Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2E5

CHPF2, Chondroitin sulfate glucuronyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 772 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHPF2Q9P2E5 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
CHPF2Q9P2E5 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
CHPF2Q9P2E5 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
CHPF2Q9P2E5 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
CHPF2Q9P2E5 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
CHPF2Q9P2E5 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
CHPF2Q9P2E5 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
CHPF2Q9P2E5 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
CHPF2Q9P2E5 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
CHPF2Q9P2E5 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
CHPF2Q9P2E5 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
CHPF2Q9P2E5 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC29.32■■■□□ 2.28
CHPF2Q9P2E5 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
CHPF2Q9P2E5 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC29.32■■■□□ 2.28
CHPF2Q9P2E5 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
CHPF2Q9P2E5 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
CHPF2Q9P2E5 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
CHPF2Q9P2E5 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
CHPF2Q9P2E5 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
CHPF2Q9P2E5 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC29.31■■■□□ 2.28
CHPF2Q9P2E5 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
CHPF2Q9P2E5 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC29.3■■■□□ 2.28
CHPF2Q9P2E5 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
CHPF2Q9P2E5 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
CHPF2Q9P2E5 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
CHPF2Q9P2E5 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
CHPF2Q9P2E5 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
CHPF2Q9P2E5 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
CHPF2Q9P2E5 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
CHPF2Q9P2E5 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
CHPF2Q9P2E5 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
CHPF2Q9P2E5 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
CHPF2Q9P2E5 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
CHPF2Q9P2E5 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
CHPF2Q9P2E5 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
CHPF2Q9P2E5 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
CHPF2Q9P2E5 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
CHPF2Q9P2E5 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
CHPF2Q9P2E5 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.28
CHPF2Q9P2E5 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
CHPF2Q9P2E5 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
CHPF2Q9P2E5 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC29.26■■■□□ 2.27
CHPF2Q9P2E5 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
CHPF2Q9P2E5 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
CHPF2Q9P2E5 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
CHPF2Q9P2E5 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
CHPF2Q9P2E5 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
CHPF2Q9P2E5 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
CHPF2Q9P2E5 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
CHPF2Q9P2E5 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
CHPF2Q9P2E5 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
CHPF2Q9P2E5 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
CHPF2Q9P2E5 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
CHPF2Q9P2E5 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
CHPF2Q9P2E5 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
CHPF2Q9P2E5 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
CHPF2Q9P2E5 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
CHPF2Q9P2E5 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC29.24■■■□□ 2.27
CHPF2Q9P2E5 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
CHPF2Q9P2E5 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
CHPF2Q9P2E5 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
CHPF2Q9P2E5 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
CHPF2Q9P2E5 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
CHPF2Q9P2E5 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
CHPF2Q9P2E5 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC29.23■■■□□ 2.27
CHPF2Q9P2E5 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
CHPF2Q9P2E5 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
CHPF2Q9P2E5 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
CHPF2Q9P2E5 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
CHPF2Q9P2E5 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
CHPF2Q9P2E5 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
CHPF2Q9P2E5 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
CHPF2Q9P2E5 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
CHPF2Q9P2E5 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC29.22■■■□□ 2.27
CHPF2Q9P2E5 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
CHPF2Q9P2E5 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
CHPF2Q9P2E5 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
CHPF2Q9P2E5 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
CHPF2Q9P2E5 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
CHPF2Q9P2E5 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
CHPF2Q9P2E5 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
CHPF2Q9P2E5 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC29.2■■■□□ 2.27
CHPF2Q9P2E5 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
CHPF2Q9P2E5 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
CHPF2Q9P2E5 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
CHPF2Q9P2E5 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
CHPF2Q9P2E5 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
CHPF2Q9P2E5 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
CHPF2Q9P2E5 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
CHPF2Q9P2E5 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
CHPF2Q9P2E5 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
CHPF2Q9P2E5 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
CHPF2Q9P2E5 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
CHPF2Q9P2E5 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
CHPF2Q9P2E5 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
CHPF2Q9P2E5 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
CHPF2Q9P2E5 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
CHPF2Q9P2E5 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
CHPF2Q9P2E5 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
CHPF2Q9P2E5 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms