Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQ05

KCNH4, Potassium voltage-gated channel subfamily H member 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,017 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNH4Q9UQ05 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
KCNH4Q9UQ05 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
KCNH4Q9UQ05 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
KCNH4Q9UQ05 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
KCNH4Q9UQ05 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
KCNH4Q9UQ05 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
KCNH4Q9UQ05 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
KCNH4Q9UQ05 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
KCNH4Q9UQ05 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
KCNH4Q9UQ05 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
KCNH4Q9UQ05 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
KCNH4Q9UQ05 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
KCNH4Q9UQ05 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
KCNH4Q9UQ05 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
KCNH4Q9UQ05 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
KCNH4Q9UQ05 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC26.71■■□□□ 1.87
KCNH4Q9UQ05 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
KCNH4Q9UQ05 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
KCNH4Q9UQ05 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
KCNH4Q9UQ05 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
KCNH4Q9UQ05 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
KCNH4Q9UQ05 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
KCNH4Q9UQ05 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
KCNH4Q9UQ05 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
KCNH4Q9UQ05 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
KCNH4Q9UQ05 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
KCNH4Q9UQ05 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
KCNH4Q9UQ05 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
KCNH4Q9UQ05 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
KCNH4Q9UQ05 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
KCNH4Q9UQ05 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
KCNH4Q9UQ05 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
KCNH4Q9UQ05 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
KCNH4Q9UQ05 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
KCNH4Q9UQ05 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
KCNH4Q9UQ05 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
KCNH4Q9UQ05 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
KCNH4Q9UQ05 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
KCNH4Q9UQ05 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
KCNH4Q9UQ05 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
KCNH4Q9UQ05 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
KCNH4Q9UQ05 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
KCNH4Q9UQ05 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
KCNH4Q9UQ05 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
KCNH4Q9UQ05 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
KCNH4Q9UQ05 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
KCNH4Q9UQ05 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
KCNH4Q9UQ05 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
KCNH4Q9UQ05 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
KCNH4Q9UQ05 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC26.67■■□□□ 1.86
KCNH4Q9UQ05 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
KCNH4Q9UQ05 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
KCNH4Q9UQ05 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC26.67■■□□□ 1.86
KCNH4Q9UQ05 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
KCNH4Q9UQ05 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
KCNH4Q9UQ05 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
KCNH4Q9UQ05 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
KCNH4Q9UQ05 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
KCNH4Q9UQ05 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC26.66■■□□□ 1.86
KCNH4Q9UQ05 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
KCNH4Q9UQ05 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
KCNH4Q9UQ05 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC26.65■■□□□ 1.86
KCNH4Q9UQ05 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
KCNH4Q9UQ05 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
KCNH4Q9UQ05 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
KCNH4Q9UQ05 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
KCNH4Q9UQ05 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
KCNH4Q9UQ05 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
KCNH4Q9UQ05 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
KCNH4Q9UQ05 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
KCNH4Q9UQ05 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
KCNH4Q9UQ05 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
KCNH4Q9UQ05 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
KCNH4Q9UQ05 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
KCNH4Q9UQ05 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
KCNH4Q9UQ05 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
KCNH4Q9UQ05 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
KCNH4Q9UQ05 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
KCNH4Q9UQ05 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
KCNH4Q9UQ05 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
KCNH4Q9UQ05 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
KCNH4Q9UQ05 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
KCNH4Q9UQ05 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
KCNH4Q9UQ05 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
KCNH4Q9UQ05 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
KCNH4Q9UQ05 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
KCNH4Q9UQ05 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
KCNH4Q9UQ05 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC26.61■■□□□ 1.85
KCNH4Q9UQ05 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
KCNH4Q9UQ05 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
KCNH4Q9UQ05 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
KCNH4Q9UQ05 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
KCNH4Q9UQ05 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
KCNH4Q9UQ05 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
KCNH4Q9UQ05 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC26.6■■□□□ 1.85
KCNH4Q9UQ05 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
KCNH4Q9UQ05 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
KCNH4Q9UQ05 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
KCNH4Q9UQ05 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
KCNH4Q9UQ05 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms