Protein–RNA interactions for Protein: Q9P1Z3

HCN3, Potassium/sodium hyperpolarization-activated cyclic nucleotide-gated channel 3, humanhuman

Predictions only

Length 774 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HCN3Q9P1Z3 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
HCN3Q9P1Z3 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
HCN3Q9P1Z3 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
HCN3Q9P1Z3 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
HCN3Q9P1Z3 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
HCN3Q9P1Z3 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
HCN3Q9P1Z3 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
HCN3Q9P1Z3 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
HCN3Q9P1Z3 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
HCN3Q9P1Z3 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
HCN3Q9P1Z3 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
HCN3Q9P1Z3 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
HCN3Q9P1Z3 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
HCN3Q9P1Z3 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
HCN3Q9P1Z3 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
HCN3Q9P1Z3 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
HCN3Q9P1Z3 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
HCN3Q9P1Z3 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
HCN3Q9P1Z3 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
HCN3Q9P1Z3 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
HCN3Q9P1Z3 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
HCN3Q9P1Z3 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
HCN3Q9P1Z3 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
HCN3Q9P1Z3 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
HCN3Q9P1Z3 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
HCN3Q9P1Z3 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
HCN3Q9P1Z3 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.07
HCN3Q9P1Z3 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
HCN3Q9P1Z3 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
HCN3Q9P1Z3 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
HCN3Q9P1Z3 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
HCN3Q9P1Z3 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
HCN3Q9P1Z3 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
HCN3Q9P1Z3 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
HCN3Q9P1Z3 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
HCN3Q9P1Z3 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
HCN3Q9P1Z3 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
HCN3Q9P1Z3 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
HCN3Q9P1Z3 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
HCN3Q9P1Z3 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
HCN3Q9P1Z3 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
HCN3Q9P1Z3 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
HCN3Q9P1Z3 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
HCN3Q9P1Z3 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
HCN3Q9P1Z3 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
HCN3Q9P1Z3 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
HCN3Q9P1Z3 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
HCN3Q9P1Z3 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
HCN3Q9P1Z3 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
HCN3Q9P1Z3 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
HCN3Q9P1Z3 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
HCN3Q9P1Z3 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
HCN3Q9P1Z3 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
HCN3Q9P1Z3 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
HCN3Q9P1Z3 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
HCN3Q9P1Z3 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
HCN3Q9P1Z3 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
HCN3Q9P1Z3 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
HCN3Q9P1Z3 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
HCN3Q9P1Z3 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
HCN3Q9P1Z3 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
HCN3Q9P1Z3 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
HCN3Q9P1Z3 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
HCN3Q9P1Z3 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
HCN3Q9P1Z3 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
HCN3Q9P1Z3 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
HCN3Q9P1Z3 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
HCN3Q9P1Z3 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
HCN3Q9P1Z3 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
HCN3Q9P1Z3 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
HCN3Q9P1Z3 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
HCN3Q9P1Z3 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
HCN3Q9P1Z3 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
HCN3Q9P1Z3 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
HCN3Q9P1Z3 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
HCN3Q9P1Z3 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
HCN3Q9P1Z3 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
HCN3Q9P1Z3 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC21.64■■□□□ 1.06
HCN3Q9P1Z3 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
HCN3Q9P1Z3 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
HCN3Q9P1Z3 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
HCN3Q9P1Z3 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
HCN3Q9P1Z3 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
HCN3Q9P1Z3 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
HCN3Q9P1Z3 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
HCN3Q9P1Z3 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
HCN3Q9P1Z3 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
HCN3Q9P1Z3 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
HCN3Q9P1Z3 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
HCN3Q9P1Z3 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
HCN3Q9P1Z3 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
HCN3Q9P1Z3 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
HCN3Q9P1Z3 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
HCN3Q9P1Z3 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
HCN3Q9P1Z3 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
HCN3Q9P1Z3 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
HCN3Q9P1Z3 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
HCN3Q9P1Z3 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
HCN3Q9P1Z3 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
HCN3Q9P1Z3 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms