Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBQ5

EIF3K, Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit K, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 218 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EIF3KQ9UBQ5 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
EIF3KQ9UBQ5 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
EIF3KQ9UBQ5 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
EIF3KQ9UBQ5 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
EIF3KQ9UBQ5 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
EIF3KQ9UBQ5 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
EIF3KQ9UBQ5 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
EIF3KQ9UBQ5 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.84
EIF3KQ9UBQ5 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
EIF3KQ9UBQ5 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
EIF3KQ9UBQ5 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.84
EIF3KQ9UBQ5 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
EIF3KQ9UBQ5 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
EIF3KQ9UBQ5 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
EIF3KQ9UBQ5 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
EIF3KQ9UBQ5 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
EIF3KQ9UBQ5 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
EIF3KQ9UBQ5 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
EIF3KQ9UBQ5 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
EIF3KQ9UBQ5 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
EIF3KQ9UBQ5 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
EIF3KQ9UBQ5 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
EIF3KQ9UBQ5 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
EIF3KQ9UBQ5 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
EIF3KQ9UBQ5 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
EIF3KQ9UBQ5 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
EIF3KQ9UBQ5 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
EIF3KQ9UBQ5 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
EIF3KQ9UBQ5 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
EIF3KQ9UBQ5 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
EIF3KQ9UBQ5 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
EIF3KQ9UBQ5 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
EIF3KQ9UBQ5 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
EIF3KQ9UBQ5 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
EIF3KQ9UBQ5 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
EIF3KQ9UBQ5 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
EIF3KQ9UBQ5 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
EIF3KQ9UBQ5 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
EIF3KQ9UBQ5 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
EIF3KQ9UBQ5 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
EIF3KQ9UBQ5 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
EIF3KQ9UBQ5 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
EIF3KQ9UBQ5 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
EIF3KQ9UBQ5 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
EIF3KQ9UBQ5 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
EIF3KQ9UBQ5 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
EIF3KQ9UBQ5 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
EIF3KQ9UBQ5 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
EIF3KQ9UBQ5 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
EIF3KQ9UBQ5 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
EIF3KQ9UBQ5 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
EIF3KQ9UBQ5 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
EIF3KQ9UBQ5 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
EIF3KQ9UBQ5 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
EIF3KQ9UBQ5 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
EIF3KQ9UBQ5 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
EIF3KQ9UBQ5 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
EIF3KQ9UBQ5 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
EIF3KQ9UBQ5 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
EIF3KQ9UBQ5 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
EIF3KQ9UBQ5 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
EIF3KQ9UBQ5 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
EIF3KQ9UBQ5 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
EIF3KQ9UBQ5 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC20.27■□□□□ 0.83
EIF3KQ9UBQ5 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
EIF3KQ9UBQ5 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
EIF3KQ9UBQ5 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
EIF3KQ9UBQ5 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
EIF3KQ9UBQ5 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
EIF3KQ9UBQ5 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
EIF3KQ9UBQ5 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
EIF3KQ9UBQ5 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
EIF3KQ9UBQ5 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
EIF3KQ9UBQ5 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
EIF3KQ9UBQ5 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
EIF3KQ9UBQ5 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
EIF3KQ9UBQ5 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
EIF3KQ9UBQ5 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
EIF3KQ9UBQ5 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
EIF3KQ9UBQ5 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
EIF3KQ9UBQ5 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
EIF3KQ9UBQ5 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
EIF3KQ9UBQ5 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
EIF3KQ9UBQ5 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
EIF3KQ9UBQ5 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
EIF3KQ9UBQ5 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
EIF3KQ9UBQ5 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
EIF3KQ9UBQ5 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
EIF3KQ9UBQ5 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
EIF3KQ9UBQ5 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
EIF3KQ9UBQ5 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
EIF3KQ9UBQ5 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
EIF3KQ9UBQ5 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
EIF3KQ9UBQ5 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
EIF3KQ9UBQ5 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
EIF3KQ9UBQ5 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
EIF3KQ9UBQ5 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
EIF3KQ9UBQ5 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
EIF3KQ9UBQ5 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
EIF3KQ9UBQ5 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.8 ms