Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKU7

ACAD8, Isobutyryl-CoA dehydrogenase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 415 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACAD8Q9UKU7 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ACAD8Q9UKU7 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ACAD8Q9UKU7 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ACAD8Q9UKU7 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ACAD8Q9UKU7 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ACAD8Q9UKU7 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ACAD8Q9UKU7 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ACAD8Q9UKU7 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ACAD8Q9UKU7 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
ACAD8Q9UKU7 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ACAD8Q9UKU7 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ACAD8Q9UKU7 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ACAD8Q9UKU7 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ACAD8Q9UKU7 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ACAD8Q9UKU7 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ACAD8Q9UKU7 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ACAD8Q9UKU7 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ACAD8Q9UKU7 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ACAD8Q9UKU7 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ACAD8Q9UKU7 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
ACAD8Q9UKU7 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ACAD8Q9UKU7 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ACAD8Q9UKU7 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ACAD8Q9UKU7 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ACAD8Q9UKU7 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ACAD8Q9UKU7 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ACAD8Q9UKU7 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ACAD8Q9UKU7 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ACAD8Q9UKU7 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ACAD8Q9UKU7 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ACAD8Q9UKU7 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ACAD8Q9UKU7 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ACAD8Q9UKU7 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ACAD8Q9UKU7 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ACAD8Q9UKU7 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ACAD8Q9UKU7 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ACAD8Q9UKU7 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ACAD8Q9UKU7 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ACAD8Q9UKU7 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
ACAD8Q9UKU7 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
ACAD8Q9UKU7 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
ACAD8Q9UKU7 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
ACAD8Q9UKU7 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
ACAD8Q9UKU7 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ACAD8Q9UKU7 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
ACAD8Q9UKU7 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ACAD8Q9UKU7 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ACAD8Q9UKU7 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
ACAD8Q9UKU7 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
ACAD8Q9UKU7 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
ACAD8Q9UKU7 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
ACAD8Q9UKU7 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
ACAD8Q9UKU7 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
ACAD8Q9UKU7 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ACAD8Q9UKU7 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
ACAD8Q9UKU7 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
ACAD8Q9UKU7 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
ACAD8Q9UKU7 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ACAD8Q9UKU7 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
ACAD8Q9UKU7 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
ACAD8Q9UKU7 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
ACAD8Q9UKU7 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
ACAD8Q9UKU7 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
ACAD8Q9UKU7 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ACAD8Q9UKU7 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ACAD8Q9UKU7 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ACAD8Q9UKU7 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
ACAD8Q9UKU7 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ACAD8Q9UKU7 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ACAD8Q9UKU7 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ACAD8Q9UKU7 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ACAD8Q9UKU7 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ACAD8Q9UKU7 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ACAD8Q9UKU7 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC21.3■■□□□ 1
ACAD8Q9UKU7 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ACAD8Q9UKU7 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ACAD8Q9UKU7 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ACAD8Q9UKU7 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ACAD8Q9UKU7 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ACAD8Q9UKU7 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ACAD8Q9UKU7 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ACAD8Q9UKU7 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ACAD8Q9UKU7 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ACAD8Q9UKU7 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
ACAD8Q9UKU7 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
ACAD8Q9UKU7 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ACAD8Q9UKU7 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ACAD8Q9UKU7 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ACAD8Q9UKU7 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ACAD8Q9UKU7 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ACAD8Q9UKU7 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
ACAD8Q9UKU7 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ACAD8Q9UKU7 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
ACAD8Q9UKU7 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ACAD8Q9UKU7 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ACAD8Q9UKU7 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ACAD8Q9UKU7 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ACAD8Q9UKU7 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ACAD8Q9UKU7 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
ACAD8Q9UKU7 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms