Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULG1

INO80, DNA helicase INO80, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,556 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
INO80Q9ULG1 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.56■■■■□ 3.12
INO80Q9ULG1 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC34.56■■■■□ 3.12
INO80Q9ULG1 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.56■■■■□ 3.12
INO80Q9ULG1 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC34.55■■■■□ 3.12
INO80Q9ULG1 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC34.55■■■■□ 3.12
INO80Q9ULG1 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.55■■■■□ 3.12
INO80Q9ULG1 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC34.55■■■■□ 3.12
INO80Q9ULG1 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC34.54■■■■□ 3.12
INO80Q9ULG1 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC34.54■■■■□ 3.12
INO80Q9ULG1 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC34.54■■■■□ 3.12
INO80Q9ULG1 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC34.54■■■■□ 3.12
INO80Q9ULG1 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC34.54■■■■□ 3.12
INO80Q9ULG1 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC34.53■■■■□ 3.12
INO80Q9ULG1 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC34.53■■■■□ 3.12
INO80Q9ULG1 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.53■■■■□ 3.12
INO80Q9ULG1 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC34.53■■■■□ 3.12
INO80Q9ULG1 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC34.53■■■■□ 3.12
INO80Q9ULG1 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.53■■■■□ 3.12
INO80Q9ULG1 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.53■■■■□ 3.12
INO80Q9ULG1 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC34.53■■■■□ 3.12
INO80Q9ULG1 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC34.53■■■■□ 3.12
INO80Q9ULG1 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC34.53■■■■□ 3.12
INO80Q9ULG1 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.53■■■■□ 3.12
INO80Q9ULG1 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.52■■■■□ 3.12
INO80Q9ULG1 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.52■■■■□ 3.12
INO80Q9ULG1 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.52■■■■□ 3.12
INO80Q9ULG1 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC34.52■■■■□ 3.12
INO80Q9ULG1 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC34.52■■■■□ 3.12
INO80Q9ULG1 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC34.52■■■■□ 3.12
INO80Q9ULG1 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.52■■■■□ 3.12
INO80Q9ULG1 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.51■■■■□ 3.12
INO80Q9ULG1 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.51■■■■□ 3.12
INO80Q9ULG1 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.51■■■■□ 3.12
INO80Q9ULG1 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.51■■■■□ 3.12
INO80Q9ULG1 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC34.51■■■■□ 3.12
INO80Q9ULG1 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC34.51■■■■□ 3.11
INO80Q9ULG1 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.51■■■■□ 3.11
INO80Q9ULG1 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.5■■■■□ 3.11
INO80Q9ULG1 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC34.5■■■■□ 3.11
INO80Q9ULG1 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC34.5■■■■□ 3.11
INO80Q9ULG1 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC34.5■■■■□ 3.11
INO80Q9ULG1 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.5■■■■□ 3.11
INO80Q9ULG1 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
INO80Q9ULG1 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC34.49■■■■□ 3.11
INO80Q9ULG1 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC34.49■■■■□ 3.11
INO80Q9ULG1 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
INO80Q9ULG1 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
INO80Q9ULG1 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
INO80Q9ULG1 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC34.49■■■■□ 3.11
INO80Q9ULG1 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC34.49■■■■□ 3.11
INO80Q9ULG1 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC34.49■■■■□ 3.11
INO80Q9ULG1 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.49■■■■□ 3.11
INO80Q9ULG1 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC34.49■■■■□ 3.11
INO80Q9ULG1 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC34.48■■■■□ 3.11
INO80Q9ULG1 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.48■■■■□ 3.11
INO80Q9ULG1 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
INO80Q9ULG1 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
INO80Q9ULG1 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC34.48■■■■□ 3.11
INO80Q9ULG1 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC34.48■■■■□ 3.11
INO80Q9ULG1 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC34.48■■■■□ 3.11
INO80Q9ULG1 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC34.48■■■■□ 3.11
INO80Q9ULG1 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC34.48■■■■□ 3.11
INO80Q9ULG1 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
INO80Q9ULG1 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC34.47■■■■□ 3.11
INO80Q9ULG1 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC34.47■■■■□ 3.11
INO80Q9ULG1 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC34.46■■■■□ 3.11
INO80Q9ULG1 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC34.46■■■■□ 3.11
INO80Q9ULG1 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC34.46■■■■□ 3.11
INO80Q9ULG1 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC34.45■■■■□ 3.1
INO80Q9ULG1 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC34.45■■■■□ 3.1
INO80Q9ULG1 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.44■■■■□ 3.1
INO80Q9ULG1 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC34.44■■■■□ 3.1
INO80Q9ULG1 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC34.44■■■■□ 3.1
INO80Q9ULG1 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC34.44■■■■□ 3.1
INO80Q9ULG1 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC34.44■■■■□ 3.1
INO80Q9ULG1 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC34.44■■■■□ 3.1
INO80Q9ULG1 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC34.44■■■■□ 3.1
INO80Q9ULG1 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC34.44■■■■□ 3.1
INO80Q9ULG1 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC34.44■■■■□ 3.1
INO80Q9ULG1 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC34.44■■■■□ 3.1
INO80Q9ULG1 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC34.44■■■■□ 3.1
INO80Q9ULG1 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC34.44■■■■□ 3.1
INO80Q9ULG1 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC34.44■■■■□ 3.1
INO80Q9ULG1 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.43■■■■□ 3.1
INO80Q9ULG1 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC34.43■■■■□ 3.1
INO80Q9ULG1 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC34.43■■■■□ 3.1
INO80Q9ULG1 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.43■■■■□ 3.1
INO80Q9ULG1 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.43■■■■□ 3.1
INO80Q9ULG1 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC34.43■■■■□ 3.1
INO80Q9ULG1 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC34.42■■■■□ 3.1
INO80Q9ULG1 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
INO80Q9ULG1 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC34.42■■■■□ 3.1
INO80Q9ULG1 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
INO80Q9ULG1 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
INO80Q9ULG1 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC34.42■■■■□ 3.1
INO80Q9ULG1 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC34.42■■■■□ 3.1
INO80Q9ULG1 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
INO80Q9ULG1 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC34.41■■■■□ 3.1
INO80Q9ULG1 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC34.41■■■■□ 3.1
INO80Q9ULG1 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC34.41■■■■□ 3.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.7 ms