Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMS4

PRPF19, Pre-mRNA-processing factor 19, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 504 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF19Q9UMS4 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PRPF19Q9UMS4 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PRPF19Q9UMS4 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PRPF19Q9UMS4 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PRPF19Q9UMS4 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PRPF19Q9UMS4 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
PRPF19Q9UMS4 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PRPF19Q9UMS4 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PRPF19Q9UMS4 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PRPF19Q9UMS4 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PRPF19Q9UMS4 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PRPF19Q9UMS4 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PRPF19Q9UMS4 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PRPF19Q9UMS4 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PRPF19Q9UMS4 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PRPF19Q9UMS4 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PRPF19Q9UMS4 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PRPF19Q9UMS4 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PRPF19Q9UMS4 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PRPF19Q9UMS4 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PRPF19Q9UMS4 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PRPF19Q9UMS4 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PRPF19Q9UMS4 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PRPF19Q9UMS4 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PRPF19Q9UMS4 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
PRPF19Q9UMS4 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
PRPF19Q9UMS4 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
PRPF19Q9UMS4 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
PRPF19Q9UMS4 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PRPF19Q9UMS4 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PRPF19Q9UMS4 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PRPF19Q9UMS4 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PRPF19Q9UMS4 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PRPF19Q9UMS4 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PRPF19Q9UMS4 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PRPF19Q9UMS4 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PRPF19Q9UMS4 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PRPF19Q9UMS4 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PRPF19Q9UMS4 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PRPF19Q9UMS4 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PRPF19Q9UMS4 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PRPF19Q9UMS4 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PRPF19Q9UMS4 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PRPF19Q9UMS4 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PRPF19Q9UMS4 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PRPF19Q9UMS4 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PRPF19Q9UMS4 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PRPF19Q9UMS4 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PRPF19Q9UMS4 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PRPF19Q9UMS4 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PRPF19Q9UMS4 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PRPF19Q9UMS4 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PRPF19Q9UMS4 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PRPF19Q9UMS4 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PRPF19Q9UMS4 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
PRPF19Q9UMS4 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PRPF19Q9UMS4 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PRPF19Q9UMS4 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PRPF19Q9UMS4 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PRPF19Q9UMS4 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PRPF19Q9UMS4 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PRPF19Q9UMS4 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PRPF19Q9UMS4 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PRPF19Q9UMS4 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PRPF19Q9UMS4 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PRPF19Q9UMS4 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PRPF19Q9UMS4 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
PRPF19Q9UMS4 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PRPF19Q9UMS4 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PRPF19Q9UMS4 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PRPF19Q9UMS4 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PRPF19Q9UMS4 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PRPF19Q9UMS4 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PRPF19Q9UMS4 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PRPF19Q9UMS4 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PRPF19Q9UMS4 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
PRPF19Q9UMS4 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PRPF19Q9UMS4 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PRPF19Q9UMS4 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PRPF19Q9UMS4 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PRPF19Q9UMS4 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PRPF19Q9UMS4 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PRPF19Q9UMS4 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PRPF19Q9UMS4 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
PRPF19Q9UMS4 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PRPF19Q9UMS4 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PRPF19Q9UMS4 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PRPF19Q9UMS4 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PRPF19Q9UMS4 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PRPF19Q9UMS4 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PRPF19Q9UMS4 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
PRPF19Q9UMS4 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PRPF19Q9UMS4 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PRPF19Q9UMS4 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PRPF19Q9UMS4 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PRPF19Q9UMS4 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PRPF19Q9UMS4 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
PRPF19Q9UMS4 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PRPF19Q9UMS4 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PRPF19Q9UMS4 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms