Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2B4

CTTNBP2NL, CTTNBP2 N-terminal-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 639 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTTNBP2NLQ9P2B4 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CTTNBP2NLQ9P2B4 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CTTNBP2NLQ9P2B4 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CTTNBP2NLQ9P2B4 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CTTNBP2NLQ9P2B4 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CTTNBP2NLQ9P2B4 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CTTNBP2NLQ9P2B4 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CTTNBP2NLQ9P2B4 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CTTNBP2NLQ9P2B4 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CTTNBP2NLQ9P2B4 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
CTTNBP2NLQ9P2B4 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
CTTNBP2NLQ9P2B4 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CTTNBP2NLQ9P2B4 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
CTTNBP2NLQ9P2B4 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CTTNBP2NLQ9P2B4 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CTTNBP2NLQ9P2B4 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CTTNBP2NLQ9P2B4 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CTTNBP2NLQ9P2B4 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CTTNBP2NLQ9P2B4 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CTTNBP2NLQ9P2B4 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CTTNBP2NLQ9P2B4 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CTTNBP2NLQ9P2B4 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CTTNBP2NLQ9P2B4 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
CTTNBP2NLQ9P2B4 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CTTNBP2NLQ9P2B4 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CTTNBP2NLQ9P2B4 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CTTNBP2NLQ9P2B4 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CTTNBP2NLQ9P2B4 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CTTNBP2NLQ9P2B4 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CTTNBP2NLQ9P2B4 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CTTNBP2NLQ9P2B4 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CTTNBP2NLQ9P2B4 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CTTNBP2NLQ9P2B4 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CTTNBP2NLQ9P2B4 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
CTTNBP2NLQ9P2B4 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CTTNBP2NLQ9P2B4 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CTTNBP2NLQ9P2B4 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CTTNBP2NLQ9P2B4 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
CTTNBP2NLQ9P2B4 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CTTNBP2NLQ9P2B4 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.47
CTTNBP2NLQ9P2B4 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.47
CTTNBP2NLQ9P2B4 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CTTNBP2NLQ9P2B4 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CTTNBP2NLQ9P2B4 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CTTNBP2NLQ9P2B4 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CTTNBP2NLQ9P2B4 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CTTNBP2NLQ9P2B4 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CTTNBP2NLQ9P2B4 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CTTNBP2NLQ9P2B4 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CTTNBP2NLQ9P2B4 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CTTNBP2NLQ9P2B4 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CTTNBP2NLQ9P2B4 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
CTTNBP2NLQ9P2B4 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
CTTNBP2NLQ9P2B4 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CTTNBP2NLQ9P2B4 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CTTNBP2NLQ9P2B4 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CTTNBP2NLQ9P2B4 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CTTNBP2NLQ9P2B4 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CTTNBP2NLQ9P2B4 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CTTNBP2NLQ9P2B4 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CTTNBP2NLQ9P2B4 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CTTNBP2NLQ9P2B4 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CTTNBP2NLQ9P2B4 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CTTNBP2NLQ9P2B4 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CTTNBP2NLQ9P2B4 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CTTNBP2NLQ9P2B4 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CTTNBP2NLQ9P2B4 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CTTNBP2NLQ9P2B4 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CTTNBP2NLQ9P2B4 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CTTNBP2NLQ9P2B4 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CTTNBP2NLQ9P2B4 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CTTNBP2NLQ9P2B4 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CTTNBP2NLQ9P2B4 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CTTNBP2NLQ9P2B4 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CTTNBP2NLQ9P2B4 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
CTTNBP2NLQ9P2B4 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CTTNBP2NLQ9P2B4 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CTTNBP2NLQ9P2B4 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CTTNBP2NLQ9P2B4 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CTTNBP2NLQ9P2B4 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CTTNBP2NLQ9P2B4 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CTTNBP2NLQ9P2B4 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CTTNBP2NLQ9P2B4 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CTTNBP2NLQ9P2B4 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CTTNBP2NLQ9P2B4 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
CTTNBP2NLQ9P2B4 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CTTNBP2NLQ9P2B4 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CTTNBP2NLQ9P2B4 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CTTNBP2NLQ9P2B4 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CTTNBP2NLQ9P2B4 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CTTNBP2NLQ9P2B4 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CTTNBP2NLQ9P2B4 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CTTNBP2NLQ9P2B4 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CTTNBP2NLQ9P2B4 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CTTNBP2NLQ9P2B4 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CTTNBP2NLQ9P2B4 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CTTNBP2NLQ9P2B4 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CTTNBP2NLQ9P2B4 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CTTNBP2NLQ9P2B4 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CTTNBP2NLQ9P2B4 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50 ms