Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULV3

CIZ1, Cip1-interacting zinc finger protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 898 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CIZ1Q9ULV3 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CIZ1Q9ULV3 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
CIZ1Q9ULV3 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
CIZ1Q9ULV3 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
CIZ1Q9ULV3 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
CIZ1Q9ULV3 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CIZ1Q9ULV3 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
CIZ1Q9ULV3 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
CIZ1Q9ULV3 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
CIZ1Q9ULV3 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
CIZ1Q9ULV3 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
CIZ1Q9ULV3 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
CIZ1Q9ULV3 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
CIZ1Q9ULV3 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CIZ1Q9ULV3 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CIZ1Q9ULV3 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CIZ1Q9ULV3 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CIZ1Q9ULV3 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CIZ1Q9ULV3 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
CIZ1Q9ULV3 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC26.9■■□□□ 1.9
CIZ1Q9ULV3 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC26.9■■□□□ 1.9
CIZ1Q9ULV3 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CIZ1Q9ULV3 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
CIZ1Q9ULV3 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
CIZ1Q9ULV3 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
CIZ1Q9ULV3 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
CIZ1Q9ULV3 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
CIZ1Q9ULV3 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
CIZ1Q9ULV3 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
CIZ1Q9ULV3 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
CIZ1Q9ULV3 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
CIZ1Q9ULV3 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.89
CIZ1Q9ULV3 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CIZ1Q9ULV3 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CIZ1Q9ULV3 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CIZ1Q9ULV3 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CIZ1Q9ULV3 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CIZ1Q9ULV3 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CIZ1Q9ULV3 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
CIZ1Q9ULV3 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CIZ1Q9ULV3 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC26.88■■□□□ 1.89
CIZ1Q9ULV3 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CIZ1Q9ULV3 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
CIZ1Q9ULV3 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
CIZ1Q9ULV3 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CIZ1Q9ULV3 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
CIZ1Q9ULV3 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CIZ1Q9ULV3 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CIZ1Q9ULV3 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CIZ1Q9ULV3 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CIZ1Q9ULV3 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CIZ1Q9ULV3 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CIZ1Q9ULV3 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CIZ1Q9ULV3 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CIZ1Q9ULV3 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CIZ1Q9ULV3 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CIZ1Q9ULV3 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CIZ1Q9ULV3 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
CIZ1Q9ULV3 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
CIZ1Q9ULV3 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
CIZ1Q9ULV3 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC26.86■■□□□ 1.89
CIZ1Q9ULV3 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC26.86■■□□□ 1.89
CIZ1Q9ULV3 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CIZ1Q9ULV3 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
CIZ1Q9ULV3 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CIZ1Q9ULV3 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
CIZ1Q9ULV3 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
CIZ1Q9ULV3 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CIZ1Q9ULV3 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CIZ1Q9ULV3 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CIZ1Q9ULV3 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CIZ1Q9ULV3 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
CIZ1Q9ULV3 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CIZ1Q9ULV3 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CIZ1Q9ULV3 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CIZ1Q9ULV3 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CIZ1Q9ULV3 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CIZ1Q9ULV3 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CIZ1Q9ULV3 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CIZ1Q9ULV3 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
CIZ1Q9ULV3 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
CIZ1Q9ULV3 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CIZ1Q9ULV3 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC26.83■■□□□ 1.89
CIZ1Q9ULV3 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
CIZ1Q9ULV3 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CIZ1Q9ULV3 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CIZ1Q9ULV3 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CIZ1Q9ULV3 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CIZ1Q9ULV3 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CIZ1Q9ULV3 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CIZ1Q9ULV3 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CIZ1Q9ULV3 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CIZ1Q9ULV3 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CIZ1Q9ULV3 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CIZ1Q9ULV3 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CIZ1Q9ULV3 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CIZ1Q9ULV3 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CIZ1Q9ULV3 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CIZ1Q9ULV3 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CIZ1Q9ULV3 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.6 ms