Protein–RNA interactions for Protein: Q9UNG2

TNFSF18, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 18, humanhuman

Predictions only

Length 199 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFSF18Q9UNG2 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
TNFSF18Q9UNG2 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TNFSF18Q9UNG2 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TNFSF18Q9UNG2 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TNFSF18Q9UNG2 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TNFSF18Q9UNG2 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TNFSF18Q9UNG2 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TNFSF18Q9UNG2 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TNFSF18Q9UNG2 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
TNFSF18Q9UNG2 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
TNFSF18Q9UNG2 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
TNFSF18Q9UNG2 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TNFSF18Q9UNG2 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TNFSF18Q9UNG2 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TNFSF18Q9UNG2 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TNFSF18Q9UNG2 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TNFSF18Q9UNG2 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TNFSF18Q9UNG2 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TNFSF18Q9UNG2 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TNFSF18Q9UNG2 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TNFSF18Q9UNG2 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TNFSF18Q9UNG2 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TNFSF18Q9UNG2 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TNFSF18Q9UNG2 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TNFSF18Q9UNG2 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TNFSF18Q9UNG2 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TNFSF18Q9UNG2 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TNFSF18Q9UNG2 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TNFSF18Q9UNG2 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TNFSF18Q9UNG2 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TNFSF18Q9UNG2 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TNFSF18Q9UNG2 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TNFSF18Q9UNG2 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TNFSF18Q9UNG2 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
TNFSF18Q9UNG2 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
TNFSF18Q9UNG2 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
TNFSF18Q9UNG2 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TNFSF18Q9UNG2 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
TNFSF18Q9UNG2 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
TNFSF18Q9UNG2 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
TNFSF18Q9UNG2 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TNFSF18Q9UNG2 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
TNFSF18Q9UNG2 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TNFSF18Q9UNG2 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
TNFSF18Q9UNG2 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
TNFSF18Q9UNG2 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
TNFSF18Q9UNG2 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
TNFSF18Q9UNG2 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TNFSF18Q9UNG2 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TNFSF18Q9UNG2 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TNFSF18Q9UNG2 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
TNFSF18Q9UNG2 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TNFSF18Q9UNG2 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
TNFSF18Q9UNG2 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TNFSF18Q9UNG2 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TNFSF18Q9UNG2 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TNFSF18Q9UNG2 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
TNFSF18Q9UNG2 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TNFSF18Q9UNG2 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
TNFSF18Q9UNG2 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TNFSF18Q9UNG2 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TNFSF18Q9UNG2 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TNFSF18Q9UNG2 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
TNFSF18Q9UNG2 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TNFSF18Q9UNG2 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
TNFSF18Q9UNG2 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TNFSF18Q9UNG2 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
TNFSF18Q9UNG2 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
TNFSF18Q9UNG2 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TNFSF18Q9UNG2 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
TNFSF18Q9UNG2 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TNFSF18Q9UNG2 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TNFSF18Q9UNG2 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TNFSF18Q9UNG2 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
TNFSF18Q9UNG2 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TNFSF18Q9UNG2 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TNFSF18Q9UNG2 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TNFSF18Q9UNG2 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
TNFSF18Q9UNG2 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
TNFSF18Q9UNG2 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TNFSF18Q9UNG2 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
TNFSF18Q9UNG2 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TNFSF18Q9UNG2 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
TNFSF18Q9UNG2 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TNFSF18Q9UNG2 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TNFSF18Q9UNG2 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
TNFSF18Q9UNG2 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TNFSF18Q9UNG2 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TNFSF18Q9UNG2 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TNFSF18Q9UNG2 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
TNFSF18Q9UNG2 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
TNFSF18Q9UNG2 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
TNFSF18Q9UNG2 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
TNFSF18Q9UNG2 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
TNFSF18Q9UNG2 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
TNFSF18Q9UNG2 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
TNFSF18Q9UNG2 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
TNFSF18Q9UNG2 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
TNFSF18Q9UNG2 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
TNFSF18Q9UNG2 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.2 ms