Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHW5

GPN3, GPN-loop GTPase 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 284 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPN3Q9UHW5 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
GPN3Q9UHW5 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
GPN3Q9UHW5 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
GPN3Q9UHW5 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
GPN3Q9UHW5 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
GPN3Q9UHW5 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
GPN3Q9UHW5 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
GPN3Q9UHW5 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
GPN3Q9UHW5 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
GPN3Q9UHW5 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
GPN3Q9UHW5 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
GPN3Q9UHW5 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
GPN3Q9UHW5 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
GPN3Q9UHW5 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
GPN3Q9UHW5 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
GPN3Q9UHW5 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
GPN3Q9UHW5 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GPN3Q9UHW5 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GPN3Q9UHW5 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
GPN3Q9UHW5 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GPN3Q9UHW5 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
GPN3Q9UHW5 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GPN3Q9UHW5 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GPN3Q9UHW5 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GPN3Q9UHW5 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GPN3Q9UHW5 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
GPN3Q9UHW5 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GPN3Q9UHW5 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
GPN3Q9UHW5 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GPN3Q9UHW5 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
GPN3Q9UHW5 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GPN3Q9UHW5 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
GPN3Q9UHW5 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
GPN3Q9UHW5 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
GPN3Q9UHW5 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
GPN3Q9UHW5 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
GPN3Q9UHW5 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC21.58■■□□□ 1.05
GPN3Q9UHW5 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
GPN3Q9UHW5 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
GPN3Q9UHW5 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
GPN3Q9UHW5 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
GPN3Q9UHW5 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
GPN3Q9UHW5 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
GPN3Q9UHW5 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
GPN3Q9UHW5 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
GPN3Q9UHW5 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
GPN3Q9UHW5 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GPN3Q9UHW5 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
GPN3Q9UHW5 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GPN3Q9UHW5 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
GPN3Q9UHW5 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
GPN3Q9UHW5 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GPN3Q9UHW5 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GPN3Q9UHW5 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GPN3Q9UHW5 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GPN3Q9UHW5 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
GPN3Q9UHW5 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
GPN3Q9UHW5 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
GPN3Q9UHW5 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
GPN3Q9UHW5 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
GPN3Q9UHW5 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
GPN3Q9UHW5 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
GPN3Q9UHW5 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GPN3Q9UHW5 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GPN3Q9UHW5 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GPN3Q9UHW5 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
GPN3Q9UHW5 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
GPN3Q9UHW5 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
GPN3Q9UHW5 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GPN3Q9UHW5 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GPN3Q9UHW5 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
GPN3Q9UHW5 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GPN3Q9UHW5 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
GPN3Q9UHW5 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
GPN3Q9UHW5 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
GPN3Q9UHW5 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
GPN3Q9UHW5 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
GPN3Q9UHW5 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
GPN3Q9UHW5 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
GPN3Q9UHW5 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
GPN3Q9UHW5 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
GPN3Q9UHW5 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
GPN3Q9UHW5 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
GPN3Q9UHW5 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
GPN3Q9UHW5 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
GPN3Q9UHW5 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
GPN3Q9UHW5 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
GPN3Q9UHW5 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
GPN3Q9UHW5 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
GPN3Q9UHW5 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
GPN3Q9UHW5 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
GPN3Q9UHW5 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
GPN3Q9UHW5 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
GPN3Q9UHW5 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
GPN3Q9UHW5 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
GPN3Q9UHW5 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
GPN3Q9UHW5 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC21.52■■□□□ 1.04
GPN3Q9UHW5 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
GPN3Q9UHW5 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
GPN3Q9UHW5 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 180.8 ms