Protein–RNA interactions for Protein: Q9UH03

SEPT3, Neuronal-specific septin-3, humanhuman

Predictions only

Length 358 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEPT3Q9UH03 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
SEPT3Q9UH03 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
SEPT3Q9UH03 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SEPT3Q9UH03 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SEPT3Q9UH03 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SEPT3Q9UH03 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SEPT3Q9UH03 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SEPT3Q9UH03 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SEPT3Q9UH03 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SEPT3Q9UH03 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SEPT3Q9UH03 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SEPT3Q9UH03 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SEPT3Q9UH03 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SEPT3Q9UH03 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
SEPT3Q9UH03 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
SEPT3Q9UH03 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SEPT3Q9UH03 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
SEPT3Q9UH03 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SEPT3Q9UH03 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SEPT3Q9UH03 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SEPT3Q9UH03 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SEPT3Q9UH03 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SEPT3Q9UH03 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SEPT3Q9UH03 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SEPT3Q9UH03 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SEPT3Q9UH03 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SEPT3Q9UH03 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SEPT3Q9UH03 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SEPT3Q9UH03 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SEPT3Q9UH03 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SEPT3Q9UH03 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SEPT3Q9UH03 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SEPT3Q9UH03 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
SEPT3Q9UH03 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SEPT3Q9UH03 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SEPT3Q9UH03 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SEPT3Q9UH03 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SEPT3Q9UH03 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SEPT3Q9UH03 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SEPT3Q9UH03 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SEPT3Q9UH03 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SEPT3Q9UH03 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SEPT3Q9UH03 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SEPT3Q9UH03 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SEPT3Q9UH03 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SEPT3Q9UH03 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SEPT3Q9UH03 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SEPT3Q9UH03 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
SEPT3Q9UH03 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SEPT3Q9UH03 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SEPT3Q9UH03 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SEPT3Q9UH03 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SEPT3Q9UH03 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SEPT3Q9UH03 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SEPT3Q9UH03 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SEPT3Q9UH03 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SEPT3Q9UH03 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SEPT3Q9UH03 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SEPT3Q9UH03 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SEPT3Q9UH03 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SEPT3Q9UH03 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SEPT3Q9UH03 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SEPT3Q9UH03 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SEPT3Q9UH03 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SEPT3Q9UH03 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SEPT3Q9UH03 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SEPT3Q9UH03 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SEPT3Q9UH03 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
SEPT3Q9UH03 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
SEPT3Q9UH03 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SEPT3Q9UH03 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SEPT3Q9UH03 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SEPT3Q9UH03 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SEPT3Q9UH03 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SEPT3Q9UH03 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SEPT3Q9UH03 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SEPT3Q9UH03 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SEPT3Q9UH03 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SEPT3Q9UH03 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SEPT3Q9UH03 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SEPT3Q9UH03 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SEPT3Q9UH03 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SEPT3Q9UH03 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SEPT3Q9UH03 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
SEPT3Q9UH03 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SEPT3Q9UH03 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SEPT3Q9UH03 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SEPT3Q9UH03 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SEPT3Q9UH03 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SEPT3Q9UH03 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
SEPT3Q9UH03 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SEPT3Q9UH03 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SEPT3Q9UH03 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SEPT3Q9UH03 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SEPT3Q9UH03 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SEPT3Q9UH03 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SEPT3Q9UH03 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SEPT3Q9UH03 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SEPT3Q9UH03 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SEPT3Q9UH03 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16 ms