Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y228

TRAF3IP3, TRAF3-interacting JNK-activating modulator, humanhuman

Predictions only

Length 551 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF3IP3Q9Y228 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TRAF3IP3Q9Y228 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TRAF3IP3Q9Y228 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TRAF3IP3Q9Y228 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TRAF3IP3Q9Y228 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TRAF3IP3Q9Y228 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TRAF3IP3Q9Y228 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TRAF3IP3Q9Y228 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
TRAF3IP3Q9Y228 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
TRAF3IP3Q9Y228 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TRAF3IP3Q9Y228 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TRAF3IP3Q9Y228 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TRAF3IP3Q9Y228 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TRAF3IP3Q9Y228 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TRAF3IP3Q9Y228 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
TRAF3IP3Q9Y228 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
TRAF3IP3Q9Y228 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC25.08■■□□□ 1.61
TRAF3IP3Q9Y228 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
TRAF3IP3Q9Y228 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
TRAF3IP3Q9Y228 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
TRAF3IP3Q9Y228 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.6
TRAF3IP3Q9Y228 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TRAF3IP3Q9Y228 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TRAF3IP3Q9Y228 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
TRAF3IP3Q9Y228 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TRAF3IP3Q9Y228 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
TRAF3IP3Q9Y228 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
TRAF3IP3Q9Y228 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
TRAF3IP3Q9Y228 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
TRAF3IP3Q9Y228 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
TRAF3IP3Q9Y228 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TRAF3IP3Q9Y228 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TRAF3IP3Q9Y228 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TRAF3IP3Q9Y228 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
TRAF3IP3Q9Y228 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TRAF3IP3Q9Y228 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
TRAF3IP3Q9Y228 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
TRAF3IP3Q9Y228 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TRAF3IP3Q9Y228 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
TRAF3IP3Q9Y228 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TRAF3IP3Q9Y228 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TRAF3IP3Q9Y228 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TRAF3IP3Q9Y228 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
TRAF3IP3Q9Y228 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
TRAF3IP3Q9Y228 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
TRAF3IP3Q9Y228 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TRAF3IP3Q9Y228 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
TRAF3IP3Q9Y228 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
TRAF3IP3Q9Y228 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TRAF3IP3Q9Y228 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TRAF3IP3Q9Y228 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
TRAF3IP3Q9Y228 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
TRAF3IP3Q9Y228 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TRAF3IP3Q9Y228 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
TRAF3IP3Q9Y228 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
TRAF3IP3Q9Y228 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TRAF3IP3Q9Y228 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
TRAF3IP3Q9Y228 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
TRAF3IP3Q9Y228 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TRAF3IP3Q9Y228 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TRAF3IP3Q9Y228 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
TRAF3IP3Q9Y228 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TRAF3IP3Q9Y228 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
TRAF3IP3Q9Y228 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
TRAF3IP3Q9Y228 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
TRAF3IP3Q9Y228 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
TRAF3IP3Q9Y228 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
TRAF3IP3Q9Y228 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
TRAF3IP3Q9Y228 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TRAF3IP3Q9Y228 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TRAF3IP3Q9Y228 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
TRAF3IP3Q9Y228 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TRAF3IP3Q9Y228 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TRAF3IP3Q9Y228 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
TRAF3IP3Q9Y228 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
TRAF3IP3Q9Y228 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TRAF3IP3Q9Y228 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TRAF3IP3Q9Y228 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TRAF3IP3Q9Y228 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TRAF3IP3Q9Y228 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TRAF3IP3Q9Y228 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TRAF3IP3Q9Y228 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TRAF3IP3Q9Y228 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
TRAF3IP3Q9Y228 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
TRAF3IP3Q9Y228 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC25■■□□□ 1.59
TRAF3IP3Q9Y228 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TRAF3IP3Q9Y228 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
TRAF3IP3Q9Y228 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TRAF3IP3Q9Y228 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
TRAF3IP3Q9Y228 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
TRAF3IP3Q9Y228 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TRAF3IP3Q9Y228 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TRAF3IP3Q9Y228 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC24.99■■□□□ 1.59
TRAF3IP3Q9Y228 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
TRAF3IP3Q9Y228 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
TRAF3IP3Q9Y228 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC24.99■■□□□ 1.59
TRAF3IP3Q9Y228 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TRAF3IP3Q9Y228 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TRAF3IP3Q9Y228 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TRAF3IP3Q9Y228 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms