Protein–RNA interactions for Protein: Q9UGJ1

TUBGCP4, Gamma-tubulin complex component 4, humanhuman

Predictions only

Length 667 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBGCP4Q9UGJ1 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TUBGCP4Q9UGJ1 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TUBGCP4Q9UGJ1 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TUBGCP4Q9UGJ1 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TUBGCP4Q9UGJ1 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TUBGCP4Q9UGJ1 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TUBGCP4Q9UGJ1 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TUBGCP4Q9UGJ1 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TUBGCP4Q9UGJ1 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TUBGCP4Q9UGJ1 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
TUBGCP4Q9UGJ1 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TUBGCP4Q9UGJ1 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TUBGCP4Q9UGJ1 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TUBGCP4Q9UGJ1 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TUBGCP4Q9UGJ1 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TUBGCP4Q9UGJ1 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TUBGCP4Q9UGJ1 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TUBGCP4Q9UGJ1 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
TUBGCP4Q9UGJ1 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TUBGCP4Q9UGJ1 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TUBGCP4Q9UGJ1 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TUBGCP4Q9UGJ1 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TUBGCP4Q9UGJ1 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TUBGCP4Q9UGJ1 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TUBGCP4Q9UGJ1 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TUBGCP4Q9UGJ1 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TUBGCP4Q9UGJ1 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TUBGCP4Q9UGJ1 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TUBGCP4Q9UGJ1 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TUBGCP4Q9UGJ1 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TUBGCP4Q9UGJ1 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TUBGCP4Q9UGJ1 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
TUBGCP4Q9UGJ1 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TUBGCP4Q9UGJ1 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TUBGCP4Q9UGJ1 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TUBGCP4Q9UGJ1 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TUBGCP4Q9UGJ1 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TUBGCP4Q9UGJ1 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TUBGCP4Q9UGJ1 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TUBGCP4Q9UGJ1 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TUBGCP4Q9UGJ1 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TUBGCP4Q9UGJ1 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TUBGCP4Q9UGJ1 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TUBGCP4Q9UGJ1 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TUBGCP4Q9UGJ1 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TUBGCP4Q9UGJ1 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TUBGCP4Q9UGJ1 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TUBGCP4Q9UGJ1 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TUBGCP4Q9UGJ1 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TUBGCP4Q9UGJ1 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TUBGCP4Q9UGJ1 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TUBGCP4Q9UGJ1 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TUBGCP4Q9UGJ1 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TUBGCP4Q9UGJ1 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TUBGCP4Q9UGJ1 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TUBGCP4Q9UGJ1 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TUBGCP4Q9UGJ1 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TUBGCP4Q9UGJ1 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TUBGCP4Q9UGJ1 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TUBGCP4Q9UGJ1 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TUBGCP4Q9UGJ1 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TUBGCP4Q9UGJ1 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
TUBGCP4Q9UGJ1 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TUBGCP4Q9UGJ1 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TUBGCP4Q9UGJ1 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
TUBGCP4Q9UGJ1 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TUBGCP4Q9UGJ1 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TUBGCP4Q9UGJ1 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
TUBGCP4Q9UGJ1 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
TUBGCP4Q9UGJ1 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TUBGCP4Q9UGJ1 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TUBGCP4Q9UGJ1 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
TUBGCP4Q9UGJ1 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC24.64■■□□□ 1.54
TUBGCP4Q9UGJ1 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
TUBGCP4Q9UGJ1 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
TUBGCP4Q9UGJ1 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
TUBGCP4Q9UGJ1 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
TUBGCP4Q9UGJ1 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
TUBGCP4Q9UGJ1 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
TUBGCP4Q9UGJ1 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
TUBGCP4Q9UGJ1 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
TUBGCP4Q9UGJ1 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
TUBGCP4Q9UGJ1 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TUBGCP4Q9UGJ1 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TUBGCP4Q9UGJ1 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
TUBGCP4Q9UGJ1 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TUBGCP4Q9UGJ1 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TUBGCP4Q9UGJ1 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TUBGCP4Q9UGJ1 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TUBGCP4Q9UGJ1 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TUBGCP4Q9UGJ1 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TUBGCP4Q9UGJ1 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
TUBGCP4Q9UGJ1 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TUBGCP4Q9UGJ1 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TUBGCP4Q9UGJ1 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TUBGCP4Q9UGJ1 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TUBGCP4Q9UGJ1 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TUBGCP4Q9UGJ1 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TUBGCP4Q9UGJ1 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TUBGCP4Q9UGJ1 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms