Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0J1

PDP1, [Pyruvate dehydrogenase [acetyl-transferring]]-phosphatase 1, mitochondrial, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 537 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDP1Q9P0J1 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PDP1Q9P0J1 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PDP1Q9P0J1 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PDP1Q9P0J1 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PDP1Q9P0J1 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PDP1Q9P0J1 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PDP1Q9P0J1 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PDP1Q9P0J1 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PDP1Q9P0J1 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PDP1Q9P0J1 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PDP1Q9P0J1 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PDP1Q9P0J1 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PDP1Q9P0J1 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PDP1Q9P0J1 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PDP1Q9P0J1 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PDP1Q9P0J1 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
PDP1Q9P0J1 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PDP1Q9P0J1 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
PDP1Q9P0J1 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
PDP1Q9P0J1 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
PDP1Q9P0J1 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
PDP1Q9P0J1 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
PDP1Q9P0J1 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
PDP1Q9P0J1 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
PDP1Q9P0J1 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
PDP1Q9P0J1 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PDP1Q9P0J1 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
PDP1Q9P0J1 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
PDP1Q9P0J1 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PDP1Q9P0J1 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PDP1Q9P0J1 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
PDP1Q9P0J1 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PDP1Q9P0J1 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PDP1Q9P0J1 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PDP1Q9P0J1 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PDP1Q9P0J1 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PDP1Q9P0J1 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
PDP1Q9P0J1 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PDP1Q9P0J1 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PDP1Q9P0J1 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PDP1Q9P0J1 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PDP1Q9P0J1 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PDP1Q9P0J1 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PDP1Q9P0J1 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PDP1Q9P0J1 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PDP1Q9P0J1 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PDP1Q9P0J1 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PDP1Q9P0J1 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PDP1Q9P0J1 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PDP1Q9P0J1 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PDP1Q9P0J1 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PDP1Q9P0J1 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PDP1Q9P0J1 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PDP1Q9P0J1 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PDP1Q9P0J1 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PDP1Q9P0J1 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PDP1Q9P0J1 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PDP1Q9P0J1 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PDP1Q9P0J1 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PDP1Q9P0J1 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PDP1Q9P0J1 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PDP1Q9P0J1 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PDP1Q9P0J1 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PDP1Q9P0J1 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PDP1Q9P0J1 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PDP1Q9P0J1 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PDP1Q9P0J1 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PDP1Q9P0J1 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PDP1Q9P0J1 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PDP1Q9P0J1 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
PDP1Q9P0J1 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PDP1Q9P0J1 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PDP1Q9P0J1 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PDP1Q9P0J1 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PDP1Q9P0J1 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PDP1Q9P0J1 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PDP1Q9P0J1 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PDP1Q9P0J1 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PDP1Q9P0J1 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PDP1Q9P0J1 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PDP1Q9P0J1 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PDP1Q9P0J1 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
PDP1Q9P0J1 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
PDP1Q9P0J1 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PDP1Q9P0J1 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PDP1Q9P0J1 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PDP1Q9P0J1 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PDP1Q9P0J1 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PDP1Q9P0J1 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PDP1Q9P0J1 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PDP1Q9P0J1 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PDP1Q9P0J1 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
PDP1Q9P0J1 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
PDP1Q9P0J1 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
PDP1Q9P0J1 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PDP1Q9P0J1 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PDP1Q9P0J1 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PDP1Q9P0J1 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PDP1Q9P0J1 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PDP1Q9P0J1 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.2 ms