Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0L0

VAPA, Vesicle-associated membrane protein-associated protein A, humanhuman

Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAPAQ9P0L0 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
VAPAQ9P0L0 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
VAPAQ9P0L0 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
VAPAQ9P0L0 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
VAPAQ9P0L0 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
VAPAQ9P0L0 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
VAPAQ9P0L0 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
VAPAQ9P0L0 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
VAPAQ9P0L0 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
VAPAQ9P0L0 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
VAPAQ9P0L0 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
VAPAQ9P0L0 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
VAPAQ9P0L0 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
VAPAQ9P0L0 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
VAPAQ9P0L0 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
VAPAQ9P0L0 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
VAPAQ9P0L0 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
VAPAQ9P0L0 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
VAPAQ9P0L0 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
VAPAQ9P0L0 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
VAPAQ9P0L0 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
VAPAQ9P0L0 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
VAPAQ9P0L0 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
VAPAQ9P0L0 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
VAPAQ9P0L0 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
VAPAQ9P0L0 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
VAPAQ9P0L0 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
VAPAQ9P0L0 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
VAPAQ9P0L0 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
VAPAQ9P0L0 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
VAPAQ9P0L0 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
VAPAQ9P0L0 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
VAPAQ9P0L0 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
VAPAQ9P0L0 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
VAPAQ9P0L0 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
VAPAQ9P0L0 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
VAPAQ9P0L0 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
VAPAQ9P0L0 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
VAPAQ9P0L0 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
VAPAQ9P0L0 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
VAPAQ9P0L0 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
VAPAQ9P0L0 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
VAPAQ9P0L0 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
VAPAQ9P0L0 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
VAPAQ9P0L0 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
VAPAQ9P0L0 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
VAPAQ9P0L0 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
VAPAQ9P0L0 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
VAPAQ9P0L0 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
VAPAQ9P0L0 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
VAPAQ9P0L0 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
VAPAQ9P0L0 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
VAPAQ9P0L0 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
VAPAQ9P0L0 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
VAPAQ9P0L0 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
VAPAQ9P0L0 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
VAPAQ9P0L0 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
VAPAQ9P0L0 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
VAPAQ9P0L0 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
VAPAQ9P0L0 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
VAPAQ9P0L0 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
VAPAQ9P0L0 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
VAPAQ9P0L0 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
VAPAQ9P0L0 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
VAPAQ9P0L0 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
VAPAQ9P0L0 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
VAPAQ9P0L0 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
VAPAQ9P0L0 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
VAPAQ9P0L0 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
VAPAQ9P0L0 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
VAPAQ9P0L0 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
VAPAQ9P0L0 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
VAPAQ9P0L0 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
VAPAQ9P0L0 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
VAPAQ9P0L0 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
VAPAQ9P0L0 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
VAPAQ9P0L0 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
VAPAQ9P0L0 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
VAPAQ9P0L0 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
VAPAQ9P0L0 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
VAPAQ9P0L0 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
VAPAQ9P0L0 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
VAPAQ9P0L0 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
VAPAQ9P0L0 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
VAPAQ9P0L0 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
VAPAQ9P0L0 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
VAPAQ9P0L0 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
VAPAQ9P0L0 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
VAPAQ9P0L0 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
VAPAQ9P0L0 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
VAPAQ9P0L0 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
VAPAQ9P0L0 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
VAPAQ9P0L0 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
VAPAQ9P0L0 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
VAPAQ9P0L0 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
VAPAQ9P0L0 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
VAPAQ9P0L0 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
VAPAQ9P0L0 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.04
VAPAQ9P0L0 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
VAPAQ9P0L0 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.4 ms