Protein–RNA interactions for Protein: Q9UH73

EBF1, Transcription factor COE1, humanhuman

Predictions only

Length 591 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EBF1Q9UH73 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
EBF1Q9UH73 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
EBF1Q9UH73 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
EBF1Q9UH73 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
EBF1Q9UH73 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
EBF1Q9UH73 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
EBF1Q9UH73 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
EBF1Q9UH73 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC23.33■■□□□ 1.32
EBF1Q9UH73 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
EBF1Q9UH73 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
EBF1Q9UH73 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
EBF1Q9UH73 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
EBF1Q9UH73 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC23.32■■□□□ 1.32
EBF1Q9UH73 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
EBF1Q9UH73 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
EBF1Q9UH73 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
EBF1Q9UH73 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
EBF1Q9UH73 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
EBF1Q9UH73 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
EBF1Q9UH73 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
EBF1Q9UH73 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
EBF1Q9UH73 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
EBF1Q9UH73 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
EBF1Q9UH73 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
EBF1Q9UH73 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
EBF1Q9UH73 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
EBF1Q9UH73 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
EBF1Q9UH73 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
EBF1Q9UH73 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
EBF1Q9UH73 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
EBF1Q9UH73 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
EBF1Q9UH73 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
EBF1Q9UH73 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
EBF1Q9UH73 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
EBF1Q9UH73 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
EBF1Q9UH73 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
EBF1Q9UH73 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
EBF1Q9UH73 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
EBF1Q9UH73 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
EBF1Q9UH73 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC23.28■■□□□ 1.32
EBF1Q9UH73 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
EBF1Q9UH73 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
EBF1Q9UH73 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
EBF1Q9UH73 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
EBF1Q9UH73 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
EBF1Q9UH73 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
EBF1Q9UH73 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
EBF1Q9UH73 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
EBF1Q9UH73 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
EBF1Q9UH73 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
EBF1Q9UH73 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
EBF1Q9UH73 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
EBF1Q9UH73 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
EBF1Q9UH73 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
EBF1Q9UH73 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
EBF1Q9UH73 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
EBF1Q9UH73 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
EBF1Q9UH73 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
EBF1Q9UH73 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
EBF1Q9UH73 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
EBF1Q9UH73 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
EBF1Q9UH73 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
EBF1Q9UH73 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
EBF1Q9UH73 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
EBF1Q9UH73 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
EBF1Q9UH73 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
EBF1Q9UH73 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
EBF1Q9UH73 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
EBF1Q9UH73 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
EBF1Q9UH73 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
EBF1Q9UH73 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
EBF1Q9UH73 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
EBF1Q9UH73 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
EBF1Q9UH73 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
EBF1Q9UH73 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
EBF1Q9UH73 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
EBF1Q9UH73 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
EBF1Q9UH73 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
EBF1Q9UH73 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
EBF1Q9UH73 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
EBF1Q9UH73 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
EBF1Q9UH73 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
EBF1Q9UH73 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
EBF1Q9UH73 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
EBF1Q9UH73 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC23.23■■□□□ 1.31
EBF1Q9UH73 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
EBF1Q9UH73 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
EBF1Q9UH73 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
EBF1Q9UH73 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
EBF1Q9UH73 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
EBF1Q9UH73 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
EBF1Q9UH73 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
EBF1Q9UH73 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
EBF1Q9UH73 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
EBF1Q9UH73 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
EBF1Q9UH73 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
EBF1Q9UH73 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
EBF1Q9UH73 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
EBF1Q9UH73 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
EBF1Q9UH73 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.3 ms