Protein–RNA interactions for Protein: Q9UIK5

TMEFF2, Tomoregulin-2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 374 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEFF2Q9UIK5 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TMEFF2Q9UIK5 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TMEFF2Q9UIK5 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TMEFF2Q9UIK5 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TMEFF2Q9UIK5 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TMEFF2Q9UIK5 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TMEFF2Q9UIK5 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TMEFF2Q9UIK5 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TMEFF2Q9UIK5 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
TMEFF2Q9UIK5 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TMEFF2Q9UIK5 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TMEFF2Q9UIK5 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TMEFF2Q9UIK5 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TMEFF2Q9UIK5 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
TMEFF2Q9UIK5 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TMEFF2Q9UIK5 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TMEFF2Q9UIK5 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
TMEFF2Q9UIK5 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
TMEFF2Q9UIK5 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
TMEFF2Q9UIK5 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TMEFF2Q9UIK5 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TMEFF2Q9UIK5 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TMEFF2Q9UIK5 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
TMEFF2Q9UIK5 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TMEFF2Q9UIK5 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
TMEFF2Q9UIK5 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
TMEFF2Q9UIK5 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TMEFF2Q9UIK5 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
TMEFF2Q9UIK5 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TMEFF2Q9UIK5 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TMEFF2Q9UIK5 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TMEFF2Q9UIK5 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TMEFF2Q9UIK5 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TMEFF2Q9UIK5 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TMEFF2Q9UIK5 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
TMEFF2Q9UIK5 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
TMEFF2Q9UIK5 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TMEFF2Q9UIK5 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TMEFF2Q9UIK5 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TMEFF2Q9UIK5 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TMEFF2Q9UIK5 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TMEFF2Q9UIK5 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TMEFF2Q9UIK5 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
TMEFF2Q9UIK5 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TMEFF2Q9UIK5 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
TMEFF2Q9UIK5 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
TMEFF2Q9UIK5 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
TMEFF2Q9UIK5 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
TMEFF2Q9UIK5 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
TMEFF2Q9UIK5 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
TMEFF2Q9UIK5 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
TMEFF2Q9UIK5 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
TMEFF2Q9UIK5 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
TMEFF2Q9UIK5 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
TMEFF2Q9UIK5 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
TMEFF2Q9UIK5 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
TMEFF2Q9UIK5 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
TMEFF2Q9UIK5 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TMEFF2Q9UIK5 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TMEFF2Q9UIK5 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
TMEFF2Q9UIK5 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TMEFF2Q9UIK5 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TMEFF2Q9UIK5 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TMEFF2Q9UIK5 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
TMEFF2Q9UIK5 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
TMEFF2Q9UIK5 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TMEFF2Q9UIK5 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
TMEFF2Q9UIK5 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TMEFF2Q9UIK5 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TMEFF2Q9UIK5 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TMEFF2Q9UIK5 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TMEFF2Q9UIK5 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TMEFF2Q9UIK5 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TMEFF2Q9UIK5 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TMEFF2Q9UIK5 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TMEFF2Q9UIK5 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TMEFF2Q9UIK5 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TMEFF2Q9UIK5 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
TMEFF2Q9UIK5 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
TMEFF2Q9UIK5 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TMEFF2Q9UIK5 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TMEFF2Q9UIK5 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TMEFF2Q9UIK5 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TMEFF2Q9UIK5 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TMEFF2Q9UIK5 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
TMEFF2Q9UIK5 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
TMEFF2Q9UIK5 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
TMEFF2Q9UIK5 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
TMEFF2Q9UIK5 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TMEFF2Q9UIK5 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TMEFF2Q9UIK5 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TMEFF2Q9UIK5 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TMEFF2Q9UIK5 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TMEFF2Q9UIK5 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TMEFF2Q9UIK5 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
TMEFF2Q9UIK5 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TMEFF2Q9UIK5 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TMEFF2Q9UIK5 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TMEFF2Q9UIK5 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TMEFF2Q9UIK5 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 92.1 ms