Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJK0

TSR3, Ribosome biogenesis protein TSR3 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSR3Q9UJK0 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TSR3Q9UJK0 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TSR3Q9UJK0 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
TSR3Q9UJK0 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TSR3Q9UJK0 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TSR3Q9UJK0 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TSR3Q9UJK0 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TSR3Q9UJK0 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TSR3Q9UJK0 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TSR3Q9UJK0 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TSR3Q9UJK0 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TSR3Q9UJK0 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TSR3Q9UJK0 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TSR3Q9UJK0 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TSR3Q9UJK0 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TSR3Q9UJK0 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TSR3Q9UJK0 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TSR3Q9UJK0 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
TSR3Q9UJK0 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TSR3Q9UJK0 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TSR3Q9UJK0 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TSR3Q9UJK0 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TSR3Q9UJK0 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TSR3Q9UJK0 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
TSR3Q9UJK0 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
TSR3Q9UJK0 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.2
TSR3Q9UJK0 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TSR3Q9UJK0 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TSR3Q9UJK0 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TSR3Q9UJK0 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TSR3Q9UJK0 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TSR3Q9UJK0 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TSR3Q9UJK0 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TSR3Q9UJK0 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TSR3Q9UJK0 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TSR3Q9UJK0 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TSR3Q9UJK0 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TSR3Q9UJK0 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TSR3Q9UJK0 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TSR3Q9UJK0 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TSR3Q9UJK0 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TSR3Q9UJK0 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
TSR3Q9UJK0 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TSR3Q9UJK0 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TSR3Q9UJK0 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TSR3Q9UJK0 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TSR3Q9UJK0 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TSR3Q9UJK0 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TSR3Q9UJK0 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TSR3Q9UJK0 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TSR3Q9UJK0 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TSR3Q9UJK0 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TSR3Q9UJK0 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TSR3Q9UJK0 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TSR3Q9UJK0 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TSR3Q9UJK0 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TSR3Q9UJK0 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TSR3Q9UJK0 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TSR3Q9UJK0 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TSR3Q9UJK0 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TSR3Q9UJK0 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TSR3Q9UJK0 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TSR3Q9UJK0 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TSR3Q9UJK0 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TSR3Q9UJK0 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TSR3Q9UJK0 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TSR3Q9UJK0 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TSR3Q9UJK0 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TSR3Q9UJK0 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TSR3Q9UJK0 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TSR3Q9UJK0 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TSR3Q9UJK0 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TSR3Q9UJK0 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TSR3Q9UJK0 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TSR3Q9UJK0 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TSR3Q9UJK0 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TSR3Q9UJK0 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TSR3Q9UJK0 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TSR3Q9UJK0 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TSR3Q9UJK0 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TSR3Q9UJK0 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TSR3Q9UJK0 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TSR3Q9UJK0 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TSR3Q9UJK0 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TSR3Q9UJK0 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TSR3Q9UJK0 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TSR3Q9UJK0 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TSR3Q9UJK0 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TSR3Q9UJK0 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TSR3Q9UJK0 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TSR3Q9UJK0 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
TSR3Q9UJK0 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TSR3Q9UJK0 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TSR3Q9UJK0 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TSR3Q9UJK0 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TSR3Q9UJK0 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TSR3Q9UJK0 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TSR3Q9UJK0 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TSR3Q9UJK0 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TSR3Q9UJK0 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms