Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULT6

ZNRF3, E3 ubiquitin-protein ligase ZNRF3, humanhuman

Predictions only

Length 936 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNRF3Q9ULT6 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
ZNRF3Q9ULT6 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
ZNRF3Q9ULT6 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
ZNRF3Q9ULT6 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
ZNRF3Q9ULT6 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
ZNRF3Q9ULT6 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
ZNRF3Q9ULT6 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
ZNRF3Q9ULT6 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
ZNRF3Q9ULT6 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
ZNRF3Q9ULT6 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
ZNRF3Q9ULT6 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
ZNRF3Q9ULT6 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
ZNRF3Q9ULT6 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC27.87■■■□□ 2.05
ZNRF3Q9ULT6 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
ZNRF3Q9ULT6 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
ZNRF3Q9ULT6 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
ZNRF3Q9ULT6 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
ZNRF3Q9ULT6 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
ZNRF3Q9ULT6 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
ZNRF3Q9ULT6 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
ZNRF3Q9ULT6 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
ZNRF3Q9ULT6 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
ZNRF3Q9ULT6 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC27.86■■■□□ 2.05
ZNRF3Q9ULT6 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
ZNRF3Q9ULT6 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
ZNRF3Q9ULT6 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC27.86■■■□□ 2.05
ZNRF3Q9ULT6 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
ZNRF3Q9ULT6 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
ZNRF3Q9ULT6 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
ZNRF3Q9ULT6 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
ZNRF3Q9ULT6 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
ZNRF3Q9ULT6 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
ZNRF3Q9ULT6 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC27.85■■■□□ 2.05
ZNRF3Q9ULT6 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
ZNRF3Q9ULT6 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC27.85■■■□□ 2.05
ZNRF3Q9ULT6 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
ZNRF3Q9ULT6 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
ZNRF3Q9ULT6 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
ZNRF3Q9ULT6 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
ZNRF3Q9ULT6 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
ZNRF3Q9ULT6 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
ZNRF3Q9ULT6 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
ZNRF3Q9ULT6 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
ZNRF3Q9ULT6 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
ZNRF3Q9ULT6 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
ZNRF3Q9ULT6 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
ZNRF3Q9ULT6 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
ZNRF3Q9ULT6 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
ZNRF3Q9ULT6 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
ZNRF3Q9ULT6 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
ZNRF3Q9ULT6 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
ZNRF3Q9ULT6 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.83■■■□□ 2.05
ZNRF3Q9ULT6 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
ZNRF3Q9ULT6 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
ZNRF3Q9ULT6 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
ZNRF3Q9ULT6 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
ZNRF3Q9ULT6 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
ZNRF3Q9ULT6 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
ZNRF3Q9ULT6 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
ZNRF3Q9ULT6 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC27.81■■■□□ 2.04
ZNRF3Q9ULT6 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
ZNRF3Q9ULT6 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
ZNRF3Q9ULT6 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
ZNRF3Q9ULT6 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC27.81■■■□□ 2.04
ZNRF3Q9ULT6 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC27.81■■■□□ 2.04
ZNRF3Q9ULT6 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
ZNRF3Q9ULT6 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
ZNRF3Q9ULT6 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
ZNRF3Q9ULT6 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
ZNRF3Q9ULT6 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
ZNRF3Q9ULT6 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
ZNRF3Q9ULT6 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
ZNRF3Q9ULT6 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
ZNRF3Q9ULT6 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
ZNRF3Q9ULT6 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
ZNRF3Q9ULT6 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
ZNRF3Q9ULT6 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
ZNRF3Q9ULT6 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
ZNRF3Q9ULT6 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
ZNRF3Q9ULT6 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
ZNRF3Q9ULT6 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
ZNRF3Q9ULT6 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
ZNRF3Q9ULT6 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
ZNRF3Q9ULT6 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
ZNRF3Q9ULT6 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
ZNRF3Q9ULT6 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
ZNRF3Q9ULT6 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
ZNRF3Q9ULT6 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
ZNRF3Q9ULT6 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
ZNRF3Q9ULT6 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
ZNRF3Q9ULT6 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
ZNRF3Q9ULT6 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.77■■■□□ 2.04
ZNRF3Q9ULT6 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC27.77■■■□□ 2.04
ZNRF3Q9ULT6 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
ZNRF3Q9ULT6 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
ZNRF3Q9ULT6 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
ZNRF3Q9ULT6 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC27.76■■■□□ 2.03
ZNRF3Q9ULT6 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
ZNRF3Q9ULT6 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
ZNRF3Q9ULT6 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms