Protein–RNA interactions for Protein: Q9UK00

C3orf18, Uncharacterized protein C3orf18, humanhuman

Predictions only

Length 162 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C3orf18Q9UK00 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
C3orf18Q9UK00 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
C3orf18Q9UK00 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
C3orf18Q9UK00 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
C3orf18Q9UK00 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
C3orf18Q9UK00 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
C3orf18Q9UK00 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
C3orf18Q9UK00 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
C3orf18Q9UK00 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
C3orf18Q9UK00 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
C3orf18Q9UK00 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
C3orf18Q9UK00 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
C3orf18Q9UK00 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
C3orf18Q9UK00 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
C3orf18Q9UK00 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
C3orf18Q9UK00 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
C3orf18Q9UK00 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
C3orf18Q9UK00 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
C3orf18Q9UK00 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC22.01■■□□□ 1.11
C3orf18Q9UK00 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
C3orf18Q9UK00 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
C3orf18Q9UK00 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
C3orf18Q9UK00 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
C3orf18Q9UK00 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC22■■□□□ 1.11
C3orf18Q9UK00 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
C3orf18Q9UK00 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
C3orf18Q9UK00 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
C3orf18Q9UK00 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
C3orf18Q9UK00 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC22■■□□□ 1.11
C3orf18Q9UK00 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC22■■□□□ 1.11
C3orf18Q9UK00 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
C3orf18Q9UK00 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
C3orf18Q9UK00 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
C3orf18Q9UK00 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
C3orf18Q9UK00 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
C3orf18Q9UK00 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
C3orf18Q9UK00 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
C3orf18Q9UK00 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
C3orf18Q9UK00 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
C3orf18Q9UK00 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
C3orf18Q9UK00 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
C3orf18Q9UK00 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
C3orf18Q9UK00 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
C3orf18Q9UK00 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
C3orf18Q9UK00 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
C3orf18Q9UK00 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
C3orf18Q9UK00 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
C3orf18Q9UK00 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
C3orf18Q9UK00 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
C3orf18Q9UK00 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
C3orf18Q9UK00 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
C3orf18Q9UK00 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
C3orf18Q9UK00 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
C3orf18Q9UK00 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
C3orf18Q9UK00 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
C3orf18Q9UK00 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
C3orf18Q9UK00 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
C3orf18Q9UK00 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
C3orf18Q9UK00 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
C3orf18Q9UK00 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
C3orf18Q9UK00 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
C3orf18Q9UK00 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
C3orf18Q9UK00 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
C3orf18Q9UK00 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
C3orf18Q9UK00 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
C3orf18Q9UK00 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
C3orf18Q9UK00 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
C3orf18Q9UK00 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
C3orf18Q9UK00 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
C3orf18Q9UK00 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
C3orf18Q9UK00 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
C3orf18Q9UK00 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
C3orf18Q9UK00 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
C3orf18Q9UK00 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
C3orf18Q9UK00 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
C3orf18Q9UK00 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
C3orf18Q9UK00 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
C3orf18Q9UK00 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
C3orf18Q9UK00 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
C3orf18Q9UK00 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
C3orf18Q9UK00 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
C3orf18Q9UK00 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
C3orf18Q9UK00 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
C3orf18Q9UK00 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
C3orf18Q9UK00 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
C3orf18Q9UK00 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
C3orf18Q9UK00 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
C3orf18Q9UK00 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
C3orf18Q9UK00 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
C3orf18Q9UK00 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
C3orf18Q9UK00 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
C3orf18Q9UK00 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
C3orf18Q9UK00 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
C3orf18Q9UK00 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
C3orf18Q9UK00 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
C3orf18Q9UK00 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
C3orf18Q9UK00 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
C3orf18Q9UK00 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
C3orf18Q9UK00 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
C3orf18Q9UK00 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17 ms