Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBV8

PEF1, Peflin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 284 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PEF1Q9UBV8 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PEF1Q9UBV8 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PEF1Q9UBV8 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PEF1Q9UBV8 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PEF1Q9UBV8 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
PEF1Q9UBV8 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PEF1Q9UBV8 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PEF1Q9UBV8 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PEF1Q9UBV8 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
PEF1Q9UBV8 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PEF1Q9UBV8 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PEF1Q9UBV8 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PEF1Q9UBV8 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PEF1Q9UBV8 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PEF1Q9UBV8 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PEF1Q9UBV8 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PEF1Q9UBV8 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PEF1Q9UBV8 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PEF1Q9UBV8 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PEF1Q9UBV8 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PEF1Q9UBV8 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PEF1Q9UBV8 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PEF1Q9UBV8 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PEF1Q9UBV8 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PEF1Q9UBV8 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PEF1Q9UBV8 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PEF1Q9UBV8 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PEF1Q9UBV8 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PEF1Q9UBV8 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
PEF1Q9UBV8 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PEF1Q9UBV8 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PEF1Q9UBV8 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PEF1Q9UBV8 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PEF1Q9UBV8 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PEF1Q9UBV8 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
PEF1Q9UBV8 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
PEF1Q9UBV8 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
PEF1Q9UBV8 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PEF1Q9UBV8 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PEF1Q9UBV8 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PEF1Q9UBV8 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PEF1Q9UBV8 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PEF1Q9UBV8 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PEF1Q9UBV8 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PEF1Q9UBV8 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PEF1Q9UBV8 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PEF1Q9UBV8 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PEF1Q9UBV8 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PEF1Q9UBV8 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PEF1Q9UBV8 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PEF1Q9UBV8 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PEF1Q9UBV8 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PEF1Q9UBV8 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PEF1Q9UBV8 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PEF1Q9UBV8 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PEF1Q9UBV8 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
PEF1Q9UBV8 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PEF1Q9UBV8 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PEF1Q9UBV8 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PEF1Q9UBV8 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PEF1Q9UBV8 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
PEF1Q9UBV8 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
PEF1Q9UBV8 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PEF1Q9UBV8 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PEF1Q9UBV8 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PEF1Q9UBV8 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PEF1Q9UBV8 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PEF1Q9UBV8 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PEF1Q9UBV8 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PEF1Q9UBV8 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PEF1Q9UBV8 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PEF1Q9UBV8 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PEF1Q9UBV8 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PEF1Q9UBV8 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PEF1Q9UBV8 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PEF1Q9UBV8 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PEF1Q9UBV8 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PEF1Q9UBV8 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PEF1Q9UBV8 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PEF1Q9UBV8 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PEF1Q9UBV8 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PEF1Q9UBV8 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PEF1Q9UBV8 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PEF1Q9UBV8 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
PEF1Q9UBV8 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PEF1Q9UBV8 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
PEF1Q9UBV8 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
PEF1Q9UBV8 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PEF1Q9UBV8 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PEF1Q9UBV8 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PEF1Q9UBV8 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PEF1Q9UBV8 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PEF1Q9UBV8 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PEF1Q9UBV8 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
PEF1Q9UBV8 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PEF1Q9UBV8 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PEF1Q9UBV8 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PEF1Q9UBV8 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PEF1Q9UBV8 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PEF1Q9UBV8 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.6 ms