Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQN3

CHMP2B, Charged multivesicular body protein 2b, humanhuman

Predictions only

Length 213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHMP2BQ9UQN3 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CHMP2BQ9UQN3 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CHMP2BQ9UQN3 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CHMP2BQ9UQN3 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CHMP2BQ9UQN3 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CHMP2BQ9UQN3 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CHMP2BQ9UQN3 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CHMP2BQ9UQN3 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CHMP2BQ9UQN3 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CHMP2BQ9UQN3 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CHMP2BQ9UQN3 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CHMP2BQ9UQN3 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CHMP2BQ9UQN3 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CHMP2BQ9UQN3 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CHMP2BQ9UQN3 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
CHMP2BQ9UQN3 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CHMP2BQ9UQN3 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CHMP2BQ9UQN3 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CHMP2BQ9UQN3 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CHMP2BQ9UQN3 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CHMP2BQ9UQN3 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CHMP2BQ9UQN3 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CHMP2BQ9UQN3 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CHMP2BQ9UQN3 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CHMP2BQ9UQN3 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CHMP2BQ9UQN3 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CHMP2BQ9UQN3 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CHMP2BQ9UQN3 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CHMP2BQ9UQN3 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CHMP2BQ9UQN3 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
CHMP2BQ9UQN3 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CHMP2BQ9UQN3 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
CHMP2BQ9UQN3 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CHMP2BQ9UQN3 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CHMP2BQ9UQN3 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CHMP2BQ9UQN3 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CHMP2BQ9UQN3 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CHMP2BQ9UQN3 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CHMP2BQ9UQN3 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CHMP2BQ9UQN3 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CHMP2BQ9UQN3 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CHMP2BQ9UQN3 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CHMP2BQ9UQN3 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CHMP2BQ9UQN3 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
CHMP2BQ9UQN3 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CHMP2BQ9UQN3 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CHMP2BQ9UQN3 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CHMP2BQ9UQN3 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CHMP2BQ9UQN3 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CHMP2BQ9UQN3 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CHMP2BQ9UQN3 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CHMP2BQ9UQN3 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
CHMP2BQ9UQN3 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CHMP2BQ9UQN3 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CHMP2BQ9UQN3 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CHMP2BQ9UQN3 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CHMP2BQ9UQN3 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CHMP2BQ9UQN3 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CHMP2BQ9UQN3 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CHMP2BQ9UQN3 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CHMP2BQ9UQN3 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CHMP2BQ9UQN3 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CHMP2BQ9UQN3 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
CHMP2BQ9UQN3 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CHMP2BQ9UQN3 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CHMP2BQ9UQN3 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CHMP2BQ9UQN3 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CHMP2BQ9UQN3 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CHMP2BQ9UQN3 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CHMP2BQ9UQN3 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CHMP2BQ9UQN3 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CHMP2BQ9UQN3 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CHMP2BQ9UQN3 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CHMP2BQ9UQN3 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CHMP2BQ9UQN3 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CHMP2BQ9UQN3 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CHMP2BQ9UQN3 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CHMP2BQ9UQN3 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CHMP2BQ9UQN3 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CHMP2BQ9UQN3 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CHMP2BQ9UQN3 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
CHMP2BQ9UQN3 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CHMP2BQ9UQN3 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CHMP2BQ9UQN3 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CHMP2BQ9UQN3 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CHMP2BQ9UQN3 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CHMP2BQ9UQN3 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CHMP2BQ9UQN3 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CHMP2BQ9UQN3 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CHMP2BQ9UQN3 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CHMP2BQ9UQN3 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CHMP2BQ9UQN3 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CHMP2BQ9UQN3 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
CHMP2BQ9UQN3 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CHMP2BQ9UQN3 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CHMP2BQ9UQN3 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
CHMP2BQ9UQN3 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CHMP2BQ9UQN3 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CHMP2BQ9UQN3 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CHMP2BQ9UQN3 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 147.1 ms