Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBY0

SLC9A2, Sodium/hydrogen exchanger 2, humanhuman

Predictions only

Length 812 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC9A2Q9UBY0 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SLC9A2Q9UBY0 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SLC9A2Q9UBY0 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SLC9A2Q9UBY0 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SLC9A2Q9UBY0 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SLC9A2Q9UBY0 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SLC9A2Q9UBY0 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SLC9A2Q9UBY0 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
SLC9A2Q9UBY0 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SLC9A2Q9UBY0 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SLC9A2Q9UBY0 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SLC9A2Q9UBY0 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SLC9A2Q9UBY0 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SLC9A2Q9UBY0 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SLC9A2Q9UBY0 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SLC9A2Q9UBY0 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SLC9A2Q9UBY0 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SLC9A2Q9UBY0 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SLC9A2Q9UBY0 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
SLC9A2Q9UBY0 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
SLC9A2Q9UBY0 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SLC9A2Q9UBY0 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SLC9A2Q9UBY0 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SLC9A2Q9UBY0 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
SLC9A2Q9UBY0 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SLC9A2Q9UBY0 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SLC9A2Q9UBY0 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SLC9A2Q9UBY0 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SLC9A2Q9UBY0 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
SLC9A2Q9UBY0 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
SLC9A2Q9UBY0 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
SLC9A2Q9UBY0 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
SLC9A2Q9UBY0 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
SLC9A2Q9UBY0 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
SLC9A2Q9UBY0 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
SLC9A2Q9UBY0 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
SLC9A2Q9UBY0 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SLC9A2Q9UBY0 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
SLC9A2Q9UBY0 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
SLC9A2Q9UBY0 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SLC9A2Q9UBY0 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SLC9A2Q9UBY0 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
SLC9A2Q9UBY0 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
SLC9A2Q9UBY0 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SLC9A2Q9UBY0 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
SLC9A2Q9UBY0 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SLC9A2Q9UBY0 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
SLC9A2Q9UBY0 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
SLC9A2Q9UBY0 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
SLC9A2Q9UBY0 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
SLC9A2Q9UBY0 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
SLC9A2Q9UBY0 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
SLC9A2Q9UBY0 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SLC9A2Q9UBY0 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
SLC9A2Q9UBY0 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SLC9A2Q9UBY0 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
SLC9A2Q9UBY0 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC25.67■■□□□ 1.7
SLC9A2Q9UBY0 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SLC9A2Q9UBY0 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
SLC9A2Q9UBY0 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC25.67■■□□□ 1.7
SLC9A2Q9UBY0 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SLC9A2Q9UBY0 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
SLC9A2Q9UBY0 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
SLC9A2Q9UBY0 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
SLC9A2Q9UBY0 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
SLC9A2Q9UBY0 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
SLC9A2Q9UBY0 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SLC9A2Q9UBY0 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
SLC9A2Q9UBY0 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SLC9A2Q9UBY0 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
SLC9A2Q9UBY0 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
SLC9A2Q9UBY0 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SLC9A2Q9UBY0 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SLC9A2Q9UBY0 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
SLC9A2Q9UBY0 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SLC9A2Q9UBY0 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SLC9A2Q9UBY0 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SLC9A2Q9UBY0 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SLC9A2Q9UBY0 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
SLC9A2Q9UBY0 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
SLC9A2Q9UBY0 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
SLC9A2Q9UBY0 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
SLC9A2Q9UBY0 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
SLC9A2Q9UBY0 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
SLC9A2Q9UBY0 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SLC9A2Q9UBY0 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SLC9A2Q9UBY0 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SLC9A2Q9UBY0 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SLC9A2Q9UBY0 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SLC9A2Q9UBY0 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
SLC9A2Q9UBY0 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SLC9A2Q9UBY0 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SLC9A2Q9UBY0 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SLC9A2Q9UBY0 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
SLC9A2Q9UBY0 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SLC9A2Q9UBY0 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
SLC9A2Q9UBY0 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SLC9A2Q9UBY0 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
SLC9A2Q9UBY0 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SLC9A2Q9UBY0 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.9 ms