y294 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
ASF1AQ9Y294 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
ASF1AQ9Y294 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ASF1AQ9Y294 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ASF1AQ9Y294 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ASF1AQ9Y294 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ASF1AQ9Y294 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ASF1AQ9Y294 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ASF1AQ9Y294 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ASF1AQ9Y294 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ASF1AQ9Y294 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ASF1AQ9Y294 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ASF1AQ9Y294 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ASF1AQ9Y294 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
ASF1AQ9Y294 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ASF1AQ9Y294 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ASF1AQ9Y294 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ASF1AQ9Y294 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ASF1AQ9Y294 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ASF1AQ9Y294 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ASF1AQ9Y294 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ASF1AQ9Y294 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ASF1AQ9Y294 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ASF1AQ9Y294 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ASF1AQ9Y294 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ASF1AQ9Y294 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ASF1AQ9Y294 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ASF1AQ9Y294 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ASF1AQ9Y294 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ASF1AQ9Y294 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ASF1AQ9Y294 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ASF1AQ9Y294 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ASF1AQ9Y294 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ASF1AQ9Y294 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ASF1AQ9Y294 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ASF1AQ9Y294 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ASF1AQ9Y294 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ASF1AQ9Y294 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
ASF1AQ9Y294 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
ASF1AQ9Y294 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
ASF1AQ9Y294 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
ASF1AQ9Y294 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
ASF1AQ9Y294 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ASF1AQ9Y294 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ASF1AQ9Y294 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ASF1AQ9Y294 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ASF1AQ9Y294 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ASF1AQ9Y294 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ASF1AQ9Y294 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ASF1AQ9Y294 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ASF1AQ9Y294 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ASF1AQ9Y294 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ASF1AQ9Y294 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ASF1AQ9Y294 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ASF1AQ9Y294 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ASF1AQ9Y294 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ASF1AQ9Y294 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ASF1AQ9Y294 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
ASF1AQ9Y294 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ASF1AQ9Y294 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ASF1AQ9Y294 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ASF1AQ9Y294 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.4 ms