Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHX1

PUF60, Poly(U)-binding-splicing factor PUF60, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PUF60Q9UHX1 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PUF60Q9UHX1 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PUF60Q9UHX1 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PUF60Q9UHX1 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
PUF60Q9UHX1 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
PUF60Q9UHX1 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PUF60Q9UHX1 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PUF60Q9UHX1 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PUF60Q9UHX1 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PUF60Q9UHX1 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
PUF60Q9UHX1 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PUF60Q9UHX1 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PUF60Q9UHX1 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PUF60Q9UHX1 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PUF60Q9UHX1 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PUF60Q9UHX1 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PUF60Q9UHX1 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
PUF60Q9UHX1 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
PUF60Q9UHX1 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PUF60Q9UHX1 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PUF60Q9UHX1 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PUF60Q9UHX1 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PUF60Q9UHX1 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PUF60Q9UHX1 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PUF60Q9UHX1 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PUF60Q9UHX1 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PUF60Q9UHX1 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PUF60Q9UHX1 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
PUF60Q9UHX1 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PUF60Q9UHX1 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PUF60Q9UHX1 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
PUF60Q9UHX1 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
PUF60Q9UHX1 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
PUF60Q9UHX1 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
PUF60Q9UHX1 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PUF60Q9UHX1 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PUF60Q9UHX1 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PUF60Q9UHX1 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PUF60Q9UHX1 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PUF60Q9UHX1 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PUF60Q9UHX1 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PUF60Q9UHX1 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PUF60Q9UHX1 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PUF60Q9UHX1 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PUF60Q9UHX1 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PUF60Q9UHX1 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PUF60Q9UHX1 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
PUF60Q9UHX1 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PUF60Q9UHX1 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PUF60Q9UHX1 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PUF60Q9UHX1 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PUF60Q9UHX1 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PUF60Q9UHX1 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
PUF60Q9UHX1 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
PUF60Q9UHX1 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PUF60Q9UHX1 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
PUF60Q9UHX1 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
PUF60Q9UHX1 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
PUF60Q9UHX1 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
PUF60Q9UHX1 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
PUF60Q9UHX1 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
PUF60Q9UHX1 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
PUF60Q9UHX1 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
PUF60Q9UHX1 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
PUF60Q9UHX1 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
PUF60Q9UHX1 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PUF60Q9UHX1 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PUF60Q9UHX1 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PUF60Q9UHX1 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PUF60Q9UHX1 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PUF60Q9UHX1 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PUF60Q9UHX1 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PUF60Q9UHX1 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PUF60Q9UHX1 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PUF60Q9UHX1 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PUF60Q9UHX1 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PUF60Q9UHX1 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PUF60Q9UHX1 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PUF60Q9UHX1 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PUF60Q9UHX1 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PUF60Q9UHX1 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PUF60Q9UHX1 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PUF60Q9UHX1 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PUF60Q9UHX1 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PUF60Q9UHX1 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PUF60Q9UHX1 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PUF60Q9UHX1 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PUF60Q9UHX1 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PUF60Q9UHX1 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PUF60Q9UHX1 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PUF60Q9UHX1 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PUF60Q9UHX1 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PUF60Q9UHX1 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PUF60Q9UHX1 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PUF60Q9UHX1 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PUF60Q9UHX1 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PUF60Q9UHX1 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PUF60Q9UHX1 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PUF60Q9UHX1 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
PUF60Q9UHX1 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.4 ms