Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMY4

SNX12, Sorting nexin-12, humanhuman

Predictions only

Length 172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX12Q9UMY4 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
SNX12Q9UMY4 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
SNX12Q9UMY4 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SNX12Q9UMY4 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SNX12Q9UMY4 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SNX12Q9UMY4 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
SNX12Q9UMY4 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SNX12Q9UMY4 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SNX12Q9UMY4 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SNX12Q9UMY4 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SNX12Q9UMY4 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SNX12Q9UMY4 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SNX12Q9UMY4 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SNX12Q9UMY4 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SNX12Q9UMY4 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SNX12Q9UMY4 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SNX12Q9UMY4 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SNX12Q9UMY4 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SNX12Q9UMY4 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SNX12Q9UMY4 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SNX12Q9UMY4 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SNX12Q9UMY4 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
SNX12Q9UMY4 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SNX12Q9UMY4 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SNX12Q9UMY4 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SNX12Q9UMY4 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SNX12Q9UMY4 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SNX12Q9UMY4 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SNX12Q9UMY4 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SNX12Q9UMY4 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
SNX12Q9UMY4 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SNX12Q9UMY4 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
SNX12Q9UMY4 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SNX12Q9UMY4 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SNX12Q9UMY4 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SNX12Q9UMY4 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SNX12Q9UMY4 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SNX12Q9UMY4 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SNX12Q9UMY4 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SNX12Q9UMY4 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SNX12Q9UMY4 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SNX12Q9UMY4 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SNX12Q9UMY4 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SNX12Q9UMY4 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SNX12Q9UMY4 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SNX12Q9UMY4 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SNX12Q9UMY4 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SNX12Q9UMY4 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SNX12Q9UMY4 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
SNX12Q9UMY4 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SNX12Q9UMY4 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SNX12Q9UMY4 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SNX12Q9UMY4 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SNX12Q9UMY4 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SNX12Q9UMY4 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SNX12Q9UMY4 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SNX12Q9UMY4 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SNX12Q9UMY4 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SNX12Q9UMY4 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SNX12Q9UMY4 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SNX12Q9UMY4 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SNX12Q9UMY4 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SNX12Q9UMY4 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
SNX12Q9UMY4 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
SNX12Q9UMY4 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
SNX12Q9UMY4 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
SNX12Q9UMY4 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
SNX12Q9UMY4 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SNX12Q9UMY4 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SNX12Q9UMY4 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SNX12Q9UMY4 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SNX12Q9UMY4 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SNX12Q9UMY4 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SNX12Q9UMY4 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SNX12Q9UMY4 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SNX12Q9UMY4 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SNX12Q9UMY4 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SNX12Q9UMY4 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SNX12Q9UMY4 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SNX12Q9UMY4 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SNX12Q9UMY4 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SNX12Q9UMY4 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SNX12Q9UMY4 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SNX12Q9UMY4 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SNX12Q9UMY4 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SNX12Q9UMY4 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SNX12Q9UMY4 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SNX12Q9UMY4 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SNX12Q9UMY4 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SNX12Q9UMY4 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SNX12Q9UMY4 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SNX12Q9UMY4 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SNX12Q9UMY4 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SNX12Q9UMY4 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SNX12Q9UMY4 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SNX12Q9UMY4 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SNX12Q9UMY4 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SNX12Q9UMY4 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SNX12Q9UMY4 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SNX12Q9UMY4 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms